众多挑战阻碍了为脊索瘤等罕见癌症患者开发有效和个性化治疗方案。以生物标志物为指导的对已批准用于其他适应症的疗法进行再利用仍然是重新定义治疗模式的最快途径,但脊索瘤的低突变负担限制了基因组学在靶点发现和精准肿瘤学工作中的影响。随着我们对各种恶性肿瘤致癌机制认识的不断成熟,越来越明显的是,肿瘤的许多特性超越了其基因组——从而带来了新的和未知的治疗机会。在这篇综述中,我们讨论了如何通过实施尖端工具和方法为脊索瘤的弱点打开新的窗口。我们还注意到,脊索瘤和其他癌症中新出现的观察结果的融合如何导致确定和评估这种罕见癌症的新治疗假设。