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剪接因子受几种血液和实体恶性肿瘤中复发性体细胞突变和拷贝数变异的影响,这通常被视为剪接异常可驱动癌症发生和发展的初步证据。然而,许多剪接体成分也在 DNA 修复和其他细胞过程中“兼职”,因此很难确定它们在癌症中的确切作用。尽管如此,很少有人会否认,失调的 mRNA 剪接是大多数癌症的普遍特征。正确解释这些分子指纹可以揭示新的肿瘤弱点和尚未开发的治疗机会。然而,多重技术挑战、挥之不去的误解和悬而未决的问题阻碍了临床转化。首先,由于短读 RNA 测序的局限性(不擅长解析完整的 mRNA 异构体),以及长读 RNA 测序固有的浅读深度(尤其是在单细胞水平上),癌症中剪接异常的总体情况尚不明确。尽管已知个别癌症相关亚型会促进癌症进展,但广泛的剪接变异可能同样重要,而且可能更容易对人类癌症采取行动。也就是说,除了“修复”错误剪接的转录本外,可​​能的治疗途径还包括使用小分子剪接体抑制剂加剧剪接畸变、使用合成致死方法靶向复发性剪接畸变以及训练免疫系统识别剪接衍生的新抗原。

引导癌症 mRNA 剪接研究走向临床转化

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