在这本写得精彩的书中,贝丝·夏皮罗有力地论证了合成生物学的道德责任。她认为,基于 CRISPR 的基因编辑工具和其他技术不仅能让我们应对气候、粮食和生物多样性危机,而且这些技术还有机会拯救我们免于流行病。她以对生命的深刻进化观来支持自己的观点——她研究古代 DNA——并且像在实验室里用新技术和分析推动自己的领域发展一样,在田野里四处寻找化石和亚化石(字面意思!)。简而言之,她的论点是,人类至少已经驯化了 50,000 年的动物和植物。其中一些驯化依赖于动物对我们变得宽容并最终建立互利关系,如狼对狗的驯化。其他则涉及我们选择我们认为有用的某些特征,如许多食用植物和我们吃的动物。然而,她认为,由于这种人工选择适用于现有变异,因此在某种意义上是“自然的”,因此它是一种无趣的工具。然而,合成生物学是一个装满锋利工具的工具箱。我们可以使用同源基因操作加速物种内现有变异的选择,或者我们可以创造真正新颖的转基因生物,将不同谱系的特征结合起来。为什么需要转基因操作?她开始概述我所关注的一个问题——人为驱动的灭绝。我在研究生院参加的最好的研讨会集中在马丁和克莱因(1984)关于灭绝的大型编辑书中,我们讨论了似乎与人类扩张有关的快速灭绝的原因。每个人都有相同的数据,但人们对马丁的更新世过度杀戮假说的解释引发了激烈的争论。夏皮罗用许多新的观点更新了这个近40年的论点
结果:我们从小鼠狐猴中得出成纤维细胞系,将其暴露于紫外线照射,并使用XR-SEQ方案分析了整个修复事件的全基因组。小鼠狐猴修复曲线。我们发现两个灵长类动物之间的总体UV敏感性,维修效率和转录耦合修复水平有所不同。尽管如此,对人和小鼠狐猴成纤维细胞的比较分析表明,同源区域的全基因组修复谱是高度相关的,并且对于高表达基因而言,这种相关性更强。在分析中包含了从另一个人类细胞系中得出的附加XR-Seq样品,我们发现两个灵长类动物的成纤维细胞以比两种不同的人类细胞系更相似的模式修复了紫外线诱导的DNA病变。结论:我们的结果表明,小鼠狐猴和人类及可能的灵长类动物共享同源修复机制以及基因组方差分布,尽管其可变修复效率。该结果还强调了整个真核系统发育中各个组织类型的深层同源性。