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World File Search System可起作
作者校正：一个多线屏幕确定人类癌症中可起作的合成致命相互作用
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循环肿瘤DNA可以对癌症类型的可起作基因融合和重排的敏感检测
摘要◥目的：基因组重排可以产生有效的致癌驱动因素或破坏肿瘤抑制基因。本研究检查了循环肿瘤DNA（CTDNA）在不同癌症类型的循环肿瘤DNA（CTDNA）检测到的融合局势和重排的景观。实验设计：使用FoundationOneleliquid CDX（一种杂交捕获测序平台，从53,842例患者进行66例实体瘤类型的患者的LBX，该LBX被降低，该平台查询了324个与癌症相关的基因。使用粉底核定型的组织活检（TBX）利用为比较器。结果：在所有LBX中，有7,377（14％）检测到≥1个致病后脉冲。总共3,648（6.8％）LBX具有≥1个功能（GOF）致癌基因重排，而检测到4,428（8.2％）LBX的功能障碍障碍丧失。癌症类型具有较高的GOF重排率的癌症类型包括
有丝分裂检查点激酶BUB1是腺样囊性癌中MYB的直接且可起作的靶标
缩写ACC，腺样囊性癌；芯片，染色质免疫沉淀； CHIP-SEQ，染色质免疫沉淀测序； dab，二氨基苯甲胺； dox，多西环素； EV，空矢量； FDR，错误发现率； GFP，绿色荧光蛋白；去，基因本体论； GSEA，基因集富集分析； HEGF，人类表皮生长因子； Mac，基于模型的芯片序列分析； MBS，MYB绑定站点； NES，归一化富集评分； NSG，正常的唾液腺； p adj，p值调整； PDX，患者衍生的异种移植物； penstrep，青霉素 - 链霉素； RLU，相对光单元； RMA，强大的多阵列平均值； RNA-seq，RNA测序； RT-QPCR，实时定量PCR； siRNA，小干扰RNA； TMA，组织微阵列； TSS，转录开始站点；谁，世界卫生组织； XPDX，Xenostart患者衍生的异种移植物。
ASTER：一种预测临床可起作用的合成致死相互作用
摘要。合成致死（SL）的相互作用是两个基因或功能实体之间的功能关系，其中任何一个实体的丧失都是可行的，但两者的丧失都是致命的。这样的对可用于开发具有较少侧面作用并减少过度治疗的靶向抗癌疗法。但是，发现临床上可行的SL相互作用仍然具有挑战性。利用无病和癌性数据的大规模统一的基因表达数据，我们根据统计假设检验设计了一种新技术，称为Aster（通过与t发行的无疾病的无效G e nthetic杀伤性进行静脉疾病（对S ynthetic杀伤力进行，无效的疾病无效的G e noric g e noric g e noric和T r anscriptomic and t r anscriptomic数据）。对于大规模多个假设检验，我们开发了一个称为Aster ++的扩展，该扩展可以在假设检验框架内利用其他输入基因特征。我们的广泛实验表明，在准确地识别可在胃和乳腺癌中可以治疗的SL对中，Aster的效果。