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科学家揭示现代草莓隐藏的历史
研究人员利用移动 DNA 中的分子特征来追踪栽培草莓基因组的进化起源。当整个基因组通过重复的杂交事件复制和组合时，多倍体基因组就形成了。这个过程在许多农作物的进化中发挥了重要作用。然而，了解这些基因组的内部结构可能很困难，[...]
来源:SciTech日报研究人员利用移动 DNA 中的分子特征来追踪栽培草莓基因组的进化起源。
当整个基因组通过重复的杂交事件复制和组合时，就会形成多倍体基因组。这个过程在许多农作物的进化中发挥了重要作用。
然而，了解这些基因组的内部结构可能很困难，特别是当对它们做出贡献的祖先物种未知时。在一项新研究中，研究人员引入了一种全基因组方法，旨在通过分析长末端重复反转录转座子留下的进化信号来揭示多倍体基因组的复杂性。
该方法比较这些遗传元件在染色体上的相似性模式。这种分析使科学家能够重建亚基因组的组织并估计主要基因组合并事件发生的时间。
当应用于栽培八倍体草莓时，该方法揭示了由多个异源多倍化事件形成的逐步进化历史。这些发现为复杂的植物基因组如何在数百万年中逐渐组装和多样化提供了新的见解。
全基因组复制多次重塑了植物基因组，为进化创新、环境适应和作物多样性做出了贡献。在异源多倍体物种中，染色体起源于不同的祖先基因组。这些基因组组合成几个亚基因组，随着时间的推移，这些亚基因组不断进化并相互作用。
识别这些亚基因组对于了解植物基因组如何发育和变化至关重要。传统方法通常依赖于已知的二倍体祖先物种进行比较。然而，其中许多祖先要么已经灭绝，要么尚未被识别。
多倍体基因组的新生物信息学框架
在已知多倍体作物中测试该方法
作为进化时间戳的转座元素
DOI：10.1093/hr/uhaf132
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