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CRISPR/Cas 系统,特别是 CRISPR/Cas9(Jinek 等人,2012;Cong 等人,2013),已被开发为一个强大而多功能的平台,用于操作各种物种的基因组。近年来,许多报告表明其在人类基因治疗和生命科学研究以及动植物育种方面具有强大的潜在应用。本研究主题“精准基因组编辑技术和应用”中的集合可能就是明证。通常,CRISPR/Cas9 核酸酶用于切割目标基因组 DNA 以产生位点特异性双链断裂 (DSB),主要通过非同源末端连接 (NHEJ) 修复,或在较小程度上通过同源定向修复 (HDR) 修复。经典的 NHEJ 修复途径可产生小的插入或缺失 (indel),通过在开放阅读框 (ORF) 中引入移码导致目标编码基因的功能丧失。NHEJ 诱变是一种非常流行的基因操作策略。除了经典的 NHEJ 之外,替代或准确的 NHEJ 介导的修复可以实现精确的基因组 DNA 缺失(Guo et al., 2018; Shou et al., 2018)。Chao 等人和 Zhao 等人在本研究主题中的两篇论文分别描述了等位基因特异性敲除和双基因敲除小鼠模型的制造,用于快速疾病基因验证和人类异种移植研究。N6-甲基腺苷 (m6A) 是一种成熟的真核 mRNA 表观遗传修饰。越来越多的研究发现了 m6A 甲基化的意义,这催生了“表观转录组学”这一新兴领域。本卷中的另一篇文章( Huang 等人)描述了小鼠精原细胞 GC-1 细胞中脂肪质量和肥胖相关( Fto )基因的敲除研究,该基因已被证明作为 m6A 去甲基化酶作用于表观转录组( Li 等人,2017 年; Lin 等人,2017 年)。另一方面,HDR 修复途径依赖于同源供体 DNA 在 DSB 位点产生靶向基因敲入或在两个 DSB 位点之间产生基因替换。精确的点突变和设计的小插入/缺失也可以通过这种方法实现。本专题中的一篇论文介绍了利用CRISPR/Cas9介导的HDR在人诱导性多能干细胞(iPSC)中精准校正Rett综合征(RTT)中甲基-CpG结合蛋白2(MECP2)基因的努力。该报道为基于iPSC的疾病建模和基因校正治疗提供了参考(Le等)。虽然基于HDR的基因组可以实现基因插入和精准替换,但在精准编辑过程中仍面临一些缺点,包括HDR效率低、双等位基因靶向失败、正向选择的复杂性以及选择标记的重新删除。

精准基因组编辑技术与应用

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