基因组学和疾病研究、高通量数据分析、网络生物学、计算遗传学、模型解释和可视 化、生物数据挖掘、比较基因组学、机器学习和医学影像分析、蛋白质结构与功能预测、 宏基因组学与微生物组、知识图谱构建、生物信息学工具开发、转录组学和表达谱的分析、 药物发现与设计、遗传流行病学、蛋白质组学、个性化医疗与精准医学、生物医学工程、 结构生物信息学、计算工具和软件开发、进化生物信息学、系统生物学、环境与生态计算 生物学和流行病学、计算生态学、序列分析、模式识别与生物信号处理、生物信息学与统 计分析、下一代测序技术、计算生物学与人工智能的融合、生物数据挖掘、处理与分析、 计算医学与临床应用、代谢组学、生物信息学工具与网络科学。
化学探针是了解生物系统的重要工具。然而,由于靶标和潜在化合物的组合空间巨大,传统的化学筛选无法系统地应用于寻找所有可能的药物靶标的探针。在这里,我们展示了一个克服这一挑战的新概念,即利用高通量代谢组学和过表达来预测药物-靶标相互作用。收集了用来自化学库的 1,280 种化合物处理的酵母的代谢组谱,并将其与可诱导的酵母膜蛋白过表达菌株的代谢组谱进行比较。通过匹配代谢组谱,我们预测了哪些小分子靶向哪些信号系统并恢复了已知的相互作用。在所研究的 86 个基因中生成了药物-靶标预测,包括难以研究的膜蛋白。测试和验证了这些预测的一个子集,包括布洛芬对 GPR 1 信号的新靶向。这些结果证明了使用高通量代谢组学预测真核蛋白的药物-靶标关系的可行性。
微生物组越来越被认为是健康的关键因素。肠道菌群通过一系列不同的代谢物调节17个肠道稳态。例如,饮食纤维的微生物发酵产物(SCFAS)等分子已经建立了19个分子,以反映微生物组和/或饮食转移,而SCFAS的变化已有20种与来自癌症的多种胃肠道疾病有关。尽管具有21种生物标志物的潜力,但粪便收集的技术挑战的临床翻译有限。在这里,我们22个粪便擦拭(s'wipe),这是一种使用无毛,质量23光谱兼容纤维素湿巾作为厕纸的超低成本粪便收集方法。标本保存在乙醇24中,无需冷藏,可以通过常规邮件运送。质谱分析25表明,S'Wipe捕获了具有可重现性26的挥发性和非挥发性代谢物,并且对诊断相关的分子进行了验证。我们表明,s'wipe在指导凳子收集方面的性能等效27,从而可以与28个现有研究进行可互换的使用和比较。这种方法非常适合大规模的人群研究,29次纵向跟踪和个性化医学应用。30
1人类遗传学系,麦吉尔大学,蒙特利尔,QC H3A 0C7,加拿大2个基因组医学中心,京都大学研究生院,京都大学606-8507,日本3数字技术研究中心,加拿大国家研究委员会,渥太华,渥太华,K1K 4P7,加拿大4P7,Indure prantublorator and Inderipic suplorator and Indiator lip lip lip lip lip lip。渥太华的渥太华,位于加拿大的K1H 8M5,5年生物化学系,微生物学和免疫学系和渥太华系统生物学研究所,渥太华大学,渥太华大学,K1H 8M5,加拿大6 Terrence Donnelly Donnelly Donnelly Center of Cancase ot toronto,MORONTO,MORONTO,MORONTO,MORONTO,MORONTO,MOLONTO,MOLONTO,MOLONTO,MOLONTO,MORENT,MORONT,MOLONT,MORONT,MOLONTO,MORONT,MORONTICT,M5S,M5S,M5S,M5S,M5 of Toronto, Toronto, ON M5S 3E1, Canada 8 Institute of Parasitology, McGill University, Montreal, QC H9X 3V9, Canada 9 Department of Cellular and Molecular Medicine, University of Ottawa Brain and Mind Research Institute, Ottawa, ON K1H 8M5, Canada 10 Department of Chemistry and Biomolecular Sciences, Centre for Catalysis Research and Innovation, University of Ottawa,渥太华,在加拿大的K1N 6N5上,相应的作者。数字技术研究中心,国家研究委员会,渥太华蒙特利尔路1200号,加拿大K1K 4P7。电子邮件:Miroslava.cuperlovic-culf@nrc-cnrc.gc.ca(M.C.-C。)和渥太华大学生物化学,微生物学和免疫学系,451 Smyth Rd,Ottawa,Ottawa,Ottawa,Ottawa,K1H 8M5,加拿大。 电子邮件:sbennet@uottawa.ca(S.A.L.B。) †同等贡献。 副编辑:guqiang yu电子邮件:Miroslava.cuperlovic-culf@nrc-cnrc.gc.ca(M.C.-C。)和渥太华大学生物化学,微生物学和免疫学系,451 Smyth Rd,Ottawa,Ottawa,Ottawa,Ottawa,K1H 8M5,加拿大。电子邮件:sbennet@uottawa.ca(S.A.L.B。) †同等贡献。 副编辑:guqiang yu电子邮件:sbennet@uottawa.ca(S.A.L.B。)†同等贡献。副编辑:guqiang yu
In addition to the general affairs office, which is responsible for the administrative department of forensics, Crime Forensics Office, there are a wide range of business fields, including the DNA center, fingerprint center, and document center, which are in charge of the current department, so it is a gathering of staff with a variety of backgrounds, including staff with highly specialized skills in each field, police officers and appraisers who are seconded to the prefectural police.您不仅可以谈论工作,而且还可以轻松地聊天而不与年龄或背景区分,所以我觉得这是一个非常容易的工作场所。
靶向二代测序在传染病应用与实践专家共识 中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会 通讯作者:王晖,北京大学人民医院检验科,北京 100044,Email:whuibj@163. com;曹斌,中日友好医院呼吸与危重症医学科,北京 100029,Email:caobin_ben@163.com 【摘要】靶向二代测序(tNGS)技术通过设计特异的引物或捕获探针来检测临床样本中的病原微生物及耐药基因,为传染病的诊断、治疗和监测提供依据。但目前tNGS和宏基因组二代测序(mNGS)的临床应用场景尚不明确,不同厂家的tNGS系统质量和结果差异很大。该技术的临床适应症、实验室流程、质量控制、性能验证和报告解释等都亟待制定共识和标准。为规范tNGS在传染病领域的应用与实践,中国医疗保健国际交流促进会临床微生物学分会的微生物学、传染病、呼吸道疾病、流行病学等领域的专家针对上述问题进行了探讨,撰写了tNGS在传染病领域应用与实践专家共识。
Chelsea X. Alvarado 1,2 , Mary B. Makarious 3,4,5 , Cory A. Weller 1,2 , Dan Vitale 1,2 , Mathew J. Koretsky 1 , Sara Bandres-Ciga 1 , Hirotaka Iwaki 1,2,3 , Kristin Levine 1,2 , Andrew Singleton 1,3 , Faraz Faghri 1,2,3 , Mike A. Nalls 1,2,3 , Hampton L. Leonard 1,2,3,6 * * 通信地址:Hampton Leonard 阿尔茨海默病及相关痴呆症中心 美国国立老龄研究所,美国国立卫生研究院内部研究项目 T44 大楼 美国马里兰州贝塞斯达 20892 电子邮件:hampton@datatecnica.com 附属机构 1 美国国立卫生研究院阿尔茨海默病及相关痴呆症中心 (CARD)美国国立卫生研究院老龄化和国家神经疾病和中风研究所,美国马里兰州贝塞斯达,20814 2 Data Tecnica International,美国华盛顿特区,20037 3 美国国立卫生研究院国家老龄化研究所神经遗传学实验室,美国马里兰州贝塞斯达,20814 4 英国伦敦大学学院皇后广场神经病学研究所临床和运动神经科学系,WC1N 3BG 5 英国伦敦大学学院运动障碍中心,WC1N 3BG 6 德国神经退行性疾病中心 (DZNE),德国图宾根 关键词 神经退行性疾病;可用药性;基于汇总数据的孟德尔随机化;SMR