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酵母的调控进化机制 - NSF-PAR
1 密歇根大学分子、细胞与发育生物学系，密歇根州安娜堡，美国 2 密歇根大学生态与进化生物学系，密歇根州安娜堡，美国 通讯作者 Patricia J. Wittkopp，wittkopp@umich.edu 生态与进化生物学系 分子、细胞与发育生物学系 4010 生物科学大楼 1105 北大学大道 密歇根大学，密歇根州安娜堡 48109-1048 美国 电话：+1-734-763-1548 所有作者电子邮件地址 siddiqm@umich.edu (MAS) wittkopp@umich.edu (PJW) 简称：酵母的调控进化机制 关键词：基因表达、调控网络、顺式调控、选择、突变 摘要 酵母调控变异的研究——在新的突变水平、物种内的多态性和物种间的分化——为真核生物基因表达进化的分子和进化过程提供了深刻见解。酵母基因组越来越容易被操纵，表达也越来越容易以高通量方式量化，这最近加速了对多个进化时间尺度上的顺式和反式调控变异的机制研究。例如，这些研究确定了影响其进化命运的顺式和反式突变性质的差异，通过实验表征了顺式和反式调控变异发挥作用的分子机制，并说明了调控网络如何在有或没有基因表达变化的物种之间出现分歧。
使用变异自动编码器参数化机翼
设计只能与其数学表示一样好。在工程设计优化中，所选的参数化方法可以对结果产生重大影响。本文介绍了一种利用变异自动编码器（VAE）的翼型设计参数化的新方法，这是一类以降低维数的熟练程度而闻名的神经网络。但是，VAE的重大挑战是编码潜在空间的解释性。这项工作旨在通过创建具有可解释潜在空间的网络来解决此问题，从而产生人类可以理解的参数。使用综合的UIUC机翼数据库评估了这种方法的有效性，该数据库提供了多种式机翼形状供分析。我们表明，VAE可以成功提取翼型几何形状的关键特征，并使用六个参数对其进行参数化，这些特征以设计器可以理解的方式显示与机翼属性的明显相关性。此外，它可以平滑地插入数据点，从而产生新的机翼，从而提供实用且可解释的机翼参数化。
开发，比较和评估UKCA模型中二甲基硫的氧化机制的改进机制
摘要。二甲基硫（DMS）是从海洋发出的重要痕量气体。长期以来，通过DMS在设置对流层中硫酸盐气溶胶背景方面所扮演的角色，DMS的氧化对全球气候很重要。但是，DMS被氧化的机制非常复杂，尽管研究了数十年，但事实证明难以确切地确定。因此，通常简化了全球化学 - 气候模型中DMS氧化的表示。最新的现场观察和实验室和从头算研究促使人们在理解DMS氧化机制方面做出了重新努力，这对限制了DMS氧化机制的不确定性，并构成了全球化学模型中的氧化机制。在这里，我们以最新的证据为基础，并开发了一种新的DMS机制，以纳入英国化学气溶胶（UKCA）化学模型。我们将我们的新机制（CS2-HPMTF）与UKCA中使用的许多现有机制进行了比较（包括使用模型的CMIP6研究中使用的高度简化的三转反应 - 两种特征机制），以及通过一系列全球和盒子模型实验中的文献中报道的一系列新近开发的机制。全球模型以新的机制运行，使我们能够模拟甲基甲基甲基甲基甲基甲基甲酯（HPMTF）的全球分布，我们计算出的负担为2.6-26 gg S（与0.7-18 gg s的文献范围非常吻合）。我们的全球模型研究表明，与一套表面和飞机观测值相比，我们更新的DMS方案的性能优于UKCA使用的当前计划。We show that the sinks of HPMTF dominate uncertainty in the budget, not the rate of the isomerisation reaction forming it and that, based on the observed DMS / HPMTF ratio from the global surveys during the NASA Atmospheric Tomography mission (ATom), rapid cloud uptake of HPMTF worsens the model– observation comparison.我们的盒子模型实验强调，在文献中使用的机制跨DMS的模拟二级氧化产物中存在显着差异，在这些产物对这些产品的形成速率上的敏感性显着差异；特别是用于甲烷磺酸（MSA）。但是，灵敏度研究强调了对进一步的实验室和观察性约束的必要性。尤其是我们的结果表明，作为优先的长期DMS观察，以更好地限制对系统的高度不确定的输入，并进行实验室研究，以解决（1）HPMTF对
在人类活动中优化机器学习模型...
摘要： - 人类活动识别（HAR）是一项具有巨大潜力的技术，利用来自智能手机和相机等各种设备的数据。它在诸如驾驶，清洁和游戏之类的日常活动中找到了应用程序，涉及站立，坐着，慢跑和打字等基本运动。对这些动作的准确识别对于有效的人类计算机相互作用系统至关重要。这项工作结合了一个HAR模块，以从数据信号中提取有价值的见解。IT使用机器学习（ML）模型来使用来自物联网可穿戴传感器的原始数据自动检测人类活动，包括MLP算法中的Adagrad和Elu等创新组合。使用统计指标（例如精度，精度，召回和F1得分）评估ML模型的性能，并与现有模型进行比较。
数字双胞胎，以定量了解NMC电池的老化机制，使用动态老化曲线
传统锂离子电池建模没有提供足够的信息来准确验证在实时动态操作条件下电池的性能，尤其是在考虑各种老化模式和机制时。为了改善当前方法，本文提出了一个可以捕获实时数据并整合SEI层生长，阳极裂纹传播和锂电池之间的强耦合的锂离子电池数字双胞胎。它可以用来估算从宏观全细胞水平到显微镜颗粒水平的衰老行为，包括在动态老化条件下的电压 - 电流特征，可以预测基于镍甲虫 - 雄性 - 果胶（NMC）基于锂离子电池的降解行为，并有助于进行电化学分析。该模型可以改善细胞衰老的根本原因分析，从而对衰老机制耦合效应有定量的理解。开发了带有动态放电轮廓的三个充电协议，以模拟真实的车辆操作场景，并用于验证数字双胞胎，结合操作数阻抗测量，验尸后分析和SEM，以进一步证明结论。数字双胞胎可以准确预测电池容量在0.4％MAE之内淡出。结果表明，SEI层的生长是能力降解和阻力增加的主要因素。基于对模型的分析，得出的结论是，与标准的连续充电Pro烟光相比，提出的多步充电协议之一可以减少基于NMC的锂离子电池的降解。本文代表了未来物理知识的机器学习开发的坚定物理基础。
Adam Yaari 公正的体外和体内药物锚筛网鉴定了MTAP-DEL中MTA合件PRMT5抑制剂的抗性和敏化机制 stearoyl-COA去饱和酶是SMAD4缺陷癌症中的合成致命靶标 发现TNG908：选择性，大脑渗透物，MTA MTA合件PRMT5抑制剂在MTAP中有效...
结果：〜20K药物和目标的学习机制捕获了关键的功能关系。将平台应用于高度选择性的USP1抑制剂TNG348，我们确定了和验证的细胞机制，解释了整个肺癌细胞系和PDX模型的药物反应变化> 50％。响应映射可以开发预测性生物标志物逻辑和潜在合理组合。
概念化机器学习，用于动态信息检索电子健康记录笔记
大量的时间临床医生花费在患者笔记中进行筛选，并记录了电子健康记录（EHRS）是临床医生倦怠的主要原因。通过在文档过程中积极，动态地检索相关注释，我们可以减少找到相关患者病史所需的努力。在这项工作中，我们将EHR审核日志的使用概念化为机器学习作为在特定时间点特定临床背景下的注释相关性的来源。我们的评估重点是急诊科的动态检索，这是一个具有独特信息检索和笔记写作模式的高敏度设置。我们表明，我们的方法可以达到0.963的AUC，以预测在单个笔记写作会话中将阅读哪些注释。我们还与几位临床医生进行了用户研究，发现我们的框架可以帮助临床医生更有效地检索相关信息。证明我们的框架和方法可以在这种苛刻的环境中表现良好，这是一个有希望的概念证明，它们将转化为其他临床环境和数据方式（例如，实验室，药物，成像）。
人类与自动化机器学习系统交互的角色和模式：评论与观点
随着自动化机器学习 (AutoML) 系统在复杂程度和性能方面不断进步，了解这些框架中人机交互 (HCI) 的“方式”和“原因”变得非常重要，无论是当前的还是预期的。这样的讨论对于最佳系统设计是必要的，利用先进的数据处理能力来支持涉及人类的决策，但它也是识别不断提高的机器自主性水平所带来的机遇和风险的关键。在此背景下，我们重点关注以下问题：(i) 目前，对于最先进的 AutoML 算法来说，HCI 是什么样子的，特别是在开发、部署和维护阶段？(ii) 不同类型的用户和利益相关者对 AutoML 框架内 HCI 的期望是否不同？(iii) 如何管理 HCI，以便 AutoML 解决方案获得人类的信任和
非洲的关键矿产和多样化途径：可再生能源技术多样化机遇 - 摩洛哥案例
过去二十年，摩洛哥经济经历了重大的结构性转型，已成为北非地区中高科技产业最具活力的投资中心。这一结构性转型的推动因素是汽车、航空航天、可再生技术以及化工领域国内外投资的大幅加速。据摩洛哥促进署 1 称，汽车行业在非洲产量居首，年产量超过 70 万辆，出口额超过 80 亿美元，拥有 250 多家公司，包括全球领先的雷诺和 Stellantis 集团。在航空航天工业方面，摩洛哥利用与汽车互补的生产能力，还为飞机发动机的金属零件和子装配、机加工和钣金零件、内饰设备和复合零件建立了坚实的制造基础。至于化工和相关行业，就产量而言，摩洛哥已成为非洲第二大医药产品生产国，满足了该国 65% 的需求。此外，摩洛哥拥有世界 70% 以上的磷矿储备，该国已成为世界第四大化肥出口国。磷对所有粮食作物，事实上是所有植物生命都必不可少。这使得摩洛哥成为全球粮食供应链的守门人，也是非洲市场的主要战略供应商 (Tanchum, 2022)。2020 年，摩洛哥国有企业摩洛哥磷酸盐办公室 (OCP) 供应了非洲所有化肥的 54%，占非洲最大经济体尼日利亚进口化肥总量的 90% 以上。靠近欧盟市场和国内政治稳定在吸引外国直接投资进入这些行业方面发挥了重要作用。具体来说，在 MHT 领域，摩洛哥在 2015 年的 GVC 整合和国内增值水平很高，如图 1 所示。
大型语言模型的个性化机器人帮助
摘要 - 为了使机器人有效地个性化身体援助，它必须学习用户偏好，通常可以重新应用未来的情况。在这项工作中，我们通过机器人调查了家庭清理的个性化，这些机器人可以通过捡起物体并将其放置来整理房间。一个关键的挑战是确定适当的位置，因为人们的喜好可能会因个人品味或文化背景而变化很大。例如，一个人可能更喜欢在抽屉里存放衬衫，而另一个人可能更喜欢它们在架子上。我们旨在构建可以通过与特定人的事先互动从少数示例中学习此类偏好的系统。我们表明，机器人可以将基于语言的计划和感知与大型语言模型（LLMS）的少量摘要功能相结合，以推断广泛的用户偏好，这些用户偏好广泛适用于未来的互动。此方法可以快速适应，并在我们的基准数据集中看不见的对象达到91.2％的精度。我们还在一个名为Tidybot的现实世界移动操纵器上演示了我们的方法，该操作器成功地将85.0％的对象放在了现实世界的测试方案中。