抽象的大噬菌/自噬是一种多步降解过程,对于维持细胞稳态至关重要,并且在疾病期间常常失调。系统地量化通过该途径的通量对于获得基本见解并有效调节此过程至关重要。量化通量的建立方法使用稳态测量,该测量提供了有关扰动和细胞反应的有限信息。我们提出了一个理论和实验框架,可在非态状态条件下以速率的形式测量自噬步骤。我们使用这种方法来测量对雷帕霉素和沃特曼宁治疗的时间反应,这是两个常用的自噬调节剂。我们在短短10分钟内量化了自噬速率的变化,这可以在反馈开始之前建立自噬扰动的直接机制。我们确定了雷帕霉素对自噬速率初始和时间进展的con核心依赖性作用。我们还发现,沃尔特曼宁(Wortmannin)对自噬的抑制作用,雷帕霉素进一步加速了恢复时间。此外,我们应用了这种方法来研究血清和谷氨酰胺饥饿对自噬的影响。血清饥饿导致所有速率的快速和短暂增加。谷氨酰胺饥饿导致较长时间尺度上的速率降低。总而言之,这种新方法可以量化具有高灵敏度和时间分辨率的自噬通量,并促进对这一过程的全面理解。
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