科学大军动员起来绘制美国土壤微生物组图

霍普金斯大学研究人员和学生的大规模努力旨在了解地球上生物多样性最丰富的栖息地

来源:约翰霍普金斯大学

作者:吉尔·罗森

约翰·霍普金斯大学遗传学家和全国各地的一小群研究人员(包括学生)正在努力对美国庞大且基本上未知的土壤微生物组进行编目。

该项目是有史以来最大的微生物组研究之一,已经发现了 1,000 多种新细菌菌株和前所未见的微生物——但它们仍然只是微生物暗物质的一小部分。

“我们试图填补微生物多样性方面的科学空白,只有通过美国各地的科学家和学生网络才能实现,”资深作者 Michael Schatz 说,他是一位领先的基因组学专家,帮助绘制了人类基因组图谱,以及许多其他动植物物种的基因组图谱。 “土壤是地球上生物最活跃的环境,但我们只采样了其中生活的一小部分生命。”

《自然遗传学》中概述了联邦政府资助的项目。

要点
  • BioDIGS 联盟遍布全国 40 多个地点,拥有 150 名成员的团队,其中包括研究人员和学生。
  • 该团队正在利用与解锁人类基因组最终部分相同的复杂 DNA 测序技术。
  • 据估计,99% 的土壤微生物仍未被研究,或者是科学家所说的微生物“暗物质”的一部分。
  • 土壤是地球上生物多样性最丰富的栖息地,是一半以上现有物种的家园,包括脊椎动物、节肢动物、环节动物、线虫、植物和真菌,以及数以百万计的细菌、古细菌、噬菌体和其他微生物物种。

    土壤中的某些微生物对于人类、动物和植物生命所依赖的生态功能至关重要。另一些则促进抗菌素耐药性,使细菌和病毒对抗生素和其他药物产生免疫力,从而威胁人类健康。

    图片来源:约翰霍普金斯大学