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研究将废水中的病毒基因变异与社区传播联系起来
大学研究人员的研究结果发表在《科学》杂志上，可能会改变公共卫生官员监测和检测多种传染病的方式。这篇文章将废水中的病毒遗传变异与社区传播联系起来，首先发表在《今日雪城大学》上。
来源:雪城大学Maxwell 博士后学者 Dustin Hill、公共卫生教授 Dave Larsen 和一组研究人员在《Science》杂志上发表的新研究发现，COVID-19 病毒遗传变异的流行与较高的社区传播之间存在密切联系。
通过检测废水来检测社区中的病毒是一种行之有效的科学实践。但了解疾病的流行情况始终面临着挑战，科学依赖于病毒载量的绝对数量和浓度，发现做出不准确的假设。
该团队包括来自纽约州立大学上州医科大学、纽约州立大学环境科学与林业学院和纽约州卫生部的同事，仔细研究了在 COVID-19 紧急情况期间收集的废水监测的现有数据和基因组，通过病毒基因组中微小的、不显着的变化来测量遗传变异，并将其与传播水平进行比较。
简单来说：他们发现废水中的病毒物质变异越多，感染的人就越多。
“当病毒多样性增加时，感染率不仅会上升，而且随着多样性的下降，感染率也会下降，”该研究的主要作者 Hill 说。 “我们测试了三种不同的方法来测量废水中病毒基因组的多样性，所有三种方法都以极高的统计能力预测感染。”
虽然该研究分析了 COVID-19，但这种联系可能会改变废水监测的使用方式，不仅用于检测，还用于测量疾病传播，从而对监测其他疾病（包括流感、麻疹、脊髓灰质炎和未来可能出现的病毒）产生影响。
“这些发现开辟了遗传流行病学的新探索领域，”拉森说。 “我们现在将能够根据测序数据估计传播情况，这在以前是不可能的。