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抗生素耐药性 (AMR) 是一个全球性的健康问题。导致 AMR 的一个关键因素是细菌通过流出泵输出药物的能力,这种能力依赖于 ATP 依赖性表达和几种控制基因的相互作用。最近的研究表明,在克隆细菌群体中存在显著的细胞间 ATP 变异,但在理解流出泵时,内在的细胞间 ATP 异质性的贡献通常被忽视。在这里,我们考虑 ATP 变异如何影响控制两种细菌物种中流出泵基因表达的基因调控网络。我们开发并应用了一个通用的布尔建模框架,该框架旨在结合基因表达动态对可用细胞能量供应的依赖性。理论结果表明,能量可用性的差异会导致流出基因表达的下游异质性明显。具有更高能量可用性的细胞对压力源的反应更佳。此外,在没有压力的情况下,模型细菌会产生异质性流出泵基因表达脉冲,这有助于持续存在流出表达活性增加的细胞亚群,从而可能形成一个持续的内在抗性细菌池。因此,这种建模方法揭示了细胞对抗菌药物反应异质性的重要来源,并揭示了流出泵相关抗菌药物耐药性的潜在可靶向方面。

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