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新的 DNA 搜索引擎为生物学大数据带来秩序
MetaGraph 将海量数据档案压缩为科学家的搜索引擎，开辟了生物发现的新领域
来源:科学美国人2025 年 10 月 14 日
3 分钟阅读
新的 DNA 搜索引擎为生物学大数据带来秩序
MetaGraph 将海量数据档案压缩为科学家的搜索引擎，开辟了生物发现的新领域
作者：Elie Dolgin 与《自然》杂志
埃利·多尔金 自然杂志互联网上有 Google。现在生物学有了MetaGraph。今天《自然》杂志对此进行了详细介绍，该搜索引擎可以快速筛选公共存储库中数量惊人的生物数据。
今天在 Nature 上详细介绍 自然 公共存储库中的数据“这是一项巨大的成就，”巴黎巴斯德研究所的生物计算研究员 Rayan Chikhi 说。他们为分析原始生物数据（包括 DNA、RNA 和蛋白质序列）“制定了新标准”，这些数据来自数据库，这些数据可能包含数百万个 DNA 字母，相当于“拍数据库”的信息，比 Google 庞大索引中的所有网页还要多。
尽管 MetaGraph 被标记为“Google for DNA”，但 Chikhi 将该工具比作 YouTube 的搜索引擎，因为这些任务对计算的要求更高。就像 YouTube 搜索可以检索每个带有红色气球的视频一样，即使这些关键词没有出现在标题、标签或描述中，MetaGraph 也可以揭示隐藏在广泛测序数据集中深处的遗传模式，而无需提前明确注释这些模式。
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订阅“它可以实现用任何其他方式都无法完成的事情，”Chikhi 说。
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测序数据集 SRA 1 亿个 DNA 字母“这是一种与大量数据交互的全新方式，”Kahles 说道。 “它是压缩的，但可以即时访问。”
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