摘要:抗体-药物偶联物 (ADC) 是一种快速兴起的治疗平台。抗体和药物有效载荷之间的化学接头在这些药物的功效和耐受性中起着至关重要的作用。定量评估复杂组织环境中的裂解效率的新方法可以为 ADC 设计过程提供有价值的见解。在这里,我们报告了一种近红外 (NIR) 光学成像方法的开发,该方法可以测量小鼠模型中接头裂解的位置和程度。这种方法是由我们最近设计的花青氨基甲酸酯 (CyBam) 平台的优越变体实现的。我们发现了一种新型的含叔胺的去青花青,这是 CyBam 裂解的产物,由于细胞通透性和溶酶体积累的改善,其细胞信号显著增加。由此产生的花青溶酶体靶向氨基甲酸酯 (CyLBams) 在细胞中的亮度约为 50 倍,我们发现这种策略对于高对比度体内靶向成像至关重要。最后,我们在两种抗体和肿瘤模型中比较了几种常见的 ADC 接头。这些研究表明,蛋白酶可裂解接头比受阻或不受阻的二硫键具有更高的肿瘤活化作用 - 这一观察结果只有在体内成像中才能明显看出。该策略可以定量比较复杂组织环境中的可裂解接头化学性质,对整个药物递送领域都有影响。
图3 T14可能驱动阿尔茨海默氏病的过程概述13,44:(a)T14信号传导途径:(1)T14与表达α7烟碱受体的神经元结合,增强α7烟碱受体(增强钙)(2)引起(2)引起的(3)降解型和活性的伏击燃料敏感敏感钙通道。(4)钙异常触发GSK-3激活,导致(5)MTOR1激活触发(6)从细胞内存储中释放的ACHE,例如,树突平滑的内质网延伸到细胞外空间中;随后(7)蛋白酶,例如,IDE56从ACHE裂解T14。(8)T14扩散到突触外空间上以作用于α7受体,从而使邻近细胞的循环永存。缺乏含T14的二硫键,G1单体无法将其寡聚为G4(ACHE),这是它们在发育中的优势和AD水平的增加。mTOR1触发(9)tau磷酸化和(10)β-淀粉样蛋白从APP中裂解,(10)释放β-淀粉样蛋白,增强了T14的毒性。44(12)T14诱导的钙逐渐引起靶表面α7受体的增殖,从而进一步增强了T14作用。增强的钙涌入导致(13)钙吸收到线粒体中并减少ATP合成,导致电子泄漏,触发(14)细胞色素C释放,然后caspase-3激活,随后增加(15)自由基和(16)细胞死亡。因此(17)膜分解
c-MET 是一种酪氨酸激酶受体,具有通过二硫键连接的胞外 α 链和跨膜 β 链。在稳定状态下,该受体主要存在于上皮细胞中,它在细胞中调节细胞运动和增殖 (1)。c-MET 的配体是肝细胞生长因子 (HGF),它由间充质细胞以无活性形式产生 (1)。HGF 的激活需要丝氨酸蛋白酶的作用,这发生在组织损伤的局部区域 (2)。已证实多种人类癌症中存在异常的 c-MET 信号转导,这是由于 c-MET 受体过表达、受体突变或扩增、HGF 过表达或形成异常的自分泌信号转导所致的 (3)。癌症中的 c-MET 激活会促进;间充质细胞和上皮细胞之间的通讯、组织浸润、癌细胞增殖和血管生成诱导(1、4-6)。此外,选择性抑制或 SiRNA 敲低 c-MET 可降低非小细胞肺癌 (NSCLC) 细胞的活力,表明 c-MET 可直接促进肿瘤生长 (7)。在肺腺癌中,已发现各种错义突变和可变剪接产物。这些包括外显子 14 剪接突变,它导致受体降解减少和 c-MET 受体激活延长,据报道发生在 3% 的肺腺癌和 2.3% 的其他肺肿瘤中 (8)。Frampton 等人进行的体外研究支持以下结论:外显子 14 剪接突变的肿瘤将对抗 c-MET 疗法有反应。来自三例患者的病例报告也提供了有限的临床数据来支持这一结论(8)。还有
目的:紫杉醇 (PTXL) 和吉西他滨 (GEM) 的序贯治疗被认为对非小细胞肺癌具有临床益处。本研究旨在研究能够在癌细胞内顺序释放 PTXL 和 GEM 的纳米系统的有效性。方法:PTXL-ss-聚(6-O-甲基丙烯酰-d-半乳吡喃糖)-GEM (PTXL-ss-PMAGP-GEM) 是通过二硫键 (-ss-) 将 PMAGP 与 PTXL 结合而设计的,而 GEM 则通过琥珀酸酐 (PTXL:GEM=1:3) 结合。两亲性嵌段共聚物 N-乙酰-d-葡萄糖胺 (NAG)-聚(苯乙烯-alt-马来酸酐) 58 -b-聚苯乙烯 130 充当靶向部分和乳化剂,用于形成纳米结构 (NLC)。结果:PTXL-ss-PMAGP-GEM/NAG NLC(119.6 nm)在体外依次释放 PTXL(氧化还原触发),然后是 GEM(pH 触发)。氧化还原和 pH 敏感的 NLC 很容易均匀分布在细胞质中。NAG 增强了癌细胞对 NLC 的吸收和肿瘤的积累。与缺乏 pH/氧化还原敏感性或游离药物组合的 NLC 相比,PTXL-ss-PMAGP-GEM/NAG NLC 在体外表现出协同细胞毒性,并且在肿瘤小鼠中具有最强的抗肿瘤作用。结论:本研究证明了 PTXL-ss-PMAGP-GEM/NAG NLC 能够通过靶向细胞内顺序释放药物实现协同抗肿瘤作用。关键词:顺序释放、氧化还原敏感、pH 敏感、协同效应、联合药物输送、吉西他滨、紫杉醇
c-MET 是一种酪氨酸激酶受体,具有通过二硫键连接的胞外 α 链和跨膜 β 链。在稳定状态下,该受体主要存在于上皮细胞中,它在细胞中调节细胞运动和增殖 (1)。c-MET 的配体是肝细胞生长因子 (HGF),它由间充质细胞以无活性形式产生 (1)。HGF 的激活需要丝氨酸蛋白酶的作用,这发生在组织损伤的局部区域 (2)。已证实多种人类癌症中存在异常的 c-MET 信号转导,这是由于 c-MET 受体过表达、受体突变或扩增、HGF 过表达或形成异常的自分泌信号转导所致的 (3)。癌症中的 c-MET 激活会促进;间充质细胞和上皮细胞之间的通讯、组织浸润、癌细胞增殖和血管生成诱导(1、4-6)。此外,选择性抑制或 SiRNA 敲低 c-MET 可降低非小细胞肺癌 (NSCLC) 细胞的活力,表明 c-MET 可直接促进肿瘤生长 (7)。在肺腺癌中,已发现各种错义突变和可变剪接产物。这些包括外显子 14 剪接突变,它导致受体降解减少和 c-MET 受体激活延长,据报道发生在 3% 的肺腺癌和 2.3% 的其他肺肿瘤中 (8)。Frampton 等人的体外研究支持外显子 14 剪接突变肿瘤将对抗 c-MET 疗法有反应的结论。来自三例患者的病例报告也提供了有限的临床数据来支持这一结论(8)。还有
二维二硫键(WS 2)作为具有独特层依赖性电子和光电特性的半导体材料,在光电设备领域表现出了有希望的应用前景。晶圆尺度单层WS 2膜的制造目前是一个至关重要的挑战,可以推动其在高级晶体管和集成电路中的应用。化学蒸气沉积(CVD)是一种可行的技术,用于制造大面积,高质量的单层WS 2膜,但其生长过程的复杂性导致低生长效率和WS 2的薄膜质量不一致。为了指导实验性努力以减少WS 2中的晶界,从而提高了膜质量以提高电子性能和机械稳定性,本研究通过第一原则理论计算研究了CVD增长过程中WS 2的成核机制。通过将化学势视为关键变量,我们在不同的实验条件下分析了WS 2的生长能曲线。我们的发现表明,调节钨和硫的前体的温度或压力可以决定性地影响WS 2的成核速率。值得注意的是,成核速率在1250 K的钨源温度下达到峰值,而硫源温度的升高或压力降低可以抑制成核速率,从而增强单层WS 2的结晶度和均匀性。这些见解不仅为根据需要在实验中微调核定率提供了强大的理论基础,而且还提供了优化实验参数以完善单层WS 2膜的结晶度和均匀性的战略指导。这些进步有望在一系列高性能电子设备中加速WS 2材料的部署,这标志着材料科学和工业应用领域的显着迈步。
抽象目的:VIIA因子是一种糖基化的二硫键异二聚体,属于涉及凝结过程的丝氨酸蛋白酶家族。抑制VIIA因子是新型抗凝剂的关键靶标之一。 凝血因子VIIA抑制作用最近引起了人们的关注,作为一种有趣的抗血栓治疗策略。 借助X射线晶体学和基于结构的设计,我们能够发现一系列新型的N-苯基-2-(苯基 - 氨基)乙酰酰胺衍生物,对因子VIIA具有显着的亲和力。 材料和方法:22种化合物的合成是基于Schotten-Baumann反应。 通过物理,光谱和元素分析证实了合成的化合物。 使用凝血酶原测定法评估了体外,抗凝活性。 结果:化合物4、7、15、16和19在体外表现出良好的抑制性抗凝活性,并且在硅中显示出良好的对接得分。 n-苯基-2-(苯基氨基)乙酰酰胺为合成新型和有效的抗凝衍生物的合成提供了良好的模板。 结论:N-苯基-2-(苯基氨基)乙酰胺衍生物可以用作凝结疾病的潜在药物化合物。 这项研究的目的是利用硅分子对接和体外抗凝剂活性,以增强效力设计和合成基于结构的新因子VIIA抑制剂。抑制VIIA因子是新型抗凝剂的关键靶标之一。凝血因子VIIA抑制作用最近引起了人们的关注,作为一种有趣的抗血栓治疗策略。借助X射线晶体学和基于结构的设计,我们能够发现一系列新型的N-苯基-2-(苯基 - 氨基)乙酰酰胺衍生物,对因子VIIA具有显着的亲和力。材料和方法:22种化合物的合成是基于Schotten-Baumann反应。通过物理,光谱和元素分析证实了合成的化合物。使用凝血酶原测定法评估了体外,抗凝活性。结果:化合物4、7、15、16和19在体外表现出良好的抑制性抗凝活性,并且在硅中显示出良好的对接得分。n-苯基-2-(苯基氨基)乙酰酰胺为合成新型和有效的抗凝衍生物的合成提供了良好的模板。结论:N-苯基-2-(苯基氨基)乙酰胺衍生物可以用作凝结疾病的潜在药物化合物。这项研究的目的是利用硅分子对接和体外抗凝剂活性,以增强效力设计和合成基于结构的新因子VIIA抑制剂。
摘要 表皮生长因子 (EGF) 可诱导非肿瘤大鼠肾成纤维细胞在细胞培养中发生转化表型,这些转化表型是从成年小鼠的许多非肿瘤组织(包括颌下腺、肾脏、肝脏、肌肉、心脏和大脑)中分离出来的。它们与之前描述的从肿瘤细胞中分离出来的转化生长因子 (TGF) 类似,具体如下:它们可通过酸/乙醇提取,并且是酸稳定的低分子量 (6000-10,000) 多肽,需要二硫键才能起作用,并且它们会导致非肿瘤指示细胞的锚定非依赖性生长,而这些细胞在没有它们的情况下不会在软琼脂中生长。从雄性小鼠的颌下腺中对这些 TGF 进行部分纯化,结果表明它们不同于 EGF。与之前描述的细胞外 TGF 不同,但与来自肿瘤细胞的某些细胞 TGF 一样,它们通过 EGF 增强其促进锚定非依赖性生长的能力。颌下腺 TGF 蛋白的等电点接近中性。在 Bio-Gel P-30 上进行色谱分析,然后进行高压液相色谱分析,总纯化率达到 22,000 倍。在 EGF 存在下进行测定时,最纯化的蛋白质在 1 ng/ml 的软琼脂中具有诱导生长的活性。这些数据进一步证明了肿瘤形成可能是由非肿瘤生化过程的定量而非定性改变引起的。我们最近描述了 (1) 从几种肿瘤小鼠组织(包括由莫洛尼肉瘤病毒 (MSV) 转化的成纤维细胞和最初由化学致癌物诱导的可移植膀胱癌)中分离和表征一组低分子量、酸稳定性多肽(称为转化生长因子 (TGF))。这些多肽是可通过酸/乙醇提取的细胞内蛋白质。类似的细胞外转化多肽,称为肉瘤生长因子 (SGF),是由 De Larco 和 Todaro (2) 从培养的 MSV 转化小鼠成纤维细胞的条件培养基中首次分离出来的。最近报道了几种其他细胞外转化多肽,它们来源于人类 (3) 和动物 (4) 来源的肿瘤细胞。所有这些多肽在应用于培养的未转化、非肿瘤指示细胞时都会引起以下一系列变化,这些变化为 TGF 提供了一个操作性定义:(i) 单层细胞密度依赖性生长抑制的丧失;(ii) 单层细胞过度生长;(iii) 细胞形状改变,导致指示细胞呈现肿瘤表型;(iv) 获得锚定独立性,从而能够在软琼脂中生长。未转化的非肿瘤细胞不会在软琼脂中形成逐渐生长的菌落,并且培养细胞的这种不依赖锚定的生长特性与体内肿瘤的生长具有特别高的相关性(5-7)。
Miele博士在意大利完成了他在柏林的Max-Planck分子遗传学研究所的研究生培训。然后,他在NIH(NICHD)完成了人类遗传学研究金。在那里,他发展了:1)来自人子宫蛋白/CC10的药理学活性肽; 2)新型表达载体产生天然临床级二硫键键入的人蛋白和3)PCR-Elisa的早期版本,用于量化患者血液中正常和突变的DNA。在1994年,他搬到了FDA/CBER,担任单克隆抗体和临床试验设计和分析部成员的高级研究员。他最终被提升为Cell Biology的代理主管。Miele博士合着了1997年的积分,以在单克隆抗体产品的制造和测试中考虑。在CBER,1994年,他开始研究当时最近发现的人类缺口基因。Notch途径基因控制正常发育和成人生活期间的细胞命运测定,并且在肿瘤生物学,血管生成和免疫系统中具有重要作用。1998年,Miele博士移居洛约拉大学的贝纳丁癌症中心,在那里他发现了白血病细胞中Notch1的抗凋亡活性。 同时,他创建并监督了分子病理核心。 2001年,Miele博士移居伊利诺伊大学芝加哥大学,担任癌症中心的计划主任和生物制药科学副教授。 在UIC,Miele博士确定Notch1对于RAS诱导的人类细胞转化是必要的,并且在乳腺癌中表达。1998年,Miele博士移居洛约拉大学的贝纳丁癌症中心,在那里他发现了白血病细胞中Notch1的抗凋亡活性。同时,他创建并监督了分子病理核心。2001年,Miele博士移居伊利诺伊大学芝加哥大学,担任癌症中心的计划主任和生物制药科学副教授。 在UIC,Miele博士确定Notch1对于RAS诱导的人类细胞转化是必要的,并且在乳腺癌中表达。2001年,Miele博士移居伊利诺伊大学芝加哥大学,担任癌症中心的计划主任和生物制药科学副教授。在UIC,Miele博士确定Notch1对于RAS诱导的人类细胞转化是必要的,并且在乳腺癌中表达。在UIC,Miele博士确定Notch1对于RAS诱导的人类细胞转化是必要的,并且在乳腺癌中表达。2005年,他回到洛约拉(Loyola),担任完整的教授,乳腺癌计划主任,最终是转化科学癌症中心副主任。2009年,Miele博士被任命为UMMC癌症研究所和埃尔贡医学教授。 他一直担任该职位,直到搬到新奥尔良LSU Health。2009年,Miele博士被任命为UMMC癌症研究所和埃尔贡医学教授。他一直担任该职位,直到搬到新奥尔良LSU Health。
2009年的计算结构生物信息学研讨会11月1日,华盛顿特区http://www.cs.nmsu.edu.edu/~dsi/~dsi/~dsi/~dse/bioworkshop09该节目8-8:15 AM海报设置8:15 - 15-15-15-10am seess 1 am 1 am 1 am seccort 1 am everal:ableviciary kepress/ableviciary Room,ableviciary Room,phromist y 8月8日,8点; 1。“具有稀疏精确距离数据的蛋白质结构测定的有效的几何堆积算法” Robert Davis,Claus Ernst和Di Wu 2。“追踪蛋白质的构象变化” Nurit Haspel,Mark Moll,Matthew Baker,Wah Chiu和Lydia Kavraki 3。“使用序列曲线中心的GAMC方法对蛋白质长距离接触的预测” Peng Chen和Jinyan li 4。“用于蛋白质波动动力学和构象的通用弹簧张量模型变化” tu-liang lin和guang歌曲5。“一种用于寻找蛋白质分子构象的人造骨架” Carlile Lavor,Antonio Mucherino,Leo Liberti和Nelson Maculan 10:00-10:00-10:15 AM咖啡休息10:15-115-115-12:15 PM Sessight 2 pm Sessight 2 pm sessect 2 pm,每位演讲者:18分钟 + 2 -Minute Talks + 2 Minte “ Sidechain各向异性对残留接触确定的影响” Weitao Sun和Jing He 7。 “蛋白质蛋白质相互作用的计算测试” Ataur Katebi,Andrzej Kloczkowski和Robert Jernigan 8。 “嗜热和嗜嗜蛋白的歧视” Todd Taylor9。 “基于序列的B细胞表位通过使用抗体 - 抗原结构复合物中的关联” Liang Zhao和Jinyan li10。 “匹配观察到的α螺旋长度与预测的二级结构” Brian Cloteaux和Nadezhda Serova11。“ Sidechain各向异性对残留接触确定的影响” Weitao Sun和Jing He 7。“蛋白质蛋白质相互作用的计算测试” Ataur Katebi,Andrzej Kloczkowski和Robert Jernigan 8。“嗜热和嗜嗜蛋白的歧视” Todd Taylor9。“基于序列的B细胞表位通过使用抗体 - 抗原结构复合物中的关联” Liang Zhao和Jinyan li10。“匹配观察到的α螺旋长度与预测的二级结构” Brian Cloteaux和Nadezhda Serova11。“与核小体DNA相关的周期性如何反映其内在曲率?”Murlidharan Nair 12:15-1:15pm午餐休息时间1:15-2:15pm海报会议2:15-3:55 PM会议3(内阁/司法室,每个20分钟,每个)12。“使用质谱数据的多项式二硫键确定” William Murad,Rahul Singh和Ten-Yang Yen13。“使用迭代TM得分的蛋白质结构的密度分类” David Hoksza和Jakub Galgonek 14。“用于蛋白质表面对齐的全球优化算法” Paola Bertolazzi,Concettina Guerra和Giampaolo Liuzzi 15。“ FCC-HP蛋白模型中折叠的上限” Abu Dayem Ullah和Kathleen Steinhofel 16。“氨基酸相互作用网络中的节点分布” Omar Gaci和Stefan Balev 3:55 PM关闭言论