悬浮培养物对光照作出反应并开始分化,我们确定了光照后接种农杆菌的最佳时间。为此,将 O. dubium 细胞培养物在接种农杆菌前 0、5、10、15 和 20 天转移到光照下(图 3b)。接种农杆菌后,培养物在选择培养基中再生长十周。值得注意的是,虽然暗生长培养物的转化产生了两个转化子,但接种前 5、10、15 和 20 天暴露在光照下的培养物分别产生了 15、6、19 和 14 个卡那霉素抗性芽,其中 4、6、6 和 5 个芽(共 21 个芽)从第 21 天开始显示出弱的 RFP 荧光(图 4a、b、c)。经过挑选,绿色健康
引物编辑器 (PE) 可以在不造成供体 DNA 或双链断裂的情况下安装所需的碱基编辑,已用于植物,原则上可以加速作物改良和育种。然而,它们在植物中的编辑效率通常较低。通过基于熔化温度设计序列来优化引物编辑向导 RNA (pegRNA)、使用双 pegRNA 和工程 PE 均已被证明可以提高 PE 效率。此外,基于水稻引物编辑实验数据开发了一个自动化 pegRNA 设计平台 PlantPegDesigner。在本方案中,我们介绍了使用 PlantPegDesigner 设计和优化 pegRNA、构建具有增强编辑效率的工程植物 PE 载体进行引物编辑、使用报告系统评估引物编辑效率以及通过深度扩增子测序比较 PE 的有效性和副产物的详细方案。利用该方案,研究人员可以在4 – 7天内构建优化的用于引物编辑的pegRNA,并在3个月内获得引物编辑的水稻或小麦植物。