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植物基因组数据库为遗传研究和植物育种计划提供了大量序列信息。许多具有经济价值的植物的基因组都已完全测序（Guo 等人，2021 年；Robbins 等人，2023 年；Wang 等人，2023 年）。基因组由编码特定蛋白质的基因和调节基因表达的基因间区域（启动子和终止子）组成。如果不对基因组中的单个基因进行功能表征，单独的基因组序列对任何育种计划都影响不大。功能表征旨在通过研究编码序列及其调控区域来揭示特定基因的功能。这样的研究通常涉及模型植物的转基因分析。拥有一个对单个基因进行充分表征的植物基因组数据库将有助于该植物的育种计划。
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