解码肝癌蓝图:细胞间遗传奥德赛

肝脏是一种令人惊叹的器官,它调节我们身体的新陈代谢并排毒血液。肝脏由几种不同类型的细胞组成,每种细胞都有专门的工作,当我们健康时,每个细胞都能出色地完成自己的工作,整个器官就像一台运转良好的机器一样运转。有时,当疾病影响肝脏时,[…]

来源:科学特色系列

肝脏是调节人体新陈代谢和排毒血液的神奇器官。肝脏由几种不同类型的细胞组成,每种细胞都有专门的功能,当我们健康时,每个细胞都能出色地完成其工作,整个器官就像一台运转良好的机器一样运转。有时,当疾病影响肝脏时,细胞不再能很好地发挥作用,并经历所谓的转化。这模糊了构成肝脏的不同类型细胞之间的界限,机器停转,导致肝脏无法执行其重要工作。随着越来越多的细胞发生转化,患上两种癌症中的一种或两种的可能性更高:肝细胞癌 (HCC) 和胆管癌 (CCA)。HCC 是这两种癌症中较为常见的一种,其根源在于一系列慢性肝病,从病毒性肝炎到代谢综合征。另一方面,CCA 虽然不太常见,但其生存率却很低,给人留下了阴影。这两种癌症之间的斗争的核心是一个由致癌基因 MYC 控制的分子开关,它决定了细胞对 HCC 或 CCA 的忠诚度,并受到转录因子 (TF) 的影响——这些转录因子是细胞命运的隐形操纵者。

由美国国家癌症研究所 (NIH) 的 Amanda Craig 博士和 Xin Wei Wang 博士领导的一项开创性研究发表在《细胞报告》上,深入探究了原发性肝癌的遗传复杂性。研究小组利用单细胞转座酶可及染色质测序 (scATAC-seq) 检测,着手探索肝细胞癌 (HCC) 和肝内胆管癌 (iCCA) 的转录动力学,揭示了这些亚型特有的不同转录因子 (TF) 活性。

期刊参考

Craig 等人,“使用单细胞 ATAC 测序对原发性肝癌中的转录因子活性进行全基因组分析”,Cell Reports。

DOI:https://doi.org/10.1016/j.celrep.2023.113446