成簇的规则间隔短回文重复序列 (CRISPR)/CRISPR 相关 (Cas) 系统通过使用 CRISPR RNA (crRNA) 引导入侵核酸的沉默,为细菌和古细菌提供针对病毒和质粒的适应性免疫。我们在此表明,在这些系统的一个子集中,与反式激活 crRNA (tracrRNA) 碱基配对的成熟 crRNA 形成双 RNA 结构,该结构指导 CRISPR 相关蛋白 Cas9 在靶 DNA 中引入双链 (ds) 断裂。在与 crRNA 引导序列互补的位点,Cas9 HNH 核酸酶结构域切割互补链,而 Cas9 RuvC 样结构域切割非互补链。当双 tracrRNA:crRNA 被设计为单 RNA 嵌合体时,它还会指导序列特异性 Cas9 dsDNA 切割。我们的研究揭示了一个使用双 RNA 进行位点特异性 DNA 切割的核酸内切酶家族,并强调了利用该系统进行 RNA 可编程基因组编辑的潜力。B
2。倒重复的palindrome也是一个向前和向后读取相同的序列,但是向前和向后的序列在互补的DNA链(即双链DNA)中发现,与GTATAC(GTATAC)(GTATAC是catatg互补的)。倒重复的回信更为普遍,并且比镜面的plindromes更为普遍,并且具有更大的生物学意义。
癌症治疗的合成致死策略利用癌症特异性基因缺陷来识别对肿瘤细胞存活至关重要的靶点。本文我们表明,RAD27/FEN1 编码瓣状内切酶 1 (FEN1),这是一种在 DNA 复制和修复中发挥作用的结构特异性核酸酶,与酿酒酵母基因组不稳定性基因具有最多的合成致死相互作用,是基于抑制剂的方法杀死同源重组 (HR) 缺陷癌症的可用药物靶点。研究表明,小分子 FEN1 抑制剂和 FEN1 小干扰 RNA (siRNA) 可选择性杀死 BRCA1 和 BRCA2 缺陷的人类细胞系,从而证实了 HR 缺陷癌症容易受到 FEN1 缺失的影响。此外,在小鼠中重现了对 FEN1 抑制的不同敏感性,小分子 FEN1 抑制剂降低了药物敏感但无耐药性癌细胞系中形成的肿瘤的生长。FEN1 抑制在敏感和耐药细胞系中均诱导了 DNA 损伤反应;然而,即使去除抑制剂,敏感细胞系也无法恢复和复制 DNA。尽管 FEN1 抑制在敏感细胞中将 caspase 激活到更高水平,但这种凋亡反应发生在 p53 缺陷细胞中,而泛 caspase 抑制剂无法阻断细胞杀伤。这些结果表明,FEN1 抑制剂具有治疗靶向 HR 缺陷癌症的潜力,例如由 BRCA1 和 BRCA2 突变和其他遗传缺陷引起的癌症。
内切核酸酶 V (EndoV) 是一种保守的肌苷特异性核糖核酸酶,其生物学功能未知。在这里,我们介绍了第一个缺乏 EndoV 的小鼠模型,该模型可以生存而没有明显异常。我们表明,内源性鼠 EndoV 可在体外裂解含肌苷的 RNA,尽管如此,一系列实验未能将其体内功能与此类转录本的处理联系起来。由于肝细胞癌 (HCC) 中的肌苷水平和腺苷到肌苷的编辑通常失调,我们在小鼠中化学诱导了 HCC。所有小鼠都患上了肝癌,然而,EndoV − / − 肿瘤明显比野生型肿瘤少且小。与人类 HCC 相反,在我们的模型中,腺苷脱氨酶 mRNA 表达和位点特异性编辑没有改变。 EndoV 的缺失不会影响肝肿瘤中的编辑水平,但是一些癌症相关基因的 mRNA 表达会降低。肌苷也存在于某些 tRNA 中,并且 tRNA 在应激过程中会被切割以产生信号实体。在 EndoV − / − 肝脏中,tRNA 碎片化失调,并且显然不依赖于肌苷。我们推测 EndoV 的肌苷核糖核酸酶活性在体内被禁用,但 RNA 结合可以促进转录本的稳定或蛋白质的募集以微调基因表达。EndoV − / − 肿瘤抑制
这一现象最早是在 20 世纪 50 年代初 Salvador Luria 和 Giuseppe Bertani 实验室的工作中发现的。他们发现,一种噬菌体 λ 可以在大肠杆菌的一种菌株(例如大肠杆菌 C )中生长良好,但当在另一种菌株(例如大肠杆菌 K )中生长时,其产量会大幅下降。大肠杆菌 K 宿主细胞(称为限制性宿主)似乎能够降低噬菌体 λ 的生物活性。限制性酶 = 限制性内切酶