10倍基因组学的森林平台结合了组织学,蛋白质检测和空间分辨的整个转录组基因表达分析,以在组织环境中定位和量化基因表达。它部分基于空间转录组学方法(1)。visium于2019年进行了商业化,并已用于开创性论文中,证明了其应用的广度,包括癌症(3,4),神经科学(5),免疫学(6)和发育生物学(7)。该测定法已被很好地采用,用于68多个同行审查的出版物和130张预印。当前,森林空间基因表达与任何物种的新鲜冷冻(FF)组织截面兼容。该测定法利用poly(a)捕获和新颖的空间条形码技术来制备图书馆。10x基因组学还为FFPE提供了森林空间基因的表达,它与人和小鼠福尔马林固定石蜡包裹的(FFPE)组织切片兼容。该测定法利用了基因靶探针对的RNA-拟合连接(RTL),以对整个转录组进行高度特异性和敏感的检测。两种分析都利用了相同的分析工具和管道(即太空游侠,Loupe浏览器)的套件来处理和可视化visium数据。此外,研究人员还可以使用10倍基因组学技术专家和组织专家,他们可以通过科学和技术咨询,工作流优化和方法论故障排除提供支持。
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