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ToxIR:用于高精度毒素转录组分析的准确 RNA-seq 管道,已在 odontobuthus doriae 毒腺中得到验证

ToxIR: an accurate RNA-seq pipeline for high-precision toxin transcriptome profiling, validated in odontobuthus doriae venom glands

ToxIR:用于高精度毒素转录组分析的准确 RNA-seq 管道,已在 odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。由于组装错误、亚型多样性和注释偏差,复杂组织的转录组分析仍然具有挑战性,需要优化计算管道。蝎毒是生物活性肽的宝库,具有巨大的生物医学潜力,但其复杂性使转录组分析变得复杂。我们推出了 ToxIR(毒素识别和识别),这是一种针对精确毒素转录组分析而优化的 RNA-seq 管道,并在 Odontobuthus doriae 毒腺中得到验证。 ToxIR 结合了深度测序、基于 rnaSPAdes 的从头组装和定制注释策略,甚至可以检测低丰度毒素并高精度解析同种型。它结合了严格