GENOT: Entropic (Gromov) Wasserstein Flow Matching with Applications to Single-Cell Genomics
单细胞基因组学极大地促进了我们对细胞行为的理解,促进了治疗和精准医疗的创新。然而,单细胞测序技术本质上具有破坏性,只能同时测量有限的数据模式。这一限制凸显了对能够重新排列细胞的新方法的需求。最佳传输 (OT) 已成为一种有效的解决方案,但传统的离散求解器受到可扩展性、隐私和样本外估计问题的阻碍。这些挑战刺激了神经网络的发展……
Unravelling wheat’s genetic past and offering insights for future breeding
来自澳大利亚和中国的国际科学家团队在迄今为止世界上最全面的小麦基因组测序和组装项目中发现了宝贵的遗传和基因组信息。
巴西蝎毒液:Tstx-Κ Beta (Ts8) 是一种具有抗菌活性和非溶血性的神经毒素摘要对传统抗生素具有耐药性的微生物引起的感染增加是巴西乃至全世界的健康问题。寻找能够抑制病原体生长的新分子对研究人员来说是一项挑战,他们发现毒液中含有丰富的生物分子,包括抗菌肽 (AMP)。巴西蝎子 Tityus serrulatus 是造成严重事故的物种之一;其毒液富含已被充分表征的神经毒素,突出了它们对通道(尤其是钠和钾)的活性。在这项研究中,我们鉴定并表征了 T. serrulatus 毒液中的一种 AMP。挤奶后,用高效液相色谱法对毒液进行分级,并用液体生长抑制试验检测各级分对大肠杆菌、藤黄微球菌、白
Diving Into the Brittle Star Genome to Understand the Evolution of Regeneration
蛇尾的基因组测序揭示了独特的基因排列,并深入了解了与肢体再生有关的古老基因。
Biotech Fluidics reports on nanoscale lab tools
Biotech Fluidics 报告了其超低容量脱气器和非侵入式微流量计如何成为色谱分离、分配、诊断、药物筛选、核酸测序和组织培养等纳米级应用的重要实验室工具。在纳米级研究液体现象可能非常苛刻,需要一种设计用于实时连续监测超低流体流动的设备……
使用系统基因组学重新评估热带游走蜘蛛的进化关系:基于 UCE 的 Ctenidae (Araneae) 系统发育,发现新的狼蛛科摘要热带游走蜘蛛 (Ctenidae) 是一个多样化的游走捕食者科,其物种丰富度在热带地区达到顶峰。人们已经使用形态学和基于桑格的测序数据对 Ctenidae 的系统发育进行了研究,但这些研究受到分类单元采样的限制,并且通常为许多科内系统发育关系恢复了较低的分支支持。在此,我们使用基因组规模的数据展示了该科最广泛的系统发育采样,利用了来自世界各地的所有 ctenid 亚科的博物馆收藏。我们获得了 Ctenidae 的系统发育,大多数节点在不同的系统发育分析中显示出最大
Trichopelma grandeOrtiz & Fonseca, 2024 DOI:doi.org/10.1080/00222933.2024.2401921 摘要大安的列斯群岛体型庞大、气候热带、地形复杂,加上数百万年的孤立,使其成为自然进化的实验室。这些岛屿上的多个物种经历了爆炸式的多样化,形成了高度多样化和地方性的生物群落,物种也经历了独特的适应性。在这里,我们描述了一种来自古巴西部生物多样性热点地区维尼亚莱斯地区的新狼蛛物种。尽管它是一种中等体型的物种,腿上有突出的大刚毛,让人想起树栖狼蛛,但系统基因组学分析、诊断性形态学特征和陷阱门撤退建造行为表明它是已知最大的 Trichope
Celaenorrhinus qianhanae Li & Li, C. aspersa Leech, 1891in H.-Z. Li, Liu et J.-L. Li. 2024. DOI: doi.org/10.11646/zootaxa.5405.2.6 摘要描述了来自中国海南的一个新种 Celaenorrhinus qianhanae Li & Liu sp. nov.。将其独特的生殖器特征和翅膀标记与来自该岛和邻近地区(包括越南和中国等)的其他同属物种进行了比较。此外,对其 COI 基因进行了测序以进行分子分析,并讨论了次生性特征,即后胫骨上的毛簇,以进行比较。鳞翅目,Tagiadi
Benchtop Instruments Bring About a Modern Age of NGS
Illumina 的 Emmanuel Naouri 讨论了有望支持新老下一代测序 (NGS) 用户的最新创新。
Breakthrough Genomic Test Can Diagnose Nearly Any Infection
加州大学旧金山分校开发的下一代宏基因组测序测试证明了其能够快速准确地诊断多种病原体的能力。加州大学旧金山分校开发的基因组测试能够快速识别几乎任何类型的病原体(包括病毒、细菌、真菌或寄生虫),经过十年的使用,已证明是成功的。该测试具有潜力 [...]
A Wastewater Surveillance Program Sounds the Alarm on Avian Influenza
一种病毒不可知论方法源于 COVID-19 大流行,它将测序研究与公共卫生相结合,以领先于禽流感传播。
Tylototriton koliaensis Poyarkov、Nguyen、S.X. Le、D.X. Le、Arkhipov、Gorin、Hernandez 和 Dufresnes,2024 Cao Bang 鳄蝾螈 || Researchgate.net/publication/385746634 facebook.com: Nguyen Van Tan 使用分子(线粒体 DNA、多位点基因组位点)和表型(形态、颜色、骨骼)分析,我们揭示了来自越南北部 Viet Bac 山脉的 Tylototriton asperrimus 种群的一种新的鳄蝾螈隐蔽种。该新种以前曾与 T. asperr
遗传条形码用于幽灵蜘蛛的物种识别和系统发育评估(蜘蛛亚科:Anyphaenidae:Amaurobioidinae)摘要蜘蛛物种的识别面临许多挑战,因为在大多数情况下,所使用的特征来自仅在成年阶段完全发育的生殖器结构,因此通常无法识别未成熟物种。此外,这些结构通常还存在一些种内变异性,这在某些情况下使得近亲物种的识别变得困难。基于线粒体标记细胞色素 c 氧化酶亚基 I (COI) 测序的遗传条形码技术 (DNA 条形码) 已被证明是一种有用的补充工具,可以克服这些限制。本研究使用精炼单链分析 (RESL) 算法划分操作分类单元 (OTU),并与自动分割组装物种 (ASAP) 算法进行比较,探讨
Leucheria peteroana Lavandero,Lavandero, Pérez et Pinilla, 2024。Leucheria DOI:10.3897/phytokeys.248.133202 照片由 Nicolás Lavandero 拍摄。摘要本文描述了一种新物种 Leucheria peteroana sp. nov.,它是智利中部安第斯山脉特定地区的特有物种。利用新测序的 nDNA 和 cpDNA 数据,重新研究了 Leucheria 和 Nassauvieae 中密切相关的分类群的系统发育亲缘关系。这个新物种表现出一组独特的特征,可以清楚地将其与 Leuche