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TOPMed 中表达和剪接数量性状位点的跨队列分析 |科学

Cross-cohort analysis of expression and splicing quantitative trait loci in TOPMed | Science

假设大多数与复杂性状相关的遗传变异可以调节基因表达。为了了解基因表达变异性背后的遗传学原理,我们对来自 Trans-Omics for Precision 的 14,324 个 RNA 测序样本进行了表征……

利用 AlphaGenome 推进调控变异效应预测

Advancing regulatory variant effect prediction with AlphaGenome

根据 DNA 序列预测功能基因组测量结果的深度学习模型是破译遗传调控密码的强大工具。现有方法涉及输入序列长度和预测分辨率之间的权衡,从而限制了它们的模态范围和性能1,2,3,4,5。我们推出了 AlphaGenome,这是一个统一的 DNA 序列模型,它以 1 Mb 的 DNA 序列作为输入,并通过不同的模式预测数千个功能基因组轨迹,最高可达单碱基对分辨率。这些模式包括基因表达、转录起始、染色质可及性、组蛋白修饰、转录因子结合、染色质接触图、剪接位点使用以及剪接连接坐标和强度。 AlphaGenome 在人类和小鼠基因组上进行训练,在 26 项变异效应预测评估中的 25 项中匹配或超过了最强的

新热带森林的小恶魔:利用 UCE 博物馆组学和千兆矩阵方法对 stygnid 收割者进行第一个分子系统发育(Arachnida、Opiliones、Stygnidae)

Little devils of Neotropical forests: A first molecular phylogeny of stygnid harvestmen with UCE-museomics and a gigamatrix approach (Arachnida, Opiliones, Stygnidae)

新热带森林的小恶魔:利用UCE-博物馆组学和千兆矩阵方法对斯汀类收割者进行第一个分子系统发育(蛛形纲、Opiliones、Stygnidae)摘要新热带收割者斯汀科以其独特的形态和显着的多样性,长期以来引起了分类学的关注,但其内部关系和传统的基于形态的分类系统在很大程度上尚未经过分子数据的检验。在这里,我们使用来自新鲜和历史标本的超保守元素位点,以及整合遗留标记数据的千兆矩阵,重建了第一个全科的斯蒂格尼达科系统发育框架。我们恢复了一个得到充分支持的Stygnidae分支,包括六个主要谱系。尽管由短深节间的严重不完全谱系排序(ILS)驱动的系统发育冲突使基础关系的最终解决变得复杂,但我们的下游分

[真菌 • 2026] Pleurocordyceps cornusynnemata • 与马来西亚蚂蚁和蝉相关的侧虫草(Hypocreales:Polycephalomycetaceae)的分类学和系统发育,包括新物种和新记录

[Fungi • 2026] Pleurocordyceps cornusynnemata • Taxonomy and Phylogeny of Pleurocordyceps (Hypocreales: Polycephalomycetaceae) associated with Ants and Cicadas from Malaysia, including A New Species and New Records

Pleurocordyceps cornusynnemata in Shahbaz, Mohadden, Rong, Wei et Seelan, 2026. DOI: doi.org/10.11646/phytotaxa.750.4.1 摘要Pleurocordyceps 是一组感染无脊椎动物、植物和其他真菌的超寄生虫。它属于多头菌科 (Polycephalomycetaceae),是从蛇虫草科 (Ophiocordycipitaceae) 肉座菌目 (Hypocreales) 中分离出来的一个新科,该科包括 Dingleyomyces、Paradingleyomyces、Perennico

银纳米颗粒可实现精确的 DNA 切割和连接

Silver Nanoparticles Permit Precise DNA Cutting and Joining

EurekAlert! DNA 由长链组成,是生物体的蓝图。在基因工程中,科学家在特定位点切割 DNA,并将所得片段连接到...