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高通量单细胞RNA-SEQ(SCRNA-SEQ)技术和实验协议的快速进步导致了大量转录组数据的产生,这些数据填充了几个在线数据库和存储库。在这里,我们系统地检查了大规模的SCRNA-SEC数据库,根据它们的范围和目的进行对它们进行分类,例如一般,组织特异性数据库,疾病特异性数据库,以癌症为中心的数据库和细胞类型类型的数据库。接下来,我们将讨论与策划大规模SCRNA-SEQ数据库以及当前计算解决方案相关的技术和方法论挑战。我们认为,理解SCRNA-Seq数据库,包括它们的局限性和假设,对于有效利用这些数据来做出可靠的发现并确定新颖的生物学见解至关重要。这样的平台可以通过基于用户友好的基于Web的界面来帮助对单细胞数据进行民主化,这可以帮助弥合计算和湿实验室科学家之间的差距。这些平台将促进跨学科研究,使来自各个学科的研究人员有效地合作。本综述强调了利用计算方法来阐明单细胞数据的复杂性的重要性,并为未来的研究提供了有希望的方向。