GENOT: Entropic (Gromov) Wasserstein Flow Matching with Applications to Single-Cell Genomics
单细胞基因组学极大地促进了我们对细胞行为的理解,促进了治疗和精准医疗的创新。然而,单细胞测序技术本质上具有破坏性,只能同时测量有限的数据模式。这一限制凸显了对能够重新排列细胞的新方法的需求。最佳传输 (OT) 已成为一种有效的解决方案,但传统的离散求解器受到可扩展性、隐私和样本外估计问题的阻碍。这些挑战刺激了神经网络的发展……
Revvity Broadens Relationship with Genomics England to Advance Genomics in the UK
Revvity, Inc. 宣布扩大与 Genomics England 的合作,利用两个组织的专业知识和资源推动英国各地的关键基因组计划。基于双方长期而富有成效的工作历史,此次高级合作致力于加速 Genomics England 著名的研究项目,支持基因组学的不同领域,培养创新医疗领域的人才……
使用系统基因组学重新评估热带游走蜘蛛的进化关系:基于 UCE 的 Ctenidae (Araneae) 系统发育,发现新的狼蛛科摘要热带游走蜘蛛 (Ctenidae) 是一个多样化的游走捕食者科,其物种丰富度在热带地区达到顶峰。人们已经使用形态学和基于桑格的测序数据对 Ctenidae 的系统发育进行了研究,但这些研究受到分类单元采样的限制,并且通常为许多科内系统发育关系恢复了较低的分支支持。在此,我们使用基因组规模的数据展示了该科最广泛的系统发育采样,利用了来自世界各地的所有 ctenid 亚科的博物馆收藏。我们获得了 Ctenidae 的系统发育,大多数节点在不同的系统发育分析中显示出最大
Genomic Advances Promise New Era for Early Disease Detection in Infants
一项新研究表明,使用 DNA 分析进行新生儿筛查可以发现比传统方法更严重但可治疗的健康状况。这项名为 GUARDIAN 的研究是首批使用基因组测序进行新生儿筛查的大型项目之一,早期结果表明,这种方法可以大大改善儿童的医疗保健。早期 [...]
适应性辐射的群体基因组学:加那利群岛特有蜘蛛的遗传多样性和重组水平极高摘要蜘蛛属 Dysdera 在加那利群岛的海洋群岛中经历了显著的多样化,自群岛起源以来的 2000 万年间,约有 60 种特有物种出现。这种进化辐射伴随着大量的饮食变化,通常以表型改变为特征,包括形态、代谢和行为变化。因此,这些特有蜘蛛是了解进化驱动因素和确定适应性辐射背后的基因组决定因素的绝佳模型。最近,我们首次对特有物种之一 D. silvatica 进行了染色体水平的基因组组装,为进化基因组学研究提供了高质量的参考序列。在这里,我们对来自拉戈梅拉岛的 D. silvatica 自然种群进行了低覆盖率重测序研究。利用新的
The third era of genomics is at risk of being dismantled across the global south | Science
基因组学的第一个时代始于 1953 年沃森和克里克发表的关于 DNA 双螺旋结构的著名描述。这个时代持续了 50 年,直到 2003 年 4 月人类基因组的发表。第二个时代与……
数据来源:稳健的系统基因组学解决了分类争议并揭示了 Laufeia 进化枝(蜘蛛亚科、跳蛛科、真佛里蛛)雄性栓塞复合体的进化摘要Laufeia 进化枝是真佛里蛛属跳蛛的一个特殊谱系,其雄性生殖器结构表现出较高的分化,尤其是在精子转移过程中直接与雌性生殖器相互作用的栓塞复合体。随着 Laufeia 进化枝中物种发现的快速增长,其分类争议已成为一个关键问题。在本研究中,我们应用系统基因组学方法,使用超保守元素数据推断 Laufeia 进化枝的系统发生,并进行了广泛的分类单元采样。还进行了比较形态学研究,以评估诊断性状并了解 Laufeia 进化枝内雄性栓塞复合体的进化。结果为 Laufeia 进化
Alejandro Cruz Setzekorn: Realizing the power of genomics through data science
一名数据科学硕士生分析了基因的开启和关闭如何影响神经退行性疾病。
筏网蜘蛛和育苗网蜘蛛(蜘蛛亚目:Dolomedidae 和 Pisauridae)的系统发育、分类和生活方式进化摘要Pisauridae Simon, 1890 或“育苗网蜘蛛”是具有多种生活方式的全球异质蜘蛛属群落,包括结网蜘蛛和无网蜘蛛,以及陆生和半水生蜘蛛,尤其是“渔蛛”,即 Dolomedes Latreille, 1804 属。迄今为止,不完整、未解决或相互冲突的系统发育阻碍了对 Dolomedes 和 pisaurid 的单系性和进化性的测试。在这里,我们在系统发育和比较框架内广泛解决这些问题。我们的目标是 i) 重建一个强大的系统发育来测试 Dolomedes 和 Pisauri
Tackling the Challenges of Metagenomics with Nanopore Sequencing
纳米孔测序平台为研究人员提供了在现场快速测序长微生物核酸片段的自由。
基因组学和遗传学研究中经常使用种族、族裔和血统标签来描述人类遗传差异,这是误导性且不准确的。利用遗传和基因组数据的研究人员和科学家应该重新思考并证明他们在工作中如何以及为何使用这些描述符。
How Genomics Improve Cancer Survival and Patient Quality of Life: The Healthcare Triage Podcast
Bryan Schneider博士和Milan Radovich博士返回播客,分解个性化基因组医学的最新发展,分享其三重阴性乳腺癌研究的发现,并谈论他们当前和即将到来的乳腺癌研究,包括EAZ171和Persevere。这一事件由[…]基因组学如何改善癌症生存和患者生活质量的帖子赞助:医疗保健分类播客首次出现在偶然的经济学家上。Bryan Schneider博士和Milan Radovich博士返回播客,分解个性化基因组医学的最新发展,分享其三重阴性乳腺癌研究的发现,并谈论他们当前和即将到来的乳腺癌研究,包括EAZ171和Persevere。这一事件由[…]基因组学如何改善癌症生存和患者生活质量
Healthcare Triage Podcast. Know Thyself: Precision Genomics and Pediatric Cancer
在《医疗三角播客》的这一集中,亚伦正在与Karen Pollok博士和Jamie Renbarger博士讨论他们对使用个性化医学治疗骨肉瘤和其他儿科癌症的研究。您将了解细胞系的开发以及可用于战斗癌症的模型的创建。我们还将听到有关[…]后医疗分类播客的信息。知道自己:精确的基因组学和小儿癌首次出现在偶然的经济学家上。
Healthcare Triage Podcast: Breast Cancer, Genomics, and the Future of Treatment
医疗三角播客的下一集开始了!本月,我们谈论的是乳腺癌,特别是“三重阴性乳腺癌”:印第安纳大学健康精确基因组学计划的Bryan Schneider博士和Milan Radovich博士正在与Aaron谈论有关乳腺癌的问题,以及一些正在使用的最先进治疗,[…]医疗保健杂物播客:乳腺癌,GENMASS,GENMODS,以及未来的经济学经济学,这是事故的经济性。
The Million Veteran Program: VA's genomics game-changer launches nationwide
一项史无前例的退伍军人事务研究计划,有望推进复杂的研究
Hidden gene clusters in soil bacteria may hold key to bigger legumes
在一项新的研究中,科学家使用了工具包中的几乎所有工具(基因组学,转录组学,温室实验和先进的统计方法),以对地下根结节中发生的复杂化学相互作用进行新的见解,在地下根部根结节中,大豆(例如大豆)与称为Rhizobia的土壤微生物交换重要的养分。
Why Genetically Optimizing Embryos Is Misleading, Unethical—And Not Even Possible
一家基因组学公司说,他们可以帮助父母对胚胎进行“遗传优化”,这是聋哑硅谷的营销践踏合法科学。父母应该警惕