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World File Search System坏死病毒
生菜对虫害坏死病毒的遗传和生理决定因素
结果：14个领域实验中的平均DI范围为2.1％至70.4％。在经过测试的加入中观察到了DI的高度差异，在红色品种中，DI最低的DI在红色品种中检测到了最低的DI，Reed of the良好的选择，红色飞溅COS，步兵，甜蜜的情人节，Annapolis和Velvet。多个线性回归模型揭示了在DI上的四个分析决定因素中的小但显着的影响（P <0.005）。DI值较低的加入的植物发育较慢（PD，r = 0.352），ACI含量较高（r = - 0.284），TFD较低（r = 0.198）和较低的SPAD含量（r = 0.125）。一项全基因组关联研究显示，在九个生菜染色体中，位于八个di的13个QTL（例外是Chr。8）。最常见的QTL（QINSV2.1）位于Chr上。2。DI的DI QTL与PD，ACI和SPAD的QTL相同的基因组区域。chr上的di的另外三个QTL。5和8。
通过生存和病毒载量数据揭示虹鳟对传染性胰腺坏死病毒的抗性遗传学
传染性胰腺坏死病毒 (IPNV) 是虹鳟养殖业动物福利和经济的主要威胁之一。先前的研究已表明，对 IPNV 的抗性存在显著的遗传变异。这项研究的主要目的是调查虹鳟鱼苗对 IPNV 的抗性遗传结构。为了实现这一目标，610 条虹鳟鱼苗（来自 5 个公鱼和 5 个母鱼的全因子交配）接受了来自商业养殖场养殖的大西洋鲑鱼的 IPNV 分离株 (IPNV-AS) 的浴池攻击。使用三种不同的表型评估对 IPNV 的抗性；在 40 天的攻击测试期间记录在鱼上的二元存活率 (BS)、总存活天数 (TDS) 和病毒载量 (VL)。所有鱼都使用 57K Affymetrix SNP 阵列进行基因分型。IPNV-AS 分离株导致总死亡率为 62.1%。生存性状（BS h 2 = 0.21 ± 0.06，TDS h 2 = 0.25 ± 0.07）和 VL 性状（h 2 = 0.23 ± 0.08）的遗传力估计值为中等，表明在虹鳟鱼选择性育种计划中可能选择提高对 IPNV 的抗性。两个生存性状（BS 和 TDS）之间的统一估计遗传相关性表明这两个性状可被视为同一性状。相反，在 VL 和两个生存性状之间发现中等正向负遗传相关性（- 0.61 ± 0.22 至 - 0.70 ± 0.19）。许多 QTL 跨越染色体范围的 Bonferroni 校正阈值的性状的 GWAS 表明所研究性状的多基因性质。发现 10 个可能识别的基因中，大多数与免疫或病毒致病机制有关，这可能是导致 IPNV-AS 存活率显著遗传变异的原因。QTL 验证分析表明，检测到的 QTL 的三种基因型在死亡率和 VL 方面没有显著差异。VL 性状在死鱼苗中表现出较大的变异，并且与两种存活表型具有一致的模式，但死鱼苗和活鱼苗中 IPNV VL 阳性样本的比例没有显著差异
水产养殖中的基因编辑 - 粮农组织知识库
Gratacap, RL、Wargelius, A.、Edvardsen, RD 和 Houston, RD 2019。基因组编辑在改善水产养殖育种和产量方面的潜力。遗传学趋势，35(9)：672–684。Kishimoto, K.、Washio, Y.、Yoshiura, Y.、Toyada, A.、Ueno, T.、Fukuyama, H.、Kato, K. 和 Kinoshita, M. 2018。通过 CRISPR/Cas9 基因组编辑培育出骨骼肌质量增加、体长缩短的红鲷品种 Pagrus major。水产养殖，495：415–427。Norris, A. 2017。基因组学在鲑鱼水产养殖育种计划中的应用：谁知道基因组革命将把我们带向何方？海洋基因组学，36：13–15。 Pavelin, J.、Jin, YH、Gratacap, RL、Taggart, JB、Hamilton, A.、Verner-Jeffreys, DW、Paley, RK、Rubin, C.、Bishop, SC、Bron, JE、Robledo, D. 和 Houston, R. 2021. nedd-8 活化酶基因是大西洋鲑对传染性胰腺坏死病毒具有遗传抗性的基础。基因组学，113(6): 3842–3850。
有关鱼类种群基因组学区域培训课程
水产养殖是增长最快的领域之一，预计将进一步增长，以便为不断增长的人口提供食物。彩虹鳟鱼的文化（Oncorhynchus mykiss）是拉丁美洲和加勒比海地区（LAC）地区的主要水产养殖活动之一，是世界第二大生产国。水产养殖主要是由经济资源低的农村社区开发的。因此，该地区的许多国家缺乏足够的基础设施。合格人员；流行病学监测；和足够的卫生控制。由于没有及时的诊断，该地区由于进入边境病原体的进入而经历了鳟鱼种植的死亡率提高。该项目旨在加强鳟鱼种植，以降低由于感染性胰坏死病毒（IPNV）和新兴疾病而引起的彩虹鳟鱼的高死亡率。该项目完全符合区域战略概况（RSP）2022 - 2029年《区域合作协议促进拉丁美洲核科学和技术》和加勒比海（Arcal）（ARCAL）的核科学和技术协议（ARCAL），该协议广泛面向贫困，通过通过内地进行粮食的粮食安全，从而终止荒原和康复，从而降低了贫困。核与核技术的应用，例如分子工具在动物生产和健康中，将发展和升级参与国家的检测和分化鳟鱼疾病的能力，以及鉴定与病毒疾病抵抗的免疫反应以及与免疫反应和遗传机制相关的遗传模式。新的生物技术用于通过分子表征和诊断不同病原体的诊断来促进该部门的健康（RSP 2022 - 2029）。这将有助于积极影响脆弱的社区，并将水产养殖和将水产养殖定位为自我 - 在该地区足够的活动。
基因组学
对大西洋鲑鱼中传染性胰坏死病毒（IPNV）的遗传抗性是一个罕见的特质例子，其中一个基因座（QTL）几乎解释了几乎所有遗传变异。基于此QTL的遗传标记测试在鲑鱼染色体上的26染色体已广泛应用于选择性育种，以显着降低疾病的发生率。在当前的研究中，全基因组测序和功能注释方法被应用于表征QTL区域中的基因和变体。这是通过对IPNV挑战的纯合抗性和纯合易感基因型的鲑鱼炸之间差异表达的分析来补充的。这些分析指向NEDD-8激活酶1（NAE1）基因是QTL效应的推定功能候选者。通过NAE 1基因的CRISPR-CAS9敲除NAE 1在IPN耐药性中的作用，并在大西洋鲑鱼细胞系中NAE1蛋白活性的化学抑制作用，这两者都导致生产性IPNV复制的降低显着降低。相比之下，先前声称为病毒的细胞受体的候选基因的CRISPR-CAS9敲除（CDH 1）对生产性IPNV复制没有重大影响。这些结果表明，NAE 1是影响鲑鱼中对IPNV抗性的主要QTL的原因，提供了进一步的证据，证明了Neddylation在宿主病原体相互作用中的关键作用，并突出了将高通量基因组学方法与TAR GETED基因组编辑结合的遗传基础的疾病抗病基础的高通用基因组学方法的价值。
水生生物疾病 67:191
摘要：传染性皮下和造血组织坏死病毒（IHHNV）在泰国养殖的斑节对虾和南美白对虾中广泛存在。它会导致南美白对虾出现身体异常和生长迟缓的矮小畸形综合征，但不会导致斑节对虾出现明显的疾病。在这两个物种中，该病毒可能会在外胚层和中胚层组织中产生 Cowdry A 型内含物，但这些在南美白对虾中很常见，而在斑节对虾中很少见。使用 IHHNV 特异性 PCR 引物可以更容易地在这两个物种中检测到该病毒。通过使用特异性 IHHNV 探针进行原位杂交（ISH），与心肌细胞相关的固定吞噬细胞在这两个虾种中往往表现出强烈的阳性反应。仅凡纳滨对虾的卵巢和神经组织（神经节中的神经元和神经索中的神经胶质细胞）对 IHHNV 呈 ISH 阳性。通过透射电子显微镜检查，在 IHHNV 感染的凡纳滨对虾的鳃中发现了坏死细胞，而在 IHHNV 感染的斑节对虾的淋巴器官中发现了病毒体的准晶状阵列和凋亡细胞而不是坏死细胞。因此，斑节对虾的细胞凋亡可能是 IHHNV 临床疾病缺失的原因之一。这些结果揭示了这两种虾对 IHHNV 感染的不同反应。斑节对虾 IHHNV 感染的一个奇怪特点是，通过 ISH 和实时 PCR 检测到的不同样本组织之间的比较病毒载量不一致。这种明显的组织偏好的不一致以及两种虾类之间不同细胞反应的原因仍然无法解释。