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巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组表现出前志留纪全基因组复制的特征
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征 摘要在蛛形纲动物中，染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中，研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝，该进化枝由三个目组成，这三个目形成了蜘蛛的姊妹群，它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一空白。我们表明，这种高度完整的基因组保留了许多基因家族的原形条件，这些基因家族在更多样化的蜘蛛中经历了谱系特异性衍生。与 Uropygi 的系统发育位置一致，M. giganteus 基因组中的大合线证实了古老的全基因组复制的特征。巨型醋龙 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组表现出前志留纪全基因组复制的特征Siddharth Kulkarni、Benjamin C Klementz、Prashant P SharmabioRxiv 2024.11.08.622695；doi：https://doi.org/10.1101/2024.11.08.622695
来源:Arácnido巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征
摘要
在蛛形纲动物中，染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中，研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝，该进化枝由三个目组成，形成蜘蛛的姊妹群，它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一差距。我们表明，这个高度完整的基因组保留了许多基因家族的原形条件，这些基因家族在更多样化的蜘蛛中经历了谱系特异性衍生。与Uropygi的系统发育位置一致，M. giganteus基因组中的大合线证实了古老的全基因组重复的特征。
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组表现出前志留纪全基因组复制的特征
Siddharth Kulkarni, Benjamin C Klementz, Prashant P Sharma
Siddharth Kulkarni, Benjamin C Klementz, Prashant P Sharma 悉达思 库尔卡尼 本杰明·克莱门茨 本杰明·C 克莱门茨 普拉尚特·P·夏尔马 普拉尚特·P 夏尔马