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目前 NASA 用于评估航天器清洁度的标准检测方法是一种基于培养的检测方法，其目标是孢子，这是微生物多样性中最顽强但相对较小的部分。了解它们在航天器和洁净室中决定微生物持久性和存活性的特征仍然是一项重大挑战。NASA 还在寻求新方法来描述地球生命的极限。分析基因序列、蛋白质结构、细胞化学的能力增加了样本的生物数据量。生物技术和行星保护小组率先采用宏基因组学方法（直接分析基因组）来研究微生物多样性及其在航天器相关硬件和环境中的功能能力，并开发了专门的生物信息学分析流程来支持这项研究。
