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动物进化中频繁出现异常线粒体 tRNA 基因

2024年10月23日 21:21 33 Comments
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异常线粒体 tRNA 基因在动物进化中频繁出现摘要线粒体 tRNA 在整个后生动物进化过程中获得了多样化的异常结构组合。由于有超过 12,500 个线粒体基因组序列可用，因此必须对 mt-tRNA 库和结构变异的模式变化进行全面概述。当然，这需要使用统一的工作流程重新分析超过 250,000 个 mt-tRNA 的序列数据。在这里，我们报告了使用 mitos2 在 2022 年 9 月之前对 RefSeq 数据库中所有可用的线粒体基因组进行完整重新注释的结果。根据文献中报道的 mt-tRNA 变体的个案，我们的数据精确定位了各自的变化热点，即棘头目 (Lophotrochozoa)、线虫、蜱螨目和蜘蛛目 (Araneae) (节肢动物)。在许多其他进化枝中，mt-tRNA 与常态的偏差并不那么明显。动物 mt-tRNA 中臂的缺失显然是一种独立发生过多次的现象，并不局限于少数特定进化枝。此处的汇总数据为系统研究 mt-tRNA 结构减少和缺失的详细进化过程提供了一个起点，也为进一步改进 mt-tRNA 注释的注释工作流程提供了资源。Iuliia Ozerova、Jörg Fallmann、Mario Mörl、Matthias Bernt、Sonja J Prohaska、Peter F Stadler、异常线粒体 tRNA 基因 Appea

来源:Arácnido
线粒体TRNA在整个后代进化中获得了多种异常结构的组合。借助超过12,500个有丝分裂组序列的可用性，必须全面概述有关MT-tRNA库和结构变化的模式变化的全面概述。当然，这需要重新分析具有统一工作流程的25万MT-TRNA的序列数据。在这里，我们报告了有关使用Mitos2到2022年9月，在RefSeq数据库中可用的所有有丝分裂基因组的完全重新注释。基于在整个文献中报道的MT-tRNA变体的个体情况，我们的数据指出了各自的变化热点，即acanthocephala（Lophotrochozoa）（Lophotrochozoa），Nematoda，acariformes，acariformes和araneaee（arraneae）（Arthropoda）。在许多其他进化枝中，观察到MT-Trnas与规范的显着偏差。动物mt-tRNA中的武器丧失显然是一种独立发生的现象，不仅限于少数特定的进化枝。此处的摘要数据为系统研究提供了一个起点，以对结构减少和MT-TRNA的详细进化过程，以及用于进一步改善MT-TRNA注释的注释工作流的资源。线粒体tRNA基因经常出现在动物进化，基因组生物学和进化中，2024; evae232，https://doi.org/10.1093/gbe/evae232

iuliia ozerova，JörgFallmann，MarioMörl，Matthias Bernt，Sonja J Prohaska，Peter F Stadler，异常的线粒体TRNA基因经常出现在动物进化中

iuliia Ozerova，JörgFallmann，MarioMörl，Matthias Bernt，Sonja J Prohaska，Peter F Stadler，异常的线粒体TRNA基因经常出现在动物进化中， 基因组生物学和进化 ，2024;，evae232，
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