在肠道菌群中,细菌是最近基于非培养的分子技术的出现,例如16S核糖体核糖核酸(RRNA)基因测序和shot弹枪元素分析,允许细菌的表征以及其潜在的作用,而不必在其范围内表征它们,而不必在其范围内进行表征。16S测序放大了这个高度保守的1,500个碱基对基因(在所有细菌和古细菌中发现),以允许属水平鉴定。这在很大程度上被元基因组方法取代,这些方法将样品中所有脱氧核糖核酸(DNA)序列。宏基因组方法提供了更高的系统发育分辨率,从而允许物种水平的鉴定,还可以提供有关细菌基因功能的信息。其他技术,例如转录组学
精神噬菌体是偏爱感冒的细菌。其理想的生长温度范围从-5c到15C。它们通常在冰川供应的溪流中发现,尤其是在北极和南极地区。细菌在中等温度的条件下被称为中介体繁殖。其理想的生长温度范围为25至45摄氏度。大多数细菌,包括居住在人体和普通土壤细菌上的细菌。嗜热剂是享受热量的细菌。它们在45至70摄氏度的温度下蓬勃发展,并且经常在堆肥和温泉中发现。细菌被称为高疗中的细菌在极度炎热的环境中壮成长。其理想的生长温度从70C到110c。它们通常属于古细菌,可以在非常深的海洋深处的水热通风口中找到。
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 和 CRISPR 相关蛋白 (Cas9) 系统是一种适应性免疫反应防御机制,古细菌和细菌利用该机制来降解外来遗传物质。该机制可以重新用于其他功能,包括哺乳动物系统的基因组工程,例如基因敲除 (KO) (1,2) 和基因激活 (3-5)。CRISPR 激活质粒产品利用与 VP64 激活域融合的 D10A 和 N863A 失活 Cas9 (dCas9) 核酸酶与 sgRNA (MS2) 结合,从而实现特定基因的识别和上调,sgRNA (MS2) 是一种靶向特异性 sgRNA,经过设计可结合 MS2-P65-HSF1 融合蛋白 (5)。这种协同激活介质 (SAM) 转录激活系统* 提供了一个强大的系统,可最大限度地激活内源性基因表达 (5)。
在原核生物中,CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)最初是作为防御入侵质粒和病毒的机制而开发的。Ishino 于 1987 年首次发现 CRISPR 结构。1 在其他细菌和古细菌中发现许多类似结构后,Jansen 于 2002 年创造了 CRISPR 这个绰号。2-3 后来,Mojica 及其同事推测 CRISPR 模式及其相关蛋白质可以抵御遗传影响,并可能具有免疫防御活性。4 然而,这一领域的三位主要贡献者是 Charpentier、Doudna 和 Zhang。CRISPR Cas-9 的机制首先由 Charpentier 阐明。后来 Charpentier 和 Doudna 报道了 Cas-9 介导的生化表征和系统优化。5 张是第一个在多细胞生物中实现 CRISPR Cas-9 遗传修饰的人。6
微生物群落中的土壤中的微生物群落仍然在很大程度上未知,尽管它们在温室气体的循环中起着重要作用。在这里,我们报告了从挪威北部Rásttigáisá的矿物苔原土壤中回收的59种非冗余元基因组组装基因组(MAGS)。通过根据四核苷酸频率和差异覆盖范围来通过聚类重叠群来获得MAG,并进行手动策划以去除具有外围GC含量和/或平均覆盖率的重叠群。大多数MAG被分配到细菌门念珠菌(n = 12),verrucomicrobiota(n = 10)和酸眼杆菌(n = 9)。所有古细菌(n = 4)属于硝基果酸念珠菌(Themoproteota)。59Rásttigáisámags扩大了我们对苔原微生物组的多样性和生态作用的了解。
成簇的规律间隔短回文重复序列 (CRISPR) 和 CRISPR 相关蛋白 (Cas9) 系统是一种适应性免疫反应防御机制,古细菌和细菌利用该机制来降解外来遗传物质。该机制可以重新用于其他功能,包括哺乳动物系统的基因组工程,例如基因敲除 (KO) (1,2) 和基因激活 (3-6)。CRISPR 激活质粒产品利用与 VP64 激活域融合的 D10A 和 N863A 失活 Cas9 (dCas9) 核酸酶与 sgRNA (MS2) 结合,从而实现特定基因的识别和上调,sgRNA (MS2) 是一种靶向特异性 sgRNA,经过设计可结合 MS2-P65-HSF1 融合蛋白 (6)。这种协同激活介质 (SAM) 转录激活系统提供了一个强大的系统,可最大限度地激活内源性基因表达 (6)。
组织委员会很高兴欢迎您参加2025年6月15日至19日在芬兰赫尔辛基举行的土壤微生物生态学会议。以前的会议吸引了来自世界各地的参与者。ESM会议是一个跨学科平台,涉及与单个微生物(古细菌,细菌,真菌,Oomycetes,原生动物和病毒),微生物群落及其生态网络有关的问题。现代基因组,转录组和蛋白质组学方法与基于土壤化学,生化和功能分析的方法联系在一起,土壤动物区系和植物生态学的探索。他们亲切地邀请所有这些学科的专家加入赫尔辛基,以促进土壤生态学领域的最先进研究,并享受北部仲夏的疯狂!查看更多信息,请访问https://www.lyyti.fi/p/ecologe_of_soil_mircoornismss2025_9620/en/conference
卤素是适合生活在高盐环境和其他盐水产品中的微生物。它们中的大多数属于细菌和古细菌领域,它们的兴趣既有特殊的相关性,既是其对极端条件的适应机制及其潜在的生物技术应用。近年来,卤素的隔离和分类表征使我们能够详细了解它们的异质性,其代谢和生理多样性,或生态分布和生物多样性。与文化无关的技术,例如宏基因组学和 - 学研究,特别是在这方面提供了激励这些研究,因为在这方面仍然有一个巨大的领域要探索。在本期的微生物特刊中,邀请您发送有关生物学,分类法,生物多样性和生物技术的贡献(原始文章和评论),这些生物学微生物的应用以及使用基因组学和化合物方法研究微生物社区的方法。
总计:60个学分:04单元I:微生物学历史小时:08发现微生物;自发产生与生物发生;现代微生物学的历史记载;从Leeuwenhoek到Craig Venter,包括Antonvon Leeuwenhoek,Louis Pasteur的贡献Chakravarty。微生物学的黄金时代;微生物学的范围。单元II:分类号小时:04微生物的王国分类:海克尔的三个王国概念,惠特克的五个王国概念,六个王国分类,八个王国分类,三个领域的卡尔·沃斯概念。微生物的定义,数值和化学分类法,伯吉手册III介绍:细胞微生物号小时:20种细菌:细菌的形态,结构曲线,细胞膜,细胞膜,弗拉格尔LA,pili,pili,核糖体,核苷,细胞质灌注和真菌;真菌;真菌:一般charactacte and Charactacte and Characters and centractrancontrastrastrancontrastrancontrastorebareandspecialsistical; proteo specialsistical; paramaecium;藻类:一般特征。植物学的历史,重点是印度科学家的贡献; Unitiv:细胞微生物号小时:病毒,prions和噬菌体的10个特征;超微结构:衣壳,包络的类型,类型和结构型夫妇;培养基和肉毒杆菌;多重病毒; ly ticand lysogenycycleycleycleycleycleycleycyclecofisphage。Unitv:极端环境中的微生物。小时:08自然,嗜热,甲烷作和卤素古细菌的特殊特征;光合细菌,蓝细菌一些古细菌生活在寒冷和空间等极端条件下。单位VI:微生物的有用和有害方面小时:10个有益的微生物:微生物作为生物肥料,微生物生物修复,微生物在自然界中的作用,产生微生物的抗生素和其他工业有用的微生物[工业有用的产品的名称和生产微生物]。致病性微生物:人类常见细菌,真菌和病毒疾病的清单[疾病的名称,病原体,受影响的部分]
致编辑 — 过去 20 年里,DNA 测序和生物信息学技术的飞速发展大大提高了我们对微生物世界的了解。这种日益增长的了解涉及微生物的巨大多样性;微生物区系和微生物组如何影响疾病 1 和医学治疗 2;微生物如何影响地球的健康 3 ;以及微生物组生物技术在医学 4 、法医 5 、环境 6 和农业 7 应用的新兴探索。这方面的工作大部分是由标记基因调查(例如,细菌/古细菌的 16S rRNA 基因、真菌内部转录间隔区和真核生物的 18S rRNA 基因)推动的,这些调查以不同程度的分类特异性和系统发育信息来分析微生物区系。该领域目前正在转向整合其他数据类型,如代谢物 8 、宏蛋白质组 9 或宏转录组 9,10 图谱。