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数千年来,人类一直享受着微生物在发酵食品和饮料中提供的新口味、更长的保质期和营养价值。最近的发酵测序调查已经绘制了跨空间、时间和生产实践的微生物多样性模式。但对发酵食品微生物组如何组装的机制理解直到最近才开始出现。以三种食物(表面成熟的奶酪、酸面团发酵剂和发酵蔬菜)为例,我们使用生态和进化框架来确定微生物群落在发酵过程中的组装方式。通过将原位测序调查与体外模型相结合,我们开始了解扩散、选择、多样化和漂移如何产生发酵食品群落的多样性。大多数食品生产商并不知道他们的生产环境中正在发生的生态过程,但生态学和进化的理论和模型可以为管理从农场到发酵的发酵食品微生物组提供新方法。

发酵食品中的微生物组组装

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