Transcription Activator-Like Effector Nucleases (TALENs) Explained
转录激活因子样效应核酸酶:全面概述转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN) 是可定制的基因组编辑工具,可将 TALE DNA 结合域与 FokI 核酸酶融合。它们以特定 DNA 序列为目标,诱导双链断裂,细胞通过非同源末端连接或同源定向修复进行修复。TALEN 具有高度特异性和多功能性,可用于功能基因组学、基因治疗和农业生物技术等不同领域的精确基因破坏、校正和插入。在本文中,我们将详细解释转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN) 基因编辑技术。我们介绍了 TALEN 的起源、结构、机制、应用、优势和局限性,以及它们与其他基因组编辑工具(如 CRISPR-Cas 系统和锌指核酸酶 (ZFN))的
Mapping Cells Through Time and Space With Moscot
单细胞基因组学技术能够在时间和空间维度上对数百万个细胞进行多模态分析。实验限制阻碍了在其原生时间动态或空间组织环境中测量包罗万象的细胞状态。最佳传输理论已成为克服此类限制的有力工具,能够恢复原始细胞环境。然而,目前大多数可用的算法实现都没有跟上数据集复杂性不断增加的步伐,因此当前的方法无法结合多模式……
Takara Bio USA Holdings, Inc.(“TBUSH”)今天宣布收购空间基因组学领域的先驱公司 Curio Bioscience。
Telmatochromis salzburgeri Indermaur, Schedel & Ronco, 2024 DOI:doi.org/10.1111/jfb.16042 摘要 长期以来,人们一直认为丽鱼科鱼类 Telmatochromis 属主要是湖泊栖息的,是坦噶尼喀湖的特有物种,直到卢夫布河(赞比亚坦噶尼喀湖流域)报道了一种未描述的 Telmatochromis 物种。2021 年的一项系统基因组学研究证实了 Telmatochromis sp。“lufubu”与 Telmatochromis 以及另一种河流物种 Neolamprologus devosi(坦桑尼亚马拉加拉西流域
蝎子的基因组规模系统发育:模型比较和位点间组成异质性建模摘要蝎子的进化史是一个备受关注的课题,蝎子是最具魅力的节肢动物群之一,已描述的物种超过 2,500 种。鉴于其独特的身体结构和古老的化石记录,了解其系统发育至关重要。最近的基因组规模数据已显示出阐明蝎子生命树中科间关系的潜力;然而,分子数据集之间也存在差异。为了解决这个问题,我们通过综合之前的三项系统基因组学研究,使用考虑位点间组成异质性的模型比较方法探索了蝎子的系统发育关系。我们的分析表明,在无限位点异质性 CAT 和有限混合模型下,蝎目内的关系与普遍结论有显著不同,尤其是关于布提达内的科间关系。我们的结果表明了以下关系:[Pseudo
Houttuynia cordata: Analyzing the genome behind the medicinal plant
鱼腥草,俗称鱼腥草,几个世纪以来一直是传统医学中的关键成分,因其类似抗生素的特性和治疗各种疾病的能力而受到重视。尽管它已被长期使用,但其药用化合物背后的遗传机制仍未得到充分探索。这一知识空白阻碍了其治疗潜力的充分发挥,迫切需要研究 H. cordata 的基因组学,以了解其生物碱的生物合成途径并揭示该植物的进化历史。
Syphilis originated in the Americas, ancient DNA shows, but European colonialism spread it widely
古基因组学终于解决了困扰研究人员数十年的一个问题:梅毒从何而来?
巨型醋栗 Mastigoproctus giganteus 的染色体水平基因组显示出前志留纪全基因组复制的特征摘要在蛛形纲动物中,染色体水平的基因组组装极大地加速了对蜘蛛 (Araneae)、螨虫和蜱 (Acariformes 和 Parasitiformes) 等关键群体的基因家族进化和发育基因组学的理解。其他缺乏基因组组装的蛛形纲动物目中,研究较少的目包括 Pedipalpi 进化枝,该进化枝由三个目组成,这三个目构成了蜘蛛的姊妹群,它们在 4 亿多年前分化。我们通过从醋栗 Mastigoproctus giganteus (Uropygi) 的单个标本生成第一个染色体水平的组装来弥补这一
Accelerate analysis and discovery of cancer biomarkers with Amazon Bedrock Agents
Bedrock 多代理协作使开发人员能够构建、部署和管理多个无缝协作的专用代理,以解决日益复杂的业务工作流。在这篇文章中,我们向您展示了 Amazon Bedrock Agents 的代理工作流如何通过自然语言界面帮助研究科学家加速这一旅程。我们定义了一个示例分析管道,特别是针对具有生物标志物临床、基因组学和成像模式的肺癌生存率。我们展示了各种专用代理,包括生物标志物数据库分析师、统计学家、临床证据研究员和医学成像专家与主管代理合作。我们展示了代理的自我审查和规划的高级能力,通过将复杂的任务分解为一系列步骤并展示生成最终答案的思路链,有助于与最终用户建立信任。
Personalized treatment and precision medicine
为什么重要:探索个性化治疗和精准医疗,重点关注基因组学、人工智能、慢性病护理和未来创新。
Tagomics Announces a Multiomic Profiling Co-Marketing Agreement with Agilent
Tagomics Ltd. 是一家开创性的生物标志物发现和诊断公司,该公司宣布已与基因组学领域领先的工具提供商安捷伦科技达成战略联合营销协议。该协议为特定客户提供了通过 Tagomics 位于剑桥的服务实验室举办的独家技术访问计划访问 Tagomics 和安捷伦科技联合创新产品的机会……
Bioeconomic Potential: Scientists Just Found 140 Reasons to Love Spider Venom
LOEWE 转化生物多样性基因组学中心 (TBG) 的研究人员发现蜘蛛毒液中存在大量酶,而此前人们关注的焦点是神经毒素,因此忽视了这些酶。这些酶分布在 140 个不同的家族中,由于其生化特性,它们可以为废物管理和洗涤剂制造提供可持续的解决方案,从而彻底改变行业。这一发现扩展了 [...]
澳大利亚巴布亚盲蛇属,Anilios in Tiatragul,Skeels et Keogh,2024。DOI:doi.org/10.1093/evolut/qpae132 x.com/PutterT 摘要 了解大陆辐射如何在空间和时间上组装是宏观进化生物学中的一个主要问题。在这里,我们使用系统基因组学规模的系统发育、全面的形态数据集和环境生态位模型来评估特征与环境之间的关系,并评估地理和生态位保守性在澳大利亚盲蛇大陆辐射中的作用。澳大利亚巴布亚盲蛇属 Anilios 包括 47 种已描述的物种,其中 46 种是澳大利亚大陆特有的,分布在澳大利亚大陆的各个生物群落中。虽然我们预计盲蛇在形态上
冈瓦纳遗迹还是新近到来?澳大利亚狼蛛的生物地理起源和系统学摘要澳大利亚动植物群的组成主要由两个生物地理过程组成,即替代和长距离扩散和建立。这些模式今天可以通过冈瓦纳谱系的生存与东南亚相对较新的殖民形成对比来观察。一般来说,来自东南亚的后冈瓦纳移民谱系是具有促进扩散特征的分类群。因此,像狼蛛(蜘蛛目、捕鸟蛛科)这样的分类群主要分布在热带地区,但扩散倾向较低,被认为是冈瓦纳起源。然而,澳大利亚狼蛛没有被采样用于系统基因组学研究,因此,它们的分类和生物地理起源一直存在争议,尚未解决。在这里,我们测试了它们目前基于形态学的 Selenocosmiinae 分类是否准确,并评估澳大利亚狼蛛在澳大利亚还是
New Research on the Evolution of Sexual Selection in Fruit Flies
《自然》杂志发表的新研究“果蝇性选择精子装饰和雌性偏好的基因组学”为精子的进化提供了新线索 雪城大学生殖进化中心的研究人员发表了一篇论文,提供了见解……
Trichopelma grandeOrtiz & Fonseca, 2024 DOI:doi.org/10.1080/00222933.2024.2401921 摘要大安的列斯群岛体型庞大、气候热带、地形复杂,加上数百万年的孤立,使其成为自然进化的实验室。这些岛屿上的多个物种经历了爆炸式的多样化,形成了高度多样化和地方性的生物群落,物种也经历了独特的适应性。在这里,我们描述了一种来自古巴西部生物多样性热点地区维尼亚莱斯地区的新狼蛛物种。尽管它是一种中等体型的物种,腿上有突出的大刚毛,让人想起树栖狼蛛,但系统基因组学分析、诊断性形态学特征和陷阱门撤退建造行为表明它是已知最大的 Trichope