该项目旨在将ML工具专门用于静电相互作用,以便在几种应用中加速计算,从经典分子动力学(MD)到隐式溶剂(IS)模型。尤其重要。可以通过显式溶剂MD或通过IS模型来计算它们,例如Poisson-Boltzmann方程(PBE),椭圆形偏微分方程。pbe很好地描述了复杂几何形状中的静电。在存在离子的情况下,溶剂的行为可以用不同程度的准确性描述,这不可避免地反映了计算成本以及处理大型系统的可行性。如今,由于最现代的实验技术(例如Cryo-Em),这些方法的结构数据量和大小巨大,因此正在经历重大的复兴,这对明确的溶剂造型构成了巨大的挑战。尤其是由于其固有的远距离效应,静电是巨大的计算挑战。在该项目中,我们旨在建立和巩固新的理论和模拟方法,在这些方法中,PIML技术可以提高静电计算,还利用了非平衡统计机制领域的最新数学发展,以及响应理论。
主要关键词