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免疫原性表位的计算预测是治疗和预防疫苗设计的有前途的平台。该策略的一个潜在目标是人类免疫缺陷病毒 (HIV-1)，尽管经过数十年的努力，但尚未有可用的疫苗。特别是，设计用于消除受感染细胞的治疗性疫苗将成为治愈策略的关键组成部分。最近，基于 HIV/AIDS 患者个体病毒免疫学数据设计的 HIV 肽显示出能够诱导治疗后病毒设定点的消退。然而，这种方法的可重复性和可扩展性受到与手动肽设计相关的错误和任意性以及耗时过程的限制。我们在此介绍 Custommune，这是一种用户友好的网络工具，用于设计个性化和针对人群的疫苗。当应用于 HIV-1 时，Custommune 使用患者特定的人类白细胞抗原 (HLA) 等位基因和病毒序列以及预期的 HLA 肽结合强度和潜在的免疫逃逸突变来预测个性化表位。值得注意的是，Custommune 预测结果与最近 II 期临床试验 (NCT02961829) 中施用的手动设计肽相比更为有利。此外，我们利用 Custommune 设计了针对受 COVID-19 影响严重的人群的预防性疫苗。结果允许识别针对每个人群量身定制的肽，并预测会引发 CD8 + T 细胞免疫和针对严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV- 2) 结构保守表位的中和抗体。总体而言，我们的数据描述了一种快速开发针对慢性和急性病毒感染的个性化或基于人群的免疫疗法的新工具。介绍
靶向疫苗表位
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