详细内容或原文请订阅后点击阅览
peptideminer-跨动物王国发现的神经肽
peptideminer-跨动物王国的神经肽发现是最大，最多样化的细胞到细胞信号分子，在动物生理学和行为中扮演重要角色。它们在进化上是古老的，并且在整个动物王国中分布广泛。尽管已经鉴定出了200多种神经肽，但在功能上仅表征了一小部分。公认的瓶颈是缺乏研究其生物学作用和治疗潜力的有效工具。有趣的是，在动物毒液中也发现了神经肽样肽，它们有助于捕食或防御性策略。由于其高序列差异和短成熟的肽序列，整个动物界的神经肽家族都具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了peptideminer，这是一种搜索工具，该工具采用了个人资料隐藏的马尔可夫模型（配置文件-HMMS）来发现家庭特定的肽。在现有方法上，对肽运动器进行了系统的验证和基准测试，证明了其出色的性能。通过对几种毒液转录组应用肽剂（包括24个以前未发表的数据集），我们发现了10种来自远距离相关物种的新型纳地尿肽和57种来自海洋捕食性锥形蜗牛的新型胰岛素样序列。在人类胰岛素受体上新鉴定的联合蛋白的化学合成和结构 - 活性研究强调了我们的收益
来源:Arácnidopeptideminer-跨动物王国发现的神经肽
摘要
神经肽是最大，最多样化的细胞对细胞信号分子，在动物生理和行为中扮演重要角色。它们在进化上是古老的，并且在整个动物王国中分布广泛。尽管已经鉴定出了200多种神经肽，但在功能上仅表征了一小部分。公认的瓶颈是缺乏研究其生物学作用和治疗潜力的有效工具。有趣的是，在动物毒液中也发现了神经肽样肽，它们有助于捕食或防御性策略。由于其高序列差异和短成熟的肽序列，整个动物界的神经肽家族都具有挑战性。为了解决这个问题，我们开发了peptideminer，这是一种搜索工具，该工具采用了个人资料隐藏的马尔可夫模型（配置文件-HMMS）来发现家庭特定的肽。在现有方法上，对肽运动器进行了系统的验证和基准测试，证明了其出色的性能。通过对几种毒液转录组应用肽剂（包括24个以前未发表的数据集），我们发现了10种来自远距离相关物种的新型纳地尿肽和57种来自海洋捕食性锥形蜗牛的新型胰岛素样序列。新鉴定的人类胰岛素受体的联合蛋白的化学合成和结构 - 活性关系研究强调了我们方法在阐明配体 - 受体相互作用并发现新的药理探针和治疗铅的价值。 Peptideminer提供了一个强大的平台，用于发现新的生物活性肽和特定于家庭的类似物，从而加速了自然产品发现和进化研究。
Helen C Mendel，Gene Hopping，Eivind A B Undheim，Johannes Zuegg，Richard J Lewis，Richard J Lewis，Briony E Forbes，Quentin Kaas，Markus Muttenthaler，peptideminer，peptideminer - 跨动物王国的peptipideminer，peptideminer，