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新型结核病促进疫苗候选分子的建议
Ikkoh Yasuda，Naomi Ruth D. Saludar，Ana Ria Sayo，Shuichi Suzuki，Akira Yokoyama，Yuriko Ozeki，Ikkoh Yasuda，Naomi Ruth D. Saludar，Ana Ria Sayo，Shuichi Suzuki，Akira Yokoyama，Yuriko Ozeki，
不同环境下钴价互变异构分子的电子结构
完整作者列表： Mishra, Esha；内布拉斯加大学林肯分校，物理学和天文学 Ekanayaka, Thilini；内布拉斯加大学林肯分校，物理学 Panagiotakopoulos, Theodoros；中佛罗里达大学 Le, Duy；中佛罗里达大学，物理系；中佛罗里达大学 Rahman, Talat；中佛罗里达大学，物理学 Wang, Ping；佛罗里达州立大学，化学和生物化学系 McElveen, Kayleigh；内布拉斯加大学林肯分校，化学 Phillips, Jared；印第安纳大学普渡大学印第安纳波利斯分校，物理学 Zaz, Zaid；内布拉斯加大学林肯分校 Yazdani, Saeed；IUPUI N'Diaye, Alpha；劳伦斯伯克利国家实验室，先进光源 Lai, Rebecca；内布拉斯加大学林肯分校 Streubel, Robert；内布拉斯加大学林肯分校，物理学和天文学 程瑞华；印第安纳大学普渡大学印第安纳波利斯分校，物理系 沙特鲁克，迈克尔；佛罗里达州立大学，化学系 彼得·道本；内布拉斯加大学林肯分校，物理学和天文学
带有放射性分子的基本物理研究的机会
Gordon Arrowsmith-Kron 1，Michail Athanasakis-Kaklamanakis 2，3，Mia Au 4，5，Jochen Ballaf 1，6，Robert Berger ，Fritz Buchinger 10，Dmitry Budker 11，12，Luke Caldwell 13，14，Christopher Charles 15，16蒂莫·狄克尔（Timo Dickel）23，24，贾斯克·杜巴齐夫斯基（Jacek Dobaczewski）25，26，∗，克里斯托弗·杜尔曼（ChristophEdüllmann）27，28，29，以法莲（Ephraim Eliav 30），乔纳森·恩格尔（Jonathan Engel），乔纳森·恩格尔（Jonathan Engel） 33，Kiran T Flanagan 34，Alyssa n Gaiser 1，Ronald F Gaiser Ruz 35， *，康斯坦丁Gaul 7，Thomas F Geesen 9 Gwinner 37，Reinhard Heinke 4，Steven Hoekstra 8，38，Jason D Holt 15，39，Nicholas r Hutzler 40，∗，Andrew Jayich 32，Andrew Jayich 32， * Leach 1，41，Kirk W Madson 42，Stephan Malbrunot-Etetenauer 15，43，Takayuki Miyagi 15，Iain D Moore 44，Scott Moroch 35，Petr Navratil 15 ，Gerda Neyens 3，Eric B Norgard 46，Nicholas Nusgart 1，卢卡S f pa Roy A Ready 32，Moritz Pascal Reiter 50，Mikael Reponment 44，Sebastian Rothe 4，Maranan S Safronova 51，52，Christophy Scheedenerger 23，24，53 Dler 54， Jaideep t Singh 55， *，Leonid v Skripnikov 48，49，Anatoly v Titov 48，49，Silvia-Marian-Marian Udrescu
diffms：以质谱为条件的分子的扩散产生
质谱法在阐明未知分子的结构和随后的科学发现中起着基本作用。结构阐明任务的一种结构是给定质量谱的分子结构的有条件生成。朝着针对小分子的更有效和有效的科学发现管道，我们提出Diffms，这是一个由公式限制的编码码头生成网络，可在此任务上实现最先进的性能。编码器利用变压器档位，并模型质谱域知识，例如峰值公式和中性损耗，而解码器是一个离散的图形扩散模型，该模型受已知化学公式的重原子组成限制。为了开发一个桥梁解码器，它可以弥合潜在的嵌入和分子结构，我们用指纹结构对预处理扩散解码器，这些解码器几乎以无限的量为单位，与结构 - 光谱对相对，以数千的数量为单位。在已建立的基准上进行的广泛实验表明，DIFFMS在从头分子上构成现有模型。我们提供了几种消融，以揭示我们扩散和预训练方法的有效性，并随着预训练的数据集尺寸的增加而显示出一致的穿孔缩放。DIFFMS代码可在https：//github.com/coleygroup/diffms上公开获得。
保护关键基础设施免受恐怖分子的保护...
2.6.1 Risk management ................................................................................................................... 60 2.6.2 Crisis management ................................................................................................................ 64 2.7 Mapping threats, consequences and vulnerabilities ....................................................... 65 2.7.1 A multi-level exercise ……......................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................... attacks ................................................ 69 2.8.1 Prevention ............................................................................................................................... 70 2.8.2 Processes, physical security (including technology), personnel security and cyber protection measures ........................................................................................................................... 71 2.9 Respond to and recover from a恐怖袭击对齐.................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................................
Magic-Cryo-Em：磁珠上稀缺的大分子的结构测定
魔术 - 晶体：在异质样品中稀缺大分子的结构性确定Yasuhiro arimura 1,2*，hide A. Konishi 1，Hironori funabiki 1* 1* 1 1* 1 1* 1个伪装体和细胞生物学实验室，纽约州纽约州立大学，纽约州纽约州立大学。中心，美国华盛顿州西雅图市，98109-1024 *通信：funabih@rockefeller.edu，yarimura@rockefeller.edu或yarimura@fredhutch.org摘要冷冻冷冻级单 - 单点分析通常需要在0.05〜5.5.5.0 mg/ml上达到目标Macromolecule浓度，以下是iSMACromolecule浓度。在这里，我们设计了磁隔离和浓度（魔术）-cryo-em，这是一种能够对磁珠上捕获的靶标的直接结构分析，从而将目标的浓度需求降低到<0.0005 mg/ml。将魔术 - 晶体EM适应染色质免疫沉淀方案，我们表征了连接器组蛋白H1.8相关的核小体的结构变化，这些核小体是从异叶鸡蛋提取物中的相间和中期染色体分离出来的。将重复的选择组合以排除垃圾颗粒（Duster），这是一种去除低信噪比粒子颗粒的粒子策划方法，我们还解决了H1.8结合的核纤维蛋白NPM2的3D冷冻EM结构与与跨相染色体和露出不同的敞开和封闭的结构变体的3D冷冻EM结构。我们的研究表明，魔术 - 晶体EM对异质样品中稀缺的大分子的结构分析的实用性，并为H1.8与核小体关联的细胞周期调节提供了结构见解。关键字冷冻EM，磁珠，Xenopus鸡蛋提取物，核小体，接头组蛋白H1，核纤维蛋白
Magic-Cryo-Em：磁珠上稀缺的大分子的结构测定
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证（未经同行评审证明）获得的是作者/资助者，他授予Biorxiv授予Biorxiv的许可，以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人，该版本发布于2025年1月8日。 https://doi.org/10.1101/2024.01.21.576499 doi：Biorxiv Preprint
小分子的遗传编码蛋白生物传感器的设计和工程
由小有机分子控制的抽象遗传编码的蛋白生物传感器是许多生物技术应用的宝贵工具，包括控制活细胞中细胞决策。在这里，我们回顾了蛋白质生物传感器设计和工程技术的最新进展，以结合新型配体。我们将传感器架构分类为集成或便携式的，在便携式生物传感器中取消信号转导的分子识别。提出的改善便携式生物传感器开发的进展包括标准化有限的蛋白质支架以及自动化配体兼容性筛选和配体 - 蛋白界面设计。
QH9：QM9分子的量子哈密顿预测基准
监督的机器学习方法已越来越多地用于加速电子结构预测作为第一原理计算方法的替代物，例如密度功能理论（DFT）。虽然许多量子化学数据集都集中在化学性质和原子力上，但实现对汉密尔顿基质的准确有效预测的能力是高度的，因为它是确定物理系统和化学特性的量子状态最重要，最基本的物理量。在这项工作中，我们生成了一个新的量子汉密尔顿数据集，称为QH9，以根据QM9数据集为999分子动力学轨迹的精确汉密尔顿矩阵和130,831个稳定的分子几何形状。通过使用各种分子设计基准任务，我们表明当前的机器学习模型具有预测任意分子的汉密尔顿矩阵的能力。QH9数据集和基线模型均通过开源基准提供给社区，这对于开发机器学习方法以及加速分子和材料设计的科学和技术应用可能非常有价值。我们的基准标有https://github.com/divelab/airs/tree/main/main/opendft/qhbench。
光学捕获分子的激光冷却 - Doyle Group
超冷分子是许多重要应用的理想平台，从量子模拟 1 – 5 和量子信息处理 6, 7 到基础物理的精密测试 2, 8 – 11。生产捕获的、致密的超冷分子样品是一项具有挑战性的任务。一种很有前途的方法是直接激光冷却，它可以应用于几类不易由超冷原子组装的分子 12, 13。在本文中，我们报告了激光冷却 CaF 分子捕获样品的生产，其密度为 8! × !10 7 cm − 3，相空间密度为 2! × !10 − 9，比自由空间中的亚多普勒冷却样品高 35 倍 14。这些进展是通过将光学捕获的分子有效地激光冷却到远低于多普勒极限而实现的，这是迈向许多未来应用的关键一步。这些领域包括超冷化学和量子模拟，其中需要保守地捕获低温致密样品。此外，冷却光学捕获分子的能力为量子简并开辟了新途径。