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肉牛无法维持足月妊娠已成为牛肉行业的一个经济问题。畜群管理和营养改善减轻了环境对胚胎和胎儿损失的影响，但通过基因组选择还可以获得额外的收益。本研究的目的是确定杂交肉牛小母牛中与怀孕所需交配次数 (TBRD) 和小母牛首次交配受孕率 (HCR1) 相关的基因座和基因集。来自商业肉牛场的小母牛 (n = 709) 经过一轮人工授精，然后与公牛自然交配 50 天。在繁殖季节后 35 天通过超声波确定怀孕和受孕时间。使用 GeneSeek (Lin-coln, NE) Bovine GGP50K BeadChip 对小母牛进行基因分型，然后使用 EIGENSTRAT 类模型进行全基因组关联分析 (GWAA)，以确定与 TBRD 和 HCR1 相关的基因座 (P < 1 × 10 − 5)。一个基因座与 BTA19 上的 TBRD 相关 (P = 8.97 × 10 − 6)，包括位置候选基因 ASIC2（该基因在生育力分类小母牛的子宫内膜中存在差异表达）和位置候选基因 SPACA3。使用 SNP（GSEA-SNP）数据进行基因集富集分析，并确定了一个基因集，即氧化还原酶活性，作用于配对供体，通过 TBRD 富集（NES = 3.15）分子氧的掺入或还原，并包含九个有助于基因集富集的前沿基因。富集的基因集参与催化氧化还原反应，这与影响妊娠成功的氧化应激源有关。没有与 HCR1 相关的基因座或富集的基因集。识别富集生育力的基因座、位置候选基因、基因集和前沿基因有助于基因组选择，使生产者能够选择繁殖能力优良的牛，降低与不育相关的成本，并增加小牛产量百分比。
与杂交肉牛受孕率相关的基因座
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