这项研究得到了日本学术振兴会 (JSPS) KAKENHI(资助编号:18H03974、19KK0401、22K19238、23H00367、24K02010、22H04922(AdAMS))、日本科学技术振兴机构 COI-NEXT(JPMJPF2010)和日本医疗研究发展机构 (AMED)(24bm12230009)的支持。 名词解释(注1) CRISPR-Cas3:许多细菌都有一种名为CRISPR-Cas系统的防御系统,类似于适应性免疫。 CRISPR-Cas3属于1类CRISPR系统,2019年被报道为一种使用多蛋白复合物人工切割DNA的国产基因组编辑工具。 (注2)脱靶突变:在基因组编辑技术中,DNA序列中非预期的突变发生在特定目标序列以外的位置。最大限度地减少脱靶突变被认为对于基因组编辑技术的高度安全性至关重要。 (注3)长读测序:与传统方法相比,一次分析更长片段的DNA或RNA碱基序列的技术。在本研究中,我们使用了纳米孔测序方法,这是一种通过将序列穿过纳米级孔(纳米孔)实现高速解码的技术。
增加的干旱威胁着土壤微生物群落及其在农业土壤中控制的多种功能。这些土壤通常被矿物营养物质受精,但尚不清楚这种施肥如何改变土壤多功能性(SMF)的能力,以维持干旱,以及植物土质相互作用如何影响这些效果。在这项研究中,我们使用山草原土壤来测试矿物营养素(氮和磷)添加的互动效应,并在中间有和没有植物(Lolium Perenne)的SMF上进行了干旱,并在中含有植物中(Lolium Perenne)。我们根据与土壤微生物在其生物量中储存碳(C),氮(N)和磷(P)的能力相关的8个微生物特性计算了SMF,并通过有机物解聚,矿化,硝化,硝化物和否定性加工来处理这些元素。为了研究SMF响应的基础机制,我们表征了使用16S和18S rRNA扩增子测序的土壤化学计量和微生物群落组成的提示变化。我们的结果表明,在植物存在时,受精会降低SMF干旱的耐药性,但在未种植的山地草原土壤中观察到了相反的情况。我们的分析表明,这是由于植物的相互作用,受精和干旱造成了与高SMF相关的四种耦合特性:高土壤水分,低蛋白质C限制,高细菌多样性和低细菌革兰氏革兰氏阳性阳性:革兰氏阳性:革兰氏负比例。总的来说,我们的结果表明,减少矿物肥料在山地草原中的植物生产可以提高土壤在干旱期间保持其多功能性的能力。最后,我们的研究清楚地证明了植物在SMF对全球变化的复杂反应中的重要性,并表明结合化学计量和微生物多样性评估是一种强大的方法,可以解散基本机制。
图1。土壤对干旱和受精的多功能反应,有或没有植物。星星表示干旱和正常气候治疗之间的显着差异。np =无植物,p =植物存在,f =受精,nf =无施肥。灰色=未植入的土壤,绿色=种植土壤,浅色=未施用的土壤,深色=受精的土壤。
使用人尿作为农作物肥料,由于其潜在的好处引起了兴趣,但其应用对尿液如何影响土壤功能和微生物群落有所了解。本研究旨在阐明土壤细菌群落对用人尿液施肥的反应。为此,菠菜作物被2种不同剂量的分离和储存的人类尿液(170 kg n ha-1 + 8.5 kg p ha-1和510 kg n ha-1 + 25.5 kg p ha-1),并与合成受肥(170 kg n ha-h ha-8.5 ka + p ha-5 k p ha-5 k p ha-1)相比根据随机块方案,在温室条件下在四个土壤罐中进行了实验。我们在开始时和土壤和植物特性的开始时评估了尿液和土壤细菌组成的地位,以了解细菌组成变化中的驱动因素。储存12个月后,尿液具有耗尽的微生物组,但仍然含有很少的尿液或粪便菌株。总体而言,土壤细菌群落对尿液施肥有抵抗力,只有3%的分类单元受到影响。然而,与合成肥料相比,尿液受精的硝化和反硝化基团的相对丰度,这意味着在用尿液施肥时可能会发出更多的n 2 o,而无需发出。尿液的高盐浓度对BAC群落几乎没有明显的影响。在更广泛的背景下,该实验提供了证据表明,一年储存的尿液可以应用于植物土壤系统,而不会在短期内对土壤细菌群落产生负面影响。
受精卵电穿孔是小鼠中 CRISPR/Cas9 介导的基因组编辑中复杂的原核注射程序的快速替代方法。然而,目前的电穿孔方案要么需要投资专门的电穿孔仪,要么需要对受精卵进行腐蚀性预处理,这会损害胚胎的活力。在这里,我们描述了一种易于适应的方法,通过使用带有合成 CRISPR/Cas9 组件的普通电穿孔仪对完整的受精卵进行电穿孔,高效地在小鼠中引入特定突变,并且技术要求最低。该方案可有效处理来自各种遗传背景的受精卵,并与其他 CRISPR 核酸酶(如 Cas12a)兼容。
摘要:农作物的水状态直接受土壤水的供应影响。因此,本研究旨在分析不同土壤水分含量(80、90、100、100、110、110、110、110和120%的现场容量-FC)和受精系统(常规和施肥)的玉米中的水关系(双跨混合AG 1051)。该实验是在2019年8月至2019年10月至10月的巴西雷夫市,在巴西佩尔南布科州雷·佩恩市的农村乡村农村乡村的农业工程系中进行的实验。实验设计是具有5×2阶乘方案的随机块,四个重复和40个实验单元。在土壤湿度水平以下低于田间容量(100%FC)的100%,增加了玉米植物的相对水分含量,叶片,叶水的潜力和渗透调节。与常规施肥相比,施肥会导致较高的蒸腾率和以95%的田间容量(95%FC)灌溉的农作物中的水效率提高。在提交土壤水分水平以下的植物中,受精系统会影响水,渗透和压力潜力,以及渗透调节。
摘要:农作物的水状态直接受土壤水的供应影响。因此,本研究旨在分析不同土壤水分含量(80、90、100、100、110、110、110、110和120%的现场容量-FC)和受精系统(常规和施肥)的玉米中的水关系(双跨混合AG 1051)。该实验是在2019年8月至2019年10月至10月的巴西雷夫市,在巴西佩尔南布科州雷·佩恩市的农村乡村农村乡村的农业工程系中进行的实验。实验设计是具有5×2阶乘方案的随机块,四个重复和40个实验单元。在土壤湿度水平以下低于田间容量(100%FC)的100%,增加了玉米植物的相对水分含量,叶片,叶水的潜力和渗透调节。与常规施肥相比,施肥会导致较高的蒸腾率和以95%的田间容量(95%FC)灌溉的农作物中的水效率提高。在提交土壤水分水平以下的植物中,受精系统会影响水,渗透和压力潜力,以及渗透调节。
用户和机器学习专家的整合是艺术智能文献中广泛研究的主题。同样,人类计算机相互作用研究广泛探讨了影响AI作为决策支持系统的因素。在这项实验研究中,我们调查了用户对专家在此类系统开发中整合的偏好,以及这如何影响他们对这些系统的依赖。具体来说,我们专注于特征选择的过程,这是由于机器学习模型对透明度的不断增长而变得重要的元素。我们区分了三种特征选择方法:基于算法,基于专家的方法和一种组合方法。在第一次治疗中,我们分析了用户对这些方法的偏爱。在第二次治疗中,我们将用户随机分配给三种方法之一,并分析该方法是否影响建议依赖。用户预先使用合并的方法,然后是基于专家的和基于算法的方法。但是,第二种处理中的用户同样依赖于所有方法。因此,我们发现所陈述的偏好和实际用法之间存在显着差异,从而揭示了态度 - 行为差距。允许用户选择自己的首选方法没有效果,偏好和依赖程度是特定的。这些发现强调了理解AI支持决策中认知过程的重要性,以及在人类互动中进行行为实验的需求。
珊瑚 - 阿尔加尔共生的代谢动力学从受精到定居点确定1关键的珊瑚能量脆弱性2 3作者和作者分支机构4 5 Ariana S. Huffmyer 1,2,6 *,Kevin H. Wong 3,Wong 3,Danielle M. Becker 2,Emma Strand 4,Emma Strand 4,Tali Mass 5,Tali Scii 6 M.美国华盛顿州华盛顿州华盛顿市9 2美国罗德岛大学生物科学系,美国,美国,美国,金斯敦10 3罗森斯特海洋与大气科学学院,海洋生物学系,海洋生物学系和11个生态学,迈阿密迈阿密大学,佛罗里达州迈阿密大学,美国佛罗里科学,14 Haifa大学,山Carmel,Haifa,Haifa,以色列15 6 LEAD联系Ashuffmyer@gmail.com 16 17 *通讯:Ariana S. Huffmyer,Ashuffmyer@gmail.com 18 19摘要20 21气候变化加速珊瑚礁的下降,并危及22生态系统恢复的招聘必不可少。 成年珊瑚依靠其共生藻类23(共生性藻类)的重要营养交换,但是这种依赖从受精到24种招募的动力和敏感性被认为是被认为的。 我们调查了蒙蒂普拉·马蒂塔(Montipora Capitata)的13个发育阶段的生理,代谢组和25个转录组变化,这是26个夏威夷的珊瑚,该珊瑚在夏威夷26中继承了从父母到鸡蛋的共生体。 我们发现胚胎发育27取决于母体提供的mRNA和脂质,并在游泳幼虫中迅速转移到了共生体衍生的28营养。 共生的密度和光合作用峰一旦游泳至燃料29层幼虫分散。 44Carmel,Haifa,Haifa,以色列15 6 LEAD联系Ashuffmyer@gmail.com 16 17 *通讯:Ariana S. Huffmyer,Ashuffmyer@gmail.com 18 19摘要20 21气候变化加速珊瑚礁的下降,并危及22生态系统恢复的招聘必不可少。成年珊瑚依靠其共生藻类23(共生性藻类)的重要营养交换,但是这种依赖从受精到24种招募的动力和敏感性被认为是被认为的。我们调查了蒙蒂普拉·马蒂塔(Montipora Capitata)的13个发育阶段的生理,代谢组和25个转录组变化,这是26个夏威夷的珊瑚,该珊瑚在夏威夷26中继承了从父母到鸡蛋的共生体。我们发现胚胎发育27取决于母体提供的mRNA和脂质,并在游泳幼虫中迅速转移到了共生体衍生的28营养。共生的密度和光合作用峰一旦游泳至燃料29层幼虫分散。44相反,在30个变形,沉降和钙化期间,呼吸需求显着增加,反映了这种能量密集型形态学31重组。共生植物的增生是由共生铵同化32驱动的,珊瑚宿主中氮代谢几乎没有证据。随着发育的进展,33个宿主会增强氮隔离,调节共生体种群,并确保固定碳的34转移以支持变态,并具有代谢组和转录组35碳水化合物可用性的指标。尽管藻类共生群落群落保持36个稳定,但细菌群落随着个体发育而转移,与Holobiont代谢37重组有关。我们的研究揭示了开发过程中的广泛代谢变化,38越来越依赖共生营养。变形和沉降是针对预测的气候场景的最大39个关键时期,破坏了40个共生的稳定。相对于敏感的41早期生命阶段,这种高度详细的共生营养交换提供了理解和预测营养的基本知识42共生42共生融合,特别是在气候43变化的未来中,珊瑚生存和招募。