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使用使用牛津纳米孔技术(长阅读)生成的数据来进行整个基因组测序,从而在NextFlow中成功实施了1KSA基因组组装管道,并在NextFlow中成功实施了,并利用了Seriallong和BigMem资源。迄今为止,1KSA在CHPC -29植物上汇集了近50种南非物种的基因组(草稿水平); 4个哺乳动物; 13条鱼和3种拟人动物。这些基因组组件的预期基因组大小范围从162.3 MB到2.6 GB。但是,仍然需要解决一些计算挑战,以应对较大基因组的测序和组装。

1KSA-解码南非的生物多样性

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