图1。识别KCNQ1基因座中预测的调节元件。a)UCSC基因组浏览器视图描述了第一个内含子使用情况不同的KCNQ1的两个同工型,而KCNQ1OT1则是该位点中长的非编码RNA。同工型下方的轨道表示来自GWA的QT间隔相关的SNP,其位置在所有轨道中都延伸到灰色条上。出现的轨道描绘了基于心脏特异性数据集的预测调节元件,最低的三个轨道描绘了组蛋白公开可用的芯片seq实验的测序读取,标志着来自两个人类左心室的H3K27AC,并留下ATRIA ATRIA ATAC-SEQ-SEQ-seq实验。b)小鼠中KCNQ1基因座的UCSC基因组浏览器视图,其先前表征的远景增强子在KCNQ1的内含子1中。较低的两个曲目描绘了从胚胎第15天公开可用的小鼠心脏和前脑的ATAC-SEQ数据集的测序读数。
方法论:将共有20个白化病的雄性大鼠随机分为两组:对照组(n = 10)和吸烟组(n = 10)。吸烟组大鼠使用吸烟盒暴露于吸烟中一个月。对照组大鼠暴露于新鲜空气中。在实验结束时,所有动物均使用以太终止。将所有动物的心脏组织均固定在10%的福尔马林中。心脏组织,并染色以用于一氧化氮合酶同工型,可诱导的一氧化氮合酶(INOS),内皮一氧化氮合酶(ENOS)和神经元一氧化物氧化物合酶(NNOS)使用免疫组织化学(Indiretirect Immunoperect Immunoperoperoperapase enyme)。使用Adobe Photoshop版本7.2计算NOS同工型的表达。抗体染色的截面显微照片。像素揭示了生物标志物(棕色)和残留组织(蓝色)的存在。两组之间的关系是由独立t检验计算得出的。显着性。
•具有适当的荧光标记物的电压门控钙通道CACNA1C和CACNA1B同工型的瞬时转染稳定或瞬时表达VGCC和22亚基,用于形成功能通道所必需的SHEK293细胞。•表现出感兴趣变化的同工型将作为可诱导的稳定转染细胞系产生,以进行进一步的实验。•体外电生理学(全细胞贴片夹记录)测量生物物理参数,包括电压敏感性,电导和激活/失活动力学。•使用接近连接测定和细胞表面生物素化来鉴定新型相互作用蛋白,以测定离子通道运输到膜上。•使用包括L型钙通道的选择性阻断剂在内的一系列药物进行了VGCC蛋白质成型的药理学的解剖。•分析描述性数据,数字图像和遗传数据的电生理学,蛋白质生物化学和药理学数据集•数据交流和写作研究论文手稿。
摘要 由于抗生素耐药性的增加,霍乱弧菌在低收入国家造成了危及生命的感染。人们研究了创新的药理学靶点,霍乱弧菌编码的碳酸酐酶 (CAs,EC:4.2.1.1) (Vch CAs) 成为一个有价值的选择。最近,我们开发了一个大型对苯和间苯磺酰胺库,其特征是具有不同柔韧性程度的部分作为 CAs 抑制剂。基于停止流的酶促测定表明该库对 Vch a CA 有强烈的抑制作用,而对其他同工型的亲和力较低。特别是环脲 9c 对 Vch a CA 的抑制作用达到纳摩尔水平(KI ¼ 4.7 nM),并且对人类同工酶具有高选择性(SI 90)。计算研究揭示了部分柔韧性对抑制活性和同工型选择性的影响,并允许进行准确的 SAR。然而,尽管 Vch CA 与细菌的毒力有关而非其存活率,我们评估了此类化合物的抗菌活性,结果没有直接活性。
摘要:肝细胞癌(HCC)是全球与癌症相关死亡的最常见原因之一,其发病率正在上升。HCC几乎完全在慢性肝炎症的背景下发展,这可能是由于慢性酒精消耗,病毒肝炎或不健康的饮食而引起的。已经证明了慢性炎症性炎症的关键作用在肝癌发生过程中,包括对先天性和适应性免疫反应的放松管制。抑制AKT(也称为蛋白激酶b)直接影响癌细胞,但是这种治疗策略也表现出通过使用AKT抑制剂AZD5363,MK-2206,MK-2206,或ARQ 092。此外,AKT的同工型在其指定角色中汇聚和分歧,但是当前可用的AKT抑制剂无法显示同工型特定的特定型。因此,在HCC的背景下,需要更好地探索选择性AKT抑制作用及其与免疫疗法的结合。本综述概述了有关AKT在HCC中作用以及AKT抑制对HCC和肝肿瘤微环境的影响的紧凑型知识。
从氧化磷酸化(OXPHOS)到糖酵解的代谢转移(称为Warburg效应)是许多癌症的特征。它使癌细胞在低氧肿瘤微环境中具有生存优势,并保护它们免受氧化损伤和凋亡的细胞毒性作用。这种代谢转移的主要调节剂是丙酮酸脱氢酶复合物和丙酮酸脱氢酶激酶激酶(PDK)同工型1-4。已知PDK在几种癌症中过表达,并且与不良的预后和耐药性有关。虽然PDK1 - 3的表达是组织特定的,但PDK4表达取决于整个生物体的能量状态。与其他PDK同工型相比,不仅是致癌性,而且还报道了PDK4的肿瘤抑制功能。在肿瘤中拟合高的肿瘤和高脂肪酸合成,PDK4可以具有保护作用。前列腺癌是男性最常见的癌症的情况,使PDK4成为有趣的治疗靶点。大多数工作都集中在具有高糖酵解活性的肿瘤中的PDK上,但很少研究PDK4具有保护性并且非常需要的情况。
摘要:所有恶性肿瘤中约有20%携带RAS同工型中的突变。尽管如此,但符合治疗用途的靶向RAS的药物的缺乏效率。RAS的皮摩尔属性对于GTP而言,缺乏适合高级小分子结合的合适口袋,尽管进行了数十年的研究,但仍排除了有效的疗法。最近,KRAS-G12C的生化特性以及发现其“开关II口袋”的表征允许开发有效的突变特异性抑制剂。目前有7种KRAS-G12C抑制剂正在临床试验中,Sotorasib已成为第一个获得FDA批准的抑制剂。在这里,我们讨论了直接靶向RA的历史努力,并靶向RAS效应子信号传导的方法,包括克服单药靶向的局限性的组合。我们还回顾了KRAS-G12C抑制剂单药治疗的效率,然后进行临床前和临床证据,然后进行了旨在克服初级耐药性和延长反应持续性的组合疗法的例证。最后,我们培养了靶向非G12C突变同工型的新方法。
dejligbjerg,M.,Grauslund,M.,Litman,T.,Collins,L.,Qian,X.,Jeffers,M.,Lichenstein,H.I类同工型组蛋白脱乙酰基酶的差异作用和HELALA细胞中Belinostat或丙戊酸的酶促抑制作用。Mol Cancer 7,70。DOI:10.1186/1476-4598-7-70Mol Cancer 7,70。DOI:10.1186/1476-4598-7-70
此前,我们已经生成了肝脏和其他 45 种主要人体组织基因共表达网络 (CN),并确定了丙酮酸激酶 L/R (PKLR) 作为靶点,抑制该酶可选择性抑制肝脏中的 DNL (Lee et al., 2017)。丙酮酸激酶是糖酵解中的关键酶,PKLR 基因编码该酶的肝脏 (PKL) 和红细胞 (PKR) 同工型,并催化磷酸烯醇式丙酮酸和 ADP 生成丙酮酸和 ATP。PKL 和 PKR 同工型分别在肝脏和红细胞中特异表达。一项独立的小鼠群体研究也证实了 PKLR 在 NAFLD 发展中的驱动作用 (Chella Krishnan et al., 2018)。最近,我们在 HepG2 细胞中进行了抑制和过表达 PKLR 的体外实验,发现 PKLR 的表达与 FASN 、 DNL 、 TAG 水平的表达以及细胞生长呈显著正相关 (Liu et al., 2019)。基于这些发现,综合分析表明,可以针对 PKLR 开发一种对其他人体组织副作用最小的 NAFLD 治疗策略。