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适应性实验室进化以获得糠醛耐受性……
结果与讨论：为进一步探究糠醛耐受性增强的机制，基于全基因组重测序数据，利用 CRISPR/Cas9 技术构建了 ADR1_1802 突变体。结果表明，当糠醛为 4 g/L 时，ADR1_1802 开始生长的时间与参考菌株（S. cerevisiae CEN.PK113-5D）相比缩短了 20 小时。此外，根据实时荧光定量 PCR 分析，ADR1_1802 突变体中 GRE2 和 ADH6 的转录水平分别增加了 53.69% 和 44.95%。这些发现表明突变体糠醛耐受性的增强是由于糠醛降解加速。重要性：全球可再生碳对于实现“零碳”目标至关重要。从生物质中获得的生物乙醇就是其中之一。为了使生物乙醇的价格与化石燃料具有竞争力，必须提高乙醇产量，因此，应通过酿酒酵母将生物质预处理过程中产生的单糖有效地转化为乙醇。然而，葡萄糖或木糖氧化形成的抑制剂会降低乙醇产量。因此，抑制剂耐受性酿酒酵母对这一过程非常重要。糠醛作为预处理水解液的主要成分之一，对酿酒酵母的生长和乙醇生产有明显的影响。为了获得对糠醛耐受的酿酒酵母并找到潜在机制，本研究应用了适应性实验室进化和CRISPR/Cas9技术
剥削用过的咖啡地（SCG）作为益生菌乳酸菌细菌的功能性化合物和生长底物的来源
花费的咖啡渣（SCG）代表了具有功能潜力的食物浪费，全球生产高。scg源自咖啡酿造，主要由不溶性物质组成，并且仍然需要不同的努力来寻找其价值的创新过程。在这项工作中，利用了不同的方法（包括物理铣削和微波辅助提取，MAE）和生物学（优化的酶辅助提取，EAE），以溶解被捕获在丰富光纤网络中的化合物。MAE导致最高浓度的可溶性纤维和寡糖，从而溶解了不溶性纤维。通过使用MAE和EAE组合使用MAE和EAE，由于高纤维水解为单糖（高达17 g/100g），可溶性黑色素蛋白（高达72 mg/g）和咖啡酸（高达2.22 mg/g），总可溶性增加了几乎8倍。该提取物还具有最高抗氧化电位的表征，这些抗氧化电位表明了COM固定过程的积极影响。EAE促进了SCG提取物中养分的释放，这些含量被选定的益生菌乳脂型LP19用作生长的释放。这项工作表明了如何使用不同的技术及其组合来量化SCG，以证明获得新型SCG衍生功能成分和/或产品的可能性。
口服乳果糖——一种安全有效的治疗糖耐量受损和糖尿病患者便秘的方法
乳果糖是一种合成的二糖，由半乳糖和果糖通过 β-1,4-糖苷键连接而成。它是天然乳糖乳糖的异构化产物，乳糖是乳果糖生产的起始物质。由于乳果糖不能在小肠中被酶分解，因此完整的分子到达大肠后被结肠细菌代谢为相应的单糖，然后代谢为短链脂肪酸 (SCFA)、氢和甲烷 [5-7]。乳果糖的天然通便作用主要源于其渗透能力，可导致水分滞留，从而使粪便变软，并具有蠕动激活作用。此外，难消化的二糖在结肠中的代谢会导致腔内气体形成和渗透压增加，同时降低腔内 pH 值，从而缩短肠道转运时间 [1,8]。乳果糖还能有效减少肠道氨的产生，因此可用于预防和治疗肝性脑病 (HE) [5,6]。乳果糖的代谢作用似乎与剂量有关 [6]。虽然较低剂量（2 克/天以上）就能产生益生元作用并增强钙和镁等多种矿物质的吸收，但 10-30 克/天的中等剂量会产生用于治疗便秘的通便作用，而 60-100 克/天的高剂量则具有用于治疗 HE 的解毒作用 [5,6,9]。
使用氯化铁（FECL 3）作为痕量元素，以增强厌氧codigestion
氯化铁（FECL 3）被广泛用于污水处理过程中，并通过留在废物激活的污泥中（WAS）来影响厌氧消化过程。然而，厌氧消化系统涉及的FECL 3（FC）的效果和机制尚未彻底阐明。在这项研究中，评估了FC作为痕量元素的利用来增强厌氧共消化的甲烷产生。此外，还研究了FC添加的不同效果和潜在的机制在WAS的每个关键阶段和食物废物（FW）厌氧共消化中。发现FC增强了高达50.74％的甲烷产生，最大值在300 mg-fc/l的剂量下获得。fc促进了溶解度，水解和酸化可能是通过异化性铁还原过程促进的，因为FC可以用作电子受体，以加速WAS和FW复合有机物的分解和降解，并接受中间体电子以刺激氨基酸和单糖酸盐酸中乙酸的杀菌剂。然而，FC以高剂量浓度抑制甲烷的产生，这归因于铁的毒性和挥发性脂肪酸的积累并降低pH。酶促分析表明，FC添加增加了淀粉酶活性，这是一种重要的水解酶，也降低了滞后相。总体而言，这项研究有助于更好地理解整合到WAS和FW厌氧共同消化中的FC机制，并为优化能源/碳恢复的途径奠定了基础。
预组装 Cas9 核糖核蛋白介导的基因缺失鉴定了灰盖菇中的碳分解代谢阻遏物及其靶基因
摘要 Cre1 是一种重要的转录因子，可调节碳分解代谢抑制 (CCR)，在真菌中广泛保守。cre1 基因已在几种子囊菌中得到广泛研究，而其在担子菌物种中基因表达调控的作用仍不太清楚。在这里，我们鉴定了 Coprinopsis cinerea 并研究了 cre1 的作用，Coprinopsis cinerea 是一种可以有效降解木质纤维素植物废物的担子菌模型蘑菇。我们使用一种基于 PCR 扩增的分裂标记 DNA 盒以及体外组装的 Cas9 引导 RNA 核糖核蛋白 (Cas9 RNPs) 的快速有效的基因缺失方法来生成 C. cinerea cre1 基因缺失菌株。两个独立的 C. cinerea cre1 突变体的基因表达谱显示碳水化合物代谢、植物细胞壁降解酶 (PCWDE)、质膜转运蛋白相关基因和几种转录因子编码基因等显著失调。我们的研究结果支持以下观点：与子囊菌中的报告一样，C. cinerea 的 Cre1 通过多种基因的联合调节来协调 CCR，包括 PCWDE、正向调节 PCWDE 的转录因子和可以导入可诱导 PWCDE 表达的单糖的膜转运蛋白。有些矛盾的是，虽然与其他伞菌一致，但与木质素降解相关的基因在 cre1 突变体中大多下调，表明它们受到的调节与其他 PCWDE 不同。基因缺失方法和此处提供的数据将扩展我们对担子菌中 CCR 的了解，并为与植物生物质降解相关的基因提供功能假设。
Goitdziewska M，lyszczarz A，Kaczoruk M，Kolarzyk E. Sibo与其他肠道疾病之间的关系以及对它们的常见饮食模式。第三部分
抽象的简介和目标。由脑肠轴疾病和牙龈凝干轴疾病产生的条件显示出许多相互的，通常是双向相互关系的。可以通过实施正确调整的饮食疗法有效调节肠道菌群的伴随定量和/或定性疾病。该研究的目的是研究小肠细菌过度生长（SIBO）和肠易激综合征（IBS）与非特异性炎症性肠道疾病（IBD）之间是否存在关系，以及营养模式的适应症。审查方法。使用数据库PubMed，Google Scholar和Web of Science进行了文献综述。由非系统文献综述进行了简短的收集信息综合。简要描述了知识状态。从临床角度来看，SIBO通常与IBS相关。这两种情况都有常见症状，例如：腹痛，肠胃气息和腹泻以及类似的神经心理疾病。反过来，IBS与IBD具有许多共同点，以至于IBD中的IBS一词甚至提出了。关于饮食疗法，低FODMAP（可发酵的寡糖，二糖，单糖和多醇）是最推荐的饮食。但是，建议益生菌治疗以恢复微生物学平衡。摘要。目前，越来越多的研究表明SIBO和IBD之间存在密切的关系，而SIBO在患有克罗恩病的患者中比患有溃疡性结肠炎的患者更频繁地发生。为了获得良好的治疗结果并防止这些疾病的复发，在药物治疗，心理治疗，益生菌治疗和饮食疗法的熟练，个性化结合的领域需要跨学科和专业的合作。
为期两天的“工程师生物学”FDP
什么是生物分子？生物分子，也称为生物分子，是细胞和生物体产生的众多物质之一。生物分子具有多种尺寸和结构，并具有多种功能。四种主要类型的生物分子是碳水化合物、脂质、核酸和蛋白质。在生物分子中，核酸（即 DNA 和 RNA）具有存储生物体遗传密码的独特功能 - 决定蛋白质氨基酸序列的核苷酸序列，这对地球上的生命至关重要。蛋白质中可以出现 20 种不同的氨基酸；它们出现的顺序在确定蛋白质结构和功能方面起着根本性的作用。蛋白质本身是细胞的主要结构元素。它们还充当转运体，将营养物质和其他分子移入和移出细胞，并作为酶和催化剂参与生物体内发生的绝大多数化学反应。蛋白质还形成抗体和激素，并影响基因活动。碳水化合物主要由含碳、氢和氧原子的分子组成，是所有生命的基本能量来源和结构成分，也是地球上最丰富的生物分子之一。它们由四种糖单元组成——单糖、双糖、寡糖和多糖。脂质是生物体的另一种关键生物分子，具有多种作用，包括作为储存能量的来源和化学信使。它们还形成膜，将细胞与周围环境隔开，并将细胞内部分隔开来，在高等（更复杂）生物中产生细胞器，如细胞核和线粒体。例子包括胞苷、尿苷、腺苷、鸟苷和胸苷。核苷经磷酸化后变成核苷酸。除了作为核酸的结构单元外，核苷酸还可以作为化学能的来源（例如三磷酸腺苷或 ATP）。
开发高流行糖缀合物的C型凝集素面向表面：旨在模仿细胞表面上的多价相互作用
摘要：复杂碳水化合物与寡聚C型凝集素之间的多价相互作用控制着广泛的免疫恢复。最新，标准的SPR（表面等离子体共振）竞争测定在很大程度上是为了评估从单糖单元（低亲和力，MM）到多价元素拮抗剂（中等亲和力，µm）的结合特性。在此，我们报告了SPR竞争测定法的典型案例研究表明，它们低估了糖类群体抑制DC-SIGN和固定的糖缀合物之间相互作用的效力。本文描述了在DC-Sign取向的表面上的SPR直接相互作用的设计和实现，可扩展到其他C型凝集素表面，如这种Langerin。此设置提供了从多价糖类群体以及来自细胞内存纳米群中组织的DC-SIGN四聚体同时发出的内在亲戚生成的微观概述。为此，通过链球菌 /链霉菌素相互作用对DC-sign的共价生物构捕获提供了四聚dc-sign的保存以及所有活动位点的可访问性 /功能。从经过测试的糖类群落文库中，我们证明了脚手架结构，价值和基于糖基的配体对于达到DC-Sign的纳摩尔亲和力至关重要。GlyCocluster 3.D说明了此组中DC-Sign表面（KD = 18 nm）的最紧密结合伙伴。此外，可以在多价尺度上轻松分析胶质d的一致尺度的选择性，以比较其在不同C型凝集素固定的表面上的结合。这种方法可能会引起对导致亲和力的多价结合机制的新见解，并为有希望的特定和多价免疫调节剂的结合效力做出了重大贡献。
共价药物发现的最新进展
摘要：α-葡萄糖苷酶（AGS）抑制剂被认为是管理2型糖尿病（T2DM）的理想目标，因为它们可以通过延迟碳水化合物的消化并减少单糖的吸收来维持可接受的血糖水平。在我们从天然来源的采矿Ag抑制剂中努力的过程中，两个红树林衍生的放线菌的培养汤WHUA03267和链霉菌sp。WHUA03072对AGS表现出明显的抑制活性。A subsequent chemical investigation into the two extracts furnished 28 secondary metabolites that were identified by spectroscopic methods as two previously undescribed linear polyketides 1 – 2 , four benzenoid ansamycins 3 – 6 , fourteen cyclodipeptides 7 – 18 , one prenylated indole derivative 19 , two fusicoccane-type diterpenoids 20 – 21 , two羟氨酸铁载体22 - 23，其他五五个24 - 28。在所有分离株中，第一次从放线菌获得了11和24，而以前从未有20-21个以前发生在海洋衍生的微生物中。在体外AG抑制性测定中，化合物3、8、9、11、14、16和17在中度活性上表现出效果，IC 50值在35.76±0.40至164.5±15.5 µm之间，与Acarbose相比（IC 50 = 422.3±8.4 µm）。第一次报告了3、9、14、16和17的AG抑制活性。特别是，自溶（3）代表了据报道具有AGS抑制活性的第一个Ansamycin衍生物。动力学分析和分子对接，以分别确定这些抑制剂的抑制类型和结合模式。在MTT分析中，3、8、9、11、14、16和17对人正常肝细胞（LO2）细胞没有明显的细胞毒性，这表明这些AG抑制剂的安全性令人满意。
卵巢早衰患者卵泡液的微生物群落和代谢特征
卵巢早衰（POI）是一种临床综合征，特征为40岁前卵巢活动减少，伴有闭经或月经不调等月经紊乱，促性腺激素水平高而雌激素水平低。任何阶段POI的根本原因可能是原始卵泡数量减少、细胞凋亡或卵泡破坏增加以及对促性腺激素刺激的反应无效（1、2）。遗传因素、免疫、医学因素、炎症等是已知的POI风险因素。然而，超过50%的POI病例原因不明（3-6）。最近发现肠道菌群可以影响卵巢功能（7）。POI 患者的肠道菌群发生显著变化，表现为厚壁菌门、拟杆菌门和粪杆菌门的丰富度降低，变形菌门和拟杆菌门的丰富度增加。生态失衡和肠道菌群多样性的降低会降低 β-葡萄糖醛酸酶的活性，导致雌激素活性降低 (8)。肠道菌群与血清雌激素、促卵泡激素、黄体生成素和抗苗勒氏管激素水平存在相关性 (9 – 11)。肠道菌群失衡也与自身免疫性 POI 有关。肠道菌群失衡不仅影响B淋巴细胞的活化和自身抗体的产生，还会诱导先天免疫细胞的异常活化，导致促炎性细胞因子的上调。肠道菌群与免疫系统平衡的破坏会加剧POI的进展（12）。卵泡液（FF）是卵母细胞发育的直接微环境，并非无菌。它由卵巢的血浆渗出液和局部分泌物组成，富含单糖、蛋白质、类固醇激素、细胞因子和生长因子。因此，FF被认为是微生物的优良生长培养基（13）。研究表明，不孕女性的卵泡液中微生物群的组成和丰富度存在显著差异，这些变化是