RNA-Seq: Principles, Workflow, Data Analysis, and Applications in Transcriptomics
RNA测序,通常称为RNA-seq,是一种用于研究转录组的高通量测序方法。转录组包括在细胞、组织、生物体或生物条件中表达的 RNA 分子......后《RNA-Seq:转录组学中的原理、工作流程、数据分析和应用》首先出现在《科学笔记》上。
Transcriptomic Insights Into the Evolution of Snake Venom: Mechanisms, Diversity, and Adaptation
蛇毒进化的转录组学见解:机制、多样性和适应摘要蛇毒是进化完善的生化武器库,由多种毒素组成,在捕食、防御和竞争中具有复杂的功能作用。在过去的 20 年里,转录组学方法通过高分辨率洞察基因表达动态、分子多样性以及驱动毒液跨谱系变异的进化机制,改变了毒液研究。在这篇综述中,我们对蛇毒转录组学文献进行了全面的综合,并提出了一个围绕三个主轴构建的概念框架:(1)通过复制和新功能化进行基因家族扩展; (2) 调控复杂性,包括转录、转录后和表观遗传调节; (3)生态选择压力根据饮食、栖息地和种间相互作用塑造毒液特征。我们整合了不同分类群和技术的发现,包括批量 RNA 测序、长读转录组学以及空间或单细胞方法,
Spectrum News 1 报道称,加州大学洛杉矶分校和大自然保护协会的研究人员开创了一项新的基因测序研究项目,其目标是拯救本地橡树,并在加州各地创造一个更耐热和耐火的本地景观。加州大学洛杉矶分校生态学和进化生物学杰出教授维多利亚·索克(Victoria Sork)与大自然保护协会合作开展了一项研究计划,通过研究其遗传学来确定更能适应炎热和气候变化的本地橡树种群。在今天的《快公司》和《大众科学》中阅读有关加州大学洛杉矶分校的更多信息。
Scientists play catch-up to startling Ebola outbreak
随着本迪布焦病毒的传播,测试、测序和临床试验工作开始发挥作用
The Selfish Gene at 50: Why Dawkins’s evolution classic still holds up
半个世纪前,当理查德·道金斯(Richard Dawkins)的第一本轰动一时的书出版时,很少有基因被测序或详细研究。然而,这本书以基因为中心的进化论在当今的基因时代仍然对我们有很多启发
Pluto Isn't a Planet for Same Reason Whales Aren't Fish
Michael Wong,测序仪 4 月 28 日,NASA 管理员贾里德·艾萨克曼 (Jared Isaacman) 戳了不是一个,而是两个马蜂窝。
The rich but complicated legacy of genome pioneer Craig Venter
克雷格·文特尔 (Craig Venter) 去世,享年 79 岁。他处于人类基因组测序和合成生物学领域的前沿,但对于他的研究方式存在分歧
Transcriptomic and Proteomic Study on Animal Venom: Looking Forward
图片来源:Luis A. Roque,Arácnido 分类学动物毒液的转录组学和蛋白质组学研究:展望有关毒液和毒腺的转录组学和蛋白质组学研究在全球粗毒液成分的表征和知识方面取得了重大突破,并且还可以识别新的毒素和活性。毒液腺转录组(mRNA)和蛋白质组(蛋白质)在产生的主要毒素方面具有高度一致性,这意味着腺体中转录最频繁的基因通常对应于毒液中最丰富的蛋白质。这些方法在很大程度上基于特定的技术,这些技术可以分别对全球粗毒液成分进行深入的表征和了解,例如 DNA 测序和质谱分析。然而,转录组-蛋白质组关系并不完全线性,研究经常表明毒腺转录组包含更大、更多样化的“潜在”毒素转录本,而蛋白质组仅反映