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金建军
用于植物基因组研究的配制软件
来源:科学美国人在一天之内,金建军可能会从在计算机上编写代码转为在实验室工作台上进行实验,或者在纽约植物园担任助理馆长,在温室灯光下工作。他的研究跨越多个领域——植物系统学、基因组学和计算生物学——他的目标是更好地了解植物的内部运作。
Jin 是 GetOrganelle 的开发者,该软件工具可帮助生物学家将细胞器(线粒体和叶绿体等小型细胞结构)的 DNA 与植物细胞中的所有其他 DNA 分开,使他们更容易找到和研究他们感兴趣的序列。它是同类工具中最准确的工具之一,在 GitHub 上拥有数百颗星。
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GetOrganelle 最初是 Jin 练习 Python 编程技能的一个副项目。他说,最初,一些同事对此表示怀疑。直到 GetOrganelle 在一个困难的豆类结构数据集上取得了一些成功后,他的顾问和高级合作者才鼓励他将这项工作作为学术论文发表。该论文现在已被引用数千次。
虽然植物园对于科学家来说似乎不是一个显而易见的地方,但金说植物园“不仅仅是一个工作场所;它是研究系统的一部分。纽约植物园的生物收藏、植物标本、园艺专业知识和生物多样性知识为研究植物进化提供了异常丰富的基础。”他的新挑战是试图破译植物遗传嵌合体,即单个生物体包含多个基因组的情况。
