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科学家发现230种塑造海洋生物和健康的新巨型病毒
巨型病毒在称为生物的单细胞海洋生物的生存中起作用。这些包括藻类,变形虫和鞭毛,这些藻类构成了海洋食品网的基础。而且由于这些生物构成了食物链的重要组成部分,因此这些大型DNA病毒通常会造成各种公共卫生危害,包括有害的藻华。
来源:英国物理学家网首页巨型病毒在称为生物的单细胞海洋生物的生存中起作用。这些包括藻类,变形虫和鞭毛,这些藻类构成了海洋食品网的基础。而且由于这些生物构成了食物链的重要组成部分,因此这些大型DNA病毒通常会造成各种公共卫生危害,包括有害的藻华。
罗森斯特海洋,大气和地球科学学院科学家的一项新研究可能有助于揭示我们水道和海洋中存在的许多类型的病毒。当有害的藻华可能会影响其海岸线或当地海湾,河流或湖泊中是否存在任何其他病毒时,这些知识可以帮助当地领导者更好地做好准备。
使用高性能计算方法,研究人员确定了230种新型巨型病毒在公开可用的海洋宏基因组数据集中,并表征了它们的功能。
巨型病毒发表在《自然NPJ病毒》杂志上,他们的发现包括发现以前在文献中未知的新巨型病毒基因组。在这些基因组中,表征了530种新的功能蛋白,包括参与光合作用的九种蛋白质。这表明这些病毒可能能够操纵其宿主和感染过程中的光合作用过程。
自然NPJ病毒, 有害藻华直到最近,由于生物信息学管道的局限性,巨型病毒在很大程度上还没有被科学方法检测到。研究人员创建了一种名为Beren的创新工具(从环境元基因组中回收真核病毒的生物信息学工具),旨在鉴定广泛的公共DNA测序数据集中的巨型病毒基因组。
蜂窝函数 gitlab.com/benminch1/beren NPJ病毒