通过仅使用蛋白质和化合物的一维结构进行分析,可以极快地进行计算(比对接模拟快 2,000 倍以上),同时达到与使用现有三维结构进行分析相同的精度。
稀有变异难以检测是传统全基因组关联研究 (GWAS) 面临的问题之一。这一问题与单倍型等由多个等位基因组成的复杂基因组成密切相关。为解决这一问题,已提出了多种单核苷酸多态性 (SNP) 集方法。但这些方法很少与单倍型相关讨论。在本研究中,我们开发了一种新的 SNP 集方法“RAINBOW”,并将该方法应用于基于单倍型的 GWAS,将单倍型块视为 SNP 集。结合单倍型块估计和 SNP 集 GWAS,可在无需先前单倍型信息的情况下进行基于单倍型的 GWAS。我们准备了 100 组稻 (Oryza sativa subsp.) 的模拟表型数据和真实标记基因型数据集。 indica,并对数据集进行 GWAS。我们比较了我们的方法、传统的单 SNP GWAS、传统的基于单倍型的 GWAS 以及传统的 SNP 集 GWAS 的功效。结果显示我们的方法在三个方面优于这些方法:(1)控制假阳性;(2)如果数据集中对因果变异进行了基因分型,则可以不依赖连锁不平衡来检测因果变异;(3)它显示出比其他方法更高的功效,即它能够检测到其他方法未能检测到的因果变异,主要是当因果变异位置非常接近且其作用方向相反时。通过在本研究中使用 SNP 集方法,我们期望不仅可以检测出罕见变异,还可以检测出具有复杂机制的基因,例如具有多个因果变异的基因。 RAINBOW 是作为名为“RAINBOWR”的 R 包实现的,可从 CRAN(https://cran.r-project.org/web/packages/RAINBOWR/index.html)和 GitHub(https://github.com/KosukeHamazaki/RAINBOWR)获取。
随着出生率下降和老龄化人口比例增加导致劳动人口减少,工厂、物流、医疗、城市服务机器人、安防摄像头等社会各个领域都需要先进的人工智能 (AI) 处理,例如识别周围环境、做出行动决定和控制动作。系统需要在各种程序中实时处理先进的人工智能 (AI) 处理。特别是,系统必须嵌入到设备中,以便快速响应不断变化的环境。AI 芯片在嵌入式设备中执行先进的 AI 处理时功耗更低,并且严格限制发热量。
中国樱桃(Prunus pseudocerasus)是中国主要的核果作物之一,具有十分重要的意义。然而,由于缺乏高质量的基因组资源,人工改良其性状和遗传分析具有挑战性,这主要归因于难以解析其四倍体和高度杂合的基因组。在此,我们使用 PacBio HiFi、Oxford Nanopore 和 Hi-C 组装了品种‘诸暨短柄饼’的染色体水平、单倍型解析基因组,包含 993.69 Mb,组装成 32 条假染色体。单倍型内比较分析揭示了广泛的基因组内序列和表达一致性。系统发育和比较基因组分析表明,P. pseudocerasus 是一个稳定的同源四倍体物种,与野生的 P. pusilliflora 密切相关,两者大约在 1834 万年前分化。与其他李属植物类似,樱桃也经历了一次常见的全基因组复制事件,该事件发生在大约 1.3996 亿年前。由于果实硬度低,樱桃不适合长距离运输,从而限制了其在中国的快速发展。在成熟果实阶段,樱桃品种‘诸暨短柄梨’的硬度明显低于樱桃品种‘黑珍珠’。硬度的差异归因于果胶、纤维素和半纤维素含量变化的程度。此外,比较转录组分析发现了两个参与果胶生物合成的基因 GalAK-like 和 Stv1,这可能是造成‘诸暨短柄梨’和‘黑珍珠’果实硬度差异的原因。PpsGalAK-like 和 PpsStv1 的瞬时转化会增加原果胶含量,从而提高果实硬度。我们的研究为中国樱桃功能基因组学研究和重要园艺性状的提升奠定了坚实的基础。
通过胚胎活检对非整倍性(PGT-A)的植入前基因检测有助于通过评估胚胎倍性来进行胚胎选择。然而,临床实践需要考虑胚胎活检,潜在的镶嵌和不准确的整个胚胎的侵入性。这产生了对不损害胚胎或提高治疗成本的改进诊断实践的重要临床需求。因此,越来越重视开发非侵入性技术以增强胚胎的选择。这些创新包括非侵入性PGT-A,人工智能(AI)算法和非侵入性代谢成像。后者通过代谢辅助因子的自动荧光来测量细胞代谢。值得注意的是,高光谱显微镜和荧光寿命成像显微镜(FLIM)揭示了非整倍性胚胎和人类纤维细胞中独特的代谢活性特征。这些方法表明在区分多倍体和非整倍体胚胎方面已经表现出很高的精度。因此,本综述讨论了与PGT-A相关的临床挑战,并强调了对新颖溶液(例如代谢成像)的需求。此外,它探讨了针对细胞行为和新陈代谢的影响,在这项研究领域中为未来的研究方向提供了观点。
图 3. Bioanalyzer 2100 DNA 12000 右侧尺寸选择日期。A1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.5 倍。B1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.6 倍。C1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.7 倍。D1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 0.8 倍。E1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 1.0 倍。F1:通过右侧去除步骤去除的 DNA 片段 – 1.4 倍。A2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.5 倍/2.0 倍。B2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.6 倍/1.9 倍。C2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 – 0.7 倍/1.8 倍。 D2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 0.8×/1.7×。E2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 1.0×/1.5×。F2:右侧尺寸选择后回收的 DNA 片段 — 1.4×/1.1×。
利用人工智能(AI)的抗体药物发现支持技术MALEXA-LI的研究成果已被Nature Research出版的综合科学杂志《Scientific Reports》接受。 MALEXA-LI提出了一种抗体氨基酸序列,其结合强度比现有抗体高出1,800倍以上。 在CHUGAI DIGITAL VISION 2030的指导下,我们将继续致力于通过AI药物发现大幅改善药物发现过程。
完全集成的量子计算架构 • >8-16 倍更高的复用率,消除了开销 • 内置错误校正 • 降低 1,000 倍的能量和热量耗散 • >10 倍更快的时钟速度 + 更低的延迟 • 降低 128 倍的控制脉冲复杂度 • 超导制造商业化就绪 • 系统组件便宜 400 倍
再增加 10 倍,发射节奏更快。这 100 倍的容量将超越第三代和第四代星链卫星。降低有效载荷成本意味着容量只能用于国际空运货物。量产的 2000 万美元星际飞船和 1 亿至 2 亿美元的发射场将比轨道发射降低 5 倍成本,因为只需发射一个级。这比大型商用航空快 20 倍、成本低 15 倍、有效载荷高 4 倍。资产利用率将是商用航空的 5 倍以上。从纽约到东京的半小时航班意味着每天有 10 个航班,而不是常规航空的最多两个。