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CRISPR-CasとOMEGashisutemuの分子基盘 - 生化学
202. 3) Wang, JY, Tuck, OT, Skopintsev, P., Soczek, KM, Li, G., Al-Shayeb, B., Zhou, J., & Doudna, JA (2023) 通过 CRISPR 修剪器整合酶进行基因组扩展。Nature，618，855 ‒ 861。4) Wang, JY, Pausch, P., & Doudna, JA (2022) CRISPR-Cas 免疫和基因组编辑酶的结构生物学。Nat. Rev. Microbiol. , 20 , 641 ‒ 656。5) Anzalone, AV、Randolph, PB、Davis, JR、Sousa, AA、Ko-blan, LW、Levy, JM、Chen, PJ、Wilson, C.、Newby, GA、Raguram, A. 等人 (2019) 无需双链断裂或供体 DNA 的搜索和替换基因组编辑。Nature，576，149 ‒ 157。6) Mehta, J. (2021) CRISPR-Cas9 基因编辑用于治疗镰状细胞病和β地中海贫血。N. Engl. J. Med.，384，e91。 7) Kapitonov, VV, Makarova, KS, & Koonin, EV (2015) ISC，一组编码 Cas9 同源物的新型细菌和古细菌 DNA 转座子。J. Bacteriol. ，198，797 ‒ 807。8) Altae-Tran, H., Kannan, S., Demircioglu, FE, Oshiro, R., Nety, SP, McKay, LJ, Dlakić, M., Inskeep, WP, Makarova, KS, Macrae, RK, et al. (2021) 广泛分布的 IS200/IS605 转座子家族编码多种可编程的 RNA 引导的核酸内切酶。 Science , 374 , 57 œ 65。9) Weinberg, Z., Perreault, J., Meyer, MM, & Breaker, RR (2009) 细菌宏基因组分析揭示的特殊结构化非编码 RNA。Nature , 462 , 656 œ 659。10) Hirano, S., Kappel, K., Altae-Tran, H., Faure, G., Wilkinson, ME, Kannan, S., Demircioglu, FE, Yan, R., Shiozaki, M., Yu, Z., et al. (2022) OMEGA 切口酶 IsrB 与 ω RNA 和靶 DNA 复合的结构。 Nature , 610 , 575 œ 581。11) Biou, V., Shu, F., 和 Ramakrishnan, V. (1995) X 射线晶体学显示翻译起始因子 IF3 由两个通过 α 螺旋连接的紧凑的 α/β 结构域组成。EMBO J. , 14 , 4056 œ 4064。12) Schuler, G., Hu, C., 和 Ke, A. (2022) IscB-ω RNA 进行 RNA 引导的 DNA 切割的结构基础以及与 Cas9 的机制比较。 Science，376，1476 ‒ 1481。13) Bravo, JPK、Liu, MS、Hibshman, GN、Dangerfield, TL、Jung, K.、McCool, RS、Johnson, KA 和 Taylor, DW (2022) CRISPR-Cas9 错配监测的结构基础。Nature，603，343 ‒ 347。14) Aliaga Goltsman, DS、Alexander, LM、Lin, JL、Fregoso Ocampo, R.、Freeman, B.、Lamothe, RC、Perez Rivas, A.、Temoche-Diaz, MM、Chadha, S.、Nordenfelt, N. 等人 (2022) 从未培养的微生物中发现用于基因组编辑的紧凑型 Cas9d 和 HEARO 酶。Nat. Commun. ，13，7602。
在生物标志物发现的土地上的指南针
摘要由于癌症免疫疗法（SITC）原始癌症免疫疗法生物标记物资源文档的发表，因此在癌症免疫疗法方面取得了显着突破，特别是开发和批准免疫检查点抑制剂，工程性的细胞疗法以及释放抗抗活性免疫性活性的肿瘤疫苗。这些突破的最显着特征是在某些患者中实现了持久的临床反应，从而实现了长期生存。这些耐用反应已在以前不被视为免疫疗法敏感的肿瘤类型中注意到，这表明所有癌症患者可能都有可能受益于免疫疗法。然而，该领域的持续挑战是，只有少数患者对免疫疗法做出反应，尤其是那些依赖内源性免疫激活的疗法，例如检查点抑制剂和由于复杂且异构的免疫逃生机制而引起的疫苗接种，每位患者都可以发展。因此，为每种免疫疗法策略开发了可靠的生物标志物，从而实现理性的患者选择和精确组合疗法的设计，是持续成功和改善免疫疗法的关键。In this document, we summarize and update established biomarkers, guidelines, and regulatory considerations for clinical immune biomarker development, discuss well- known and novel technologies for biomarker discovery and validation, and provide tools and resources that can be used by the biomarker research community to facilitate the continued development of immuno-oncology and aid in the goal of durable responses in all patients.
估计土狼饮食和对威胁的捕食
随着由于气候变化和人类对景观的修改，世界继续变化，一些物种已受到威胁或灭绝，而另一些物种在这些新条件下蓬勃发展。土狼（Canis Latrans）自1900年代初以来就扩大了整个北美的范围，并于1970年代到达马萨诸塞州科德角。位于鳕鱼外角的鳕鱼角国家海滨是一个受保护区域，其中包含两个威胁性shore鸟物种的重要嵌套栖息地：最小的tern（胸骨antillarum）和管道plover（Charadrius Melodus）。人类的景观修饰，捕食和其他因素导致两种栖息地物种的下降和范围下降。土狼是一种机会主义的杂食动物，消耗了其环境中最容易获得的东西，包括潜在的shore鸟。然而，该生态系统中土狼捕食的毛鸟捕食程度仍然未知。为了了解土狼对受保护的海鸟的潜在影响，我们使用DNA元法编码分析了土狼饮食。这项研究的目标是（i）评估受威胁的海鸟对土狼饮食的存在和贡献，以及（ii）检查土狼饮食中的季节性和基于性别的变化。，我们在2022年秋天（景观上不存在海岸鸟）和2023年夏季（当时在景观上存在海岸鸟）并使用metabarcododing估算饮食饮食组成。我们首先将scat样品构成，以确认物种并基因分类，以识别性别和个体。我们使用样品子集的元法编码来识别shore鸟和其他脊椎动物的存在。总共我们在秋季收集了215个SCAT样本，在夏季收集了213个SCAT样本，分别确定了57个和55个独特的人（两个季节中检测到的21个人）。我们选择了从尽可能多的不同个体中选择的样品来进行元编码，从而从每个独特鉴定的土狼中提供至少一个样本。
新兴趋势和未来的粒土机会
*通讯作者： *电子邮件：mohsin3757@gmail.com摘要：泥炭培养正在处理蚕的种植和管理丝绸生产，是一个具有深厚历史根源的行业，目前处于可持续和创新实践的最前沿。本评论探讨了粒土文化中的新趋势和未来机会，强调了先进的生物技术方法，可持续实践以及丝绸应用的多元化的整合。我们研究了基因工程的重大进展，这导致了具有更好特征的蚕种，包括更高的丝绸产量和改善对疾病的耐药性。在道德上生产的对环保材料的需求不断提高，改善了采用可持续和有机灌溉实践和产品。这些技术不仅支持国际环境目标，而且还为高端丝绸产品提供新市场。研究和回收丝绸废物的可能性被研究为提高经济效率和环境可持续性的一种方式。我们还讨论了泥炭培养的各种文化和遗产方面，重点是保留传统的粒土习俗的重要性，同时适应现代技术和市场需求。关键字：蚕，桑树栽培，昆虫饲养。AI技术简介：污水是丝绸农业的古老实践，现在对各种文化的纺织工业都非常重要。丝绸的独特特性，包括其强度和质地，使其成为一项重要的服务。这个部门已经发展了几个世纪，适应了新的技术进步，环境考虑和市场需求的不断变化。本研究论文旨在深入探讨粒土文化的新兴趋势以及这些趋势所带来的潜在未来机会。但是，在现代世界中，泥炭培养更多地是关于可持续实践，技术创新和适应全球市场需求的信息，而不是仅仅生产丝绸。随着环境意识的上升，可持续的粒土培养已成为一种趋势，这是必要的。本文试图调查当代泥石植物适应环境问题的方式，包括生态可持续性和气候变化。技术，例如桑树的有机农业，这是蚕的主要食物来源，以及对丝绸的环保加工变得重要。技术的进步也改变了污点部门。引入自动化和创新育种技术正在提高丝绸产量和质量，降低人工成本以及降低环境影响。每个人都有兴趣检查正在增强粒土培养的未来的技术，从而使其更有效和有利可图。现代粒土培养的另一个关键方面是丝绸产品的多样化。丝绸用于传统纺织品以外的其他目的，例如创建高科技材料和化妆品以及生物医学行业。由于这一市场的扩张，创新和增长有很多前景。此外，经济全球化，非洲和拉丁美洲的新兴市场以及亚洲和欧洲的传统强国以及新兴市场为一种新的机会创造了新的机会。讨论：蚕的基因工程：将基因工程引入污水表明该领域最重要的进步之一。蚕（Bombyx Mori）是丝绸生产中使用的主要物种，是广泛的遗传研究和操纵的主题，导致突破超出了纺织工业的传统界限。这项研究的另一个关键方面是围绕粒土工程的伦理和环境考虑因素。与任何形式的遗传修饰一样，人们对对生态系统的关键影响以及有关被操纵的生物体的伦理辩论感到担忧。特别需要专注于这些问题，表达了对蚕中基因工程所带来的好处和挑战的平衡观点。丝绸部门由于其质量更高和新应用而有可能体验巨大的经济扩张。
联邦土地上可再生能源的潜力
致谢 本研究由美国能源部 (DOE) 的国家可再生能源实验室根据合同编号 DE-AC36-08GO28308 完成，该实验室由可持续能源联盟有限责任公司运营。我们感谢能源部政策办公室和能源效率与可再生能源办公室的资金支持，以及能源部地热技术办公室对本研究中使用的地热建模能力的支持。我们特别感谢能源部研究团队的核心成员 (Keith Benes、Angela Guiliani、Kendra Kostek、Kelsey Landau、Davie Nguyen 和 Raph Tisch) 在整个研究过程中以及对本报告的审查中给予的支持。我们还要感谢来自美国联邦合作部门和机构的众多个人 (见附录 A) 对这项合作研究的贡献。我们感谢 Jeremy Bluma (土地管理局)；Erin Strasser 和 Thomas Wittig (美国鱼类和野生动物管理局)；Stephanie Rice (空军)； Sophie Godfrey-McKee、Joshua Hanson 和 Haninah Levine（白宫环境质量委员会）；以及 Karen Anderson（白宫气候政策办公室）对本报告进行审查。
第63届实践研讨会“人工智能基础”
第63届实践研讨会“人工智能的基础”主办方：日本岩土工程学会关西支部（公益社团法人）岩土工程领域ICT应用推进研究委员会近年来，人工智能渗透到各个领域，越来越趋向实用化。然而现实情况是，很多人对于如何实现人工智能知之甚少。 因此，今年的实践研讨会主要针对那些从未研究过人工智能的人，以及那些在工作中负责人工智能但对其实现方式不太熟悉的人。它将包括帮助学生了解人工智能基础知识的讲座，以及使用人工智能对岩石标本进行分类的实践练习。通过练习，你将学习如何设置 Python 环境、如何运行它以及如何评估结果。本内容以推进岩土工程领域ICT应用研究委员会举办的AI研究会为基础。我们期待您的参与。 时间：2021 年 9 月 14 日（星期二）举办方式：关西大学 100 周年纪念馆特别会议室（根据新冠肺炎疫情形势，研讨会将通过 Zoom 在线举行）（大阪府吹田市山手町 3-3-35）交通方式：从阪急“关大前”站南口步行约 3 分钟详情请参阅 http://www.jgskb.jp/japanese/gyoujipdf/2021/20210914jitugi-seminar_kaijou.pdf 内容
