摘要 R 环杂交和电子显微镜已用于测定克隆基因的细胞 RNA 浓度。在质粒 DNA 序列过量的情况下,所有互补 RNA 都被驱动到可通过电子显微镜分析的 R 环结构中。为测定特定 poly(A)+ RNA 的浓度,将质粒 DNA 每 2000-5000 个碱基对与三氧沙林和紫外线交联一次,以 DNA 序列过量的方式与各种已知量的总 poly(A)+ RNA 杂交,并通过用乙二醛处理来稳定 R 环。如有必要,可使用 Sepharose 2B 色谱法去除多余的未杂交 RNA,从而能够可视化较少的转录本。重建实验表明,通过电子显微镜测定含有特定 RNA 环的质粒 DNA 分子的比例可以给出总 poly(A)+ RNA 群体中特定 RNA 重量比例或浓度的准确值。这些方法还用于测定 TRT3 上与序列互补的五种 RNA 物种的浓度,TRT3 是一种重组 DNA 质粒,含有酵母组蛋白 2A 和 2B 基因以及另外三种非组蛋白基因。所描述的方法允许人们可视化丰富和非丰富转录本的 R 环结构,并通过确定含有 R 环的 DNA 分数来估计这些 RNA 物种的浓度。
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