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Hoedjes 等人 2023 MBE.pdf
单核苷酸多态性是最常见的遗传变异类型，但这些变异如何有助于复杂表型的适应仍不清楚。实验进化和全基因组关联研究表明，PPAR γ 同源物 Eip75B 的变异与果蝇 (Drosophila melanogaster) 的寿命和生活史差异有关。使用 RNAi 敲低，我们首先证明成年果蝇中 Eip75B 表达的降低会影响寿命、产卵率和卵量。然后，我们通过应用两种互补方法测试了 Eip75B 顺式调控域内自然发生的 SNP 的影响：使用果蝇遗传参考面板的品系的孟德尔随机化方法，以及使用精确的 CRISPR/Cas9 诱导基因组编辑的等位基因替换。我们的实验表明，这种天然多态性对繁殖力和卵到成虫的生存能力具有显着的多效性影响，但对寿命或其他生活史特征没有影响。我们的研究结果在核苷酸水平上提供了罕见的功能验证，并确定了影响适应性和生活史适应性的天然等位基因变异。
Cav-1 :: GFP在C. exkemans中的内源表达和定位
小窝蛋白是负责形成口洞的整体膜蛋白，与各种疾病状态相关的质膜的内陷（Parton等人2020）。在秀丽隐杆线虫中，有两个小窝蛋白Cav-1和cav-2。CAV-1基因与所有三个哺乳动物小窝蛋白基因共享同源性（Tang等人1997）。 秀丽隐杆线虫Cav-1蛋白似乎并不形成小窝，但是Cav-1和Cav-2的双敲击突变体会影响产卵，而Cav-1的敲低会影响动态突变体背景中的运动（Parker等人 。 2007，Kirkham等。 2008，Sato等。 2008）。 基于外源表达，Cav-1 :: GFP众所周知，众所周知，卵形颗粒和质膜中的质膜和早期胚胎，在后来的胚胎中，质膜，以及幼虫和成人蠕虫中的神经肌肉系统（Sato等）（Sato等。 2006，Bembenek等。 2007，Parker等。 2007）。1997）。秀丽隐杆线虫Cav-1蛋白似乎并不形成小窝，但是Cav-1和Cav-2的双敲击突变体会影响产卵，而Cav-1的敲低会影响动态突变体背景中的运动（Parker等人。2007，Kirkham等。 2008，Sato等。 2008）。 基于外源表达，Cav-1 :: GFP众所周知，众所周知，卵形颗粒和质膜中的质膜和早期胚胎，在后来的胚胎中，质膜，以及幼虫和成人蠕虫中的神经肌肉系统（Sato等）（Sato等。 2006，Bembenek等。 2007，Parker等。 2007）。2007，Kirkham等。2008，Sato等。 2008）。 基于外源表达，Cav-1 :: GFP众所周知，众所周知，卵形颗粒和质膜中的质膜和早期胚胎，在后来的胚胎中，质膜，以及幼虫和成人蠕虫中的神经肌肉系统（Sato等）（Sato等。 2006，Bembenek等。 2007，Parker等。 2007）。2008，Sato等。2008）。 基于外源表达，Cav-1 :: GFP众所周知，众所周知，卵形颗粒和质膜中的质膜和早期胚胎，在后来的胚胎中，质膜，以及幼虫和成人蠕虫中的神经肌肉系统（Sato等）（Sato等。 2006，Bembenek等。 2007，Parker等。 2007）。2008）。基于外源表达，Cav-1 :: GFP众所周知，众所周知，卵形颗粒和质膜中的质膜和早期胚胎，在后来的胚胎中，质膜，以及幼虫和成人蠕虫中的神经肌肉系统（Sato等）（Sato等。2006，Bembenek等。 2007，Parker等。 2007）。2006，Bembenek等。2007，Parker等。 2007）。2007，Parker等。2007）。2007）。
使用量子计算有效的光源放置\\
当您想在玩视频游戏时，您宁愿放弃他们的想法时，遇到的科学问题很有趣，尽管当然，在这个域中遇到它们并不令人惊讶。视频游戏本质上构成了各种各样的问题，这些问题希望能够解决这些问题，例如杀死敌人，穿越迷宫或解决逻辑难题。一些游戏甚至被证明是NP -Complete [1]。但是，在Minecraft中遇到它们是一个温和的惊喜，Minecraft是Mojang开发的一个异常宁静的开放世界沙盒游戏，并于2010年首次出版1。在Minecraft中，玩家可以在广阔的世界中漫游，其中包含完全由立方体块组成的山脉，海洋和洞穴，从而使游戏具有独特而略有复古的视觉质量（见图。1）。该游戏因促进儿童（和成人）的创造力而受到称赞，甚至被用作教学工具[2]。然而，在洞穴的黑暗中，敌对的怪物可以在阳光或光源（例如火炬或灯笼）点亮的块上产卵。这些怪物将攻击玩家，因此，他们想在探索时尽可能地尽可能地点亮黑暗区域。同时，建筑火炬需要宝贵的资源，这就是为什么
孤雌生殖竹节虫的开创性基因组编辑
竹节虫 Medauroidea extradentata 的孤雌生殖生命周期为转基因品系的产生提供了独特的优势，因为原则上在第一代就可以实现同源且稳定的转基因品系。然而，到目前为止，用于操纵其基因的遗传工具尚未开发出来。在这里，我们成功地实施了 CRISPR/Cas9 技术来修改竹节虫 Medauroidea extradentata 的基因组。作为概念验证，我们针对参与眼色素沉着的 ommochrome 途径的两个基因（朱砂和白色，分别为第二和第一外显子）以产生敲除 (KO) 突变体。产卵后 24 小时内进行微注射，重点关注单细胞（和单倍体）发育阶段。产生的 KO 导致朱砂和白色的眼睛和角质层颜色表型不同。纯合朱砂突变体的眼睛和表皮呈现淡色色素沉着，而纯合白色 KO 导致发育中的胚胎完全无色素表型。总之，我们表明 CRISPR/Cas9 可以成功应用于 M. extradentata 的基因组，从而产生表型不同且可存活的动物。现在可以使用这种遗传工具箱，利用孤雌生殖非模式生物创建稳定的转基因品系。
HSUS报告：生产力的卵子母鸡的福利问题
HSUS报告：选择性繁殖卵母鸡的福利问题，用于生产力的生产力抽象的当今商业铺设母鸡每年有选择性地产生250多个鸡蛋。这种非自然的生产率水平是代谢征税的，通常会导致母鸡患有“生产疾病”，包括骨质疏松症和伴有骨骼骨折，并可能导致生殖疾病。研究表明，骨质疏松症的问题可能正在恶化，这可能是由于行业不断促进生产力最大化的问题。数十年来，经济考虑因素被评估并强调了单个鸟类的福利。需要立即更改优先事项，以积极解决与卵子产量选择性育种相关的福利问题。在2008年在美国引言，超过768亿个鸡蛋1由约2.8亿头母鸡产生，其中2个主要在贫瘠的，限制性的电池笼中产生。3个用于商业铺设母鸡的育种计划通常集中在饲料效率和生产力上，并大大改变了鸟类的外向率。的确，当今商业品种的野生祖先红色丛林禽每年只产生10-15个鸡蛋。4在20世纪初，母鸡每年产生100个鸡蛋，5个鸡蛋，但今天的母鸡平均每年产卵266个鸡蛋，其中一些产生300次或以上。6这些轻量级的鸟类维持其高产卵率1 - 2年，在第一个铺设周期后，卵的大小增加。14,15育种母鸡的生产力繁殖，而无需适当考虑动物的福利或作为人工选择相关副作用而发生的疾病是卵工业的重要而基本的动物福利问题。*骨质疏松症在2004年，据估计，80-89％的商用卵母鸡患有骨质疏松症，7一种疾病，其特征是骨骼体积和矿化的改变。8,9骨是用于蛋壳生产中钙的代谢储存库，从骨骼到蛋壳的钙将母鸡易于骨质疏松症，随后的骨骼脆弱性和骨折。10在一年中，母鸡沉积在蛋壳中的钙量最多可以是她体内保留的钙的20倍。11骨质疏松本身并不疼痛，但相关的骨折引起急性和慢性疼痛。12由于骨矿物质耗竭而导致的骨质疏松症会因母鸡无法在电池笼中运动而加剧，也可能是由于营养不足引起的，但问题的起源主要是遗传性的。13这是繁殖高效，轻质鸟类的结果，它们能够在长时间的时间内保持高率。
水产养殖中的全基因组关联和基因组选择
图 1 繁殖种群由繁殖季节产卵的亲鱼组成，这些亲鱼会生成数个（数百个）全同胞和半同胞家族，并在不同的水箱中饲养。当这些个体长到足够大以进行物理标记时，它们会进行单独识别，以在整个周期内保持谱系可追溯性。一些带标记的动物会作为选择候选者留在繁殖核心中，直到它们达到商业重量为止。其他带标记的动物组（选择候选者的全同胞和半同胞）代表繁殖核心中的所有家族，它们会被送去进行环境基因型、产品质量和抗病性测试，以评估具有表型的训练基因型（即成为训练种群）。所有带物理标记的动物都会进行采样并使用 SNP 面板进行基因分型。通过基因组评估方法（例如 GBLUP）联合分析来自训练种群和选择候选种群的谱系、表型和基因型信息，以预测 GEBV，进而用于做出下一繁殖季节的选择决策，并通过繁殖加速将优良基因转移到商业农场
父亲饥饿会影响斑马鱼后代发育和终身健康期间的代谢基因表达
fi g u r e 1 A斑马鱼模型，用于研究父亲饥饿的代际作用。使用拆分离合器设计的IVF实验设计：在实验开始时（第0天）称量AB菌株中的所有雄性，然后随机分成喂养和饥饿的组。饥饿的雄性被完全剥夺了食物，而喂养的雄性每天三遍喂食干燥和活的（Artemia）食物的标准饮食。在实验期间，所有雄性的女性数量相等。18天后，再次称重男性，并收集射精。卵，分为两半的IVF。的精子分别使用了一个和一个饥饿的雄性，用于施肥一半的卵子。收集的精子用于从两名不同女性的卵中施肥。在第19天，在PRIM-5阶段（24 hpf）收集胚胎以进行转录组分析。幼虫长度是在第5天和第8天测量的。F1幼虫的一部分已成长为成年。f1雄性和雌性被交叉至野生型AB鱼，其后代是通过自然产卵获得的。在2和24 hpf下研究了F2胚胎的表型。在设计的右侧显示了实验设置和收集数据的时间表。使用biorender.com创建。
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化学杀虫剂的环境和人类健康风险已引发了广泛的搜索，以保护储存产品的替代方法。最近，纳米颗粒被认为是合成化学产品的有希望的替代品。在这项研究中，使用cystoseira baccata藻类提取物合成ZnO纳米颗粒（NP），并使用X射线衍射（XRD），傅立叶变换红外（FTIR）和场发射扫描电子显微镜（FE-SEM）进行表征。使用两种不同方法合成了三种不同类型的ZnO NP，ZnO-A，ZnO-B和ZnO-C。对其杀虫活性进行了评估，并将其与化学合成的ZnO-D NPS相对于cow虫象鼻虫，callosobruchus maculatus（F.）（鞘翅目：Chrysomelidae）在储存的cow虫上进行了比较。生物合成的ZnO-A，ZnO-B和ZnO-C NPs对Maculatus的活性较高。确定粒径最小（24.3 nm）的多孔ZnO-A NP是最毒性的纳米颗粒，导致五天后的Maculatus成人死亡率最高。虽然ZnO-D NP是Maculatus C. C. C. c. c. c. c. nps的有效性最低。明显的产卵抑制（35.1至44.9％）和后代还原（35.7至
耦合特警和Shyfem建模
摘要。这项研究通过分析由气候模型子集强迫的耦合海洋和排水盆地建模系统的输出来提高对Nemunas河，Curonian Lagoon和波罗的海连续体的气候投射变化的理解。由偏差的较低的高分辨率高分辨率区域大气气候模型进行了偏置校正，并用于建立水文（土壤和水评估工具，SWAT）和水动力学（Shal-Fow-dow-dow-dower-dater水水力学有限元模型，Shyfem）模型系统。这项研究研究了在代表性浓度途径4.5和8.5场景下，在4.5和8.5场景下，在环境参数，水流，养分，水温，冰盖和盐水侵入的环境参数中的可变性和趋势。分析强调了模型结果之间的差异，强调了投影气候影响的固有不确定性，因此突出了使用多模型集合来改善气候变化影响评估的效果的信息。建模恢复用于通过分析冷水物种繁殖季节来评估由于气候变化而导致的环境影响。我们分析了寒冷时期（<1。5°C）作为Burbot（Lota Lota L.）产卵的热窗口，假设有不同的气候强迫场景和模型，则计算出。在
一种小分子方法可恢复果蝇（Drosophila suzukii）的归巢抑制基因驱动所针对的雌性不育表型
基于 CRISPR 的基因驱动为控制疾病传播媒介和农业害虫提供了良好的前景。成功的抑制型驱动面临的一个重大挑战是抗性等位基因的快速进化。减轻抗性发展的一种方法是使用多个 gRNA 靶向功能受限区域。在本研究中，我们构建了一个 3-gRNA 归巢基因驱动系统，该系统针对臭名昭著的水果害虫果蝇 (Drosophila suzukii) 的隐性雌性生育基因酪氨酸脱羧酶 2 (Tdc2)。我们的调查显示，生殖系中的归巢水平较低，但喂食章鱼胺可恢复 Tdc2 突变雌性的产卵缺陷，与其他抑制驱动目标相比，它更容易维持品系。我们在果蝇中测试了类似系统的有效性，并通过引入启动子-Cas9 转基因来构建额外的分裂驱动系统，以提高归巢效率。我们的研究结果表明，野生种群的遗传多态性可能限制基因驱动等位基因的传播，而位置效应对 Cas9 活性有深远的影响。此外，这项研究凸显了有条件地挽救基因驱动引起的雌性不育症的潜力，为基因驱动转基因昆虫的工业规模生产提供了宝贵的工具。