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SNP测试检查位于整个Y染色体的一到数千个单核苷酸多态性的任何地方。SNP传统上用于确定一个人的单倍群和古老的血统,并且对于寻找遗传表亲的有用不太有用。但是,新测试正在识别可能在族谱相关的时间范围内有用的SNP。SNP测试具有多种重要用途,包括:(i)确定深度血统; (ii)确认估计的单倍群; (iii)确定亚aplogroup的名称(“终端SNP”)。很快,许多人认为SNP测试将用于确定族谱相关的时间表中的关系!
过量的氮会促进水稻非生产性分蘖的形成,从而降低氮利用效率 (NUE)。通过平衡氮吸收和生产性分蘖的形成来开发高 NUE 水稻品种仍然是一个长期挑战,但这两个过程如何在水稻中协调仍然难以捉摸。在这里,我们将转录因子 OsGATA8 确定为水稻氮吸收和分蘖形成的关键协调因子。OsGATA8 通过抑制铵转运蛋白基因 OsAMT3.2 的转录来负向调节氮吸收。同时,它通过抑制分蘖的负调节因子 OsTCP19 的转录来促进分蘖的形成。我们将 OsGATA8 -H 确定为高 NUE 单倍型,具有增强的氮吸收和更高比例的生产性分蘖。OsGATA8- H的地理分布及其在历史种质中的频率变化表明其适应肥沃的土壤。总体而言,这项研究为NUE的调控提供了分子和进化方面的见解,并有助于培育具有更高NUE的水稻品种。
结果:通过采用三重分箱方法,我们能够利用长读技术和全基因组染色质相互作用数据 (Hi-C) 组装出高质量的染色体水平 F1 组装体和 2 个亲本单倍型组装体。从总共 40 条染色体 (2n = 80) 中,我们在单个支架中捕获了 35 条染色体,与旧的组装体相比,基因组完整性和连续性得到了很大的改善。这 3 个组装体的质量高于之前的草图质量组装体,与鸡组装体 (GRCg7) 相当,最大的重叠群 N50 (26.6 Mb) 和可比的 BUSCO 基因集完整性得分 (96-97%) 也显示出了这一点。比较分析证实了之前发现的 Z 染色体上约 19 Mbp 的大倒位,而其他鸡形目动物中没有发现这种倒位。已发现亲本单倍型之间的结构变异,这为育种提供了潜在的新目标基因。
通过检测无细胞DNA(C Q Q QA)和非侵入性产前测试(NIPT)[1,2]的发育来彻底筛选染色体非整倍型的染色体。While over decades, the detection rate (DR) of trisomy 21 could be improved from only 30% to 90% at a false positive rate (FPR) of 5% by first trimester combined screening (FTCS), c ff DNA has a DR of Down syndrome of 99% at a very low FPR of 0.04% [3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12].三体三体第18和18的DRS与双胞胎妊娠中的C扰性[9、10、11、12]相似。尽管表现出色,但C效应仍然是筛查测试,并且通过侵入性测试确认了高风险C扰动的结果[13,14]。由于其高昂的成本,大多数医疗保健系统并未对所有孕妇进行DNA筛查。因此,已经提出了直接c或偶然筛选的不同模型[15,16,17]。在瑞士,所有孕妇的健康保险提供者都偿还了FTC,包括一名经过认证的超声检查员的详细超声检查,并测量了胎儿颈部半透明(NT)以及生化分析。在超声波中看到的胎儿异常,NT> 95%的胎儿疾病或FTCS≥1:380的任何三体造期风险。自2015年7月以来,作为全球最早的国家之一,斯威茨 - 以偶然的方式实施了常规筛查。如果在FTC上将孕妇年龄(MA)和NT与生化血清标记物β-人类绒毛膜促性腺激素