免疫系统中主要的组织相容性复合物(MHC)I类和II类分子的关键作用已得到很好的确定。本研究旨在开发一种新型的机器学习框架,用于通过MHC I类和II类分子预测抗原肽表现。通过整合大规模质谱数据和其他相关数据类型,我们基于深度学习提供了预测模型ONMIMHC。我们使用独立的测试集对其性能进行了严格的评估,ONMIMHC在MHC-I任务中的PR-AUC得分为0.854,Top20%-PPV为0.934,这表现优于现有方法。同样,在MHC-II预测的域中,我们的模型ONMIMHC的PR-AUC得分为0.606,TOP20%-PPV为0.690,表现出优于其他基线方法。这些结果证明了我们模型ONMIMHC在准确预测MHC-I和MHC-II分子之间的肽MHC结合后的优势。凭借其出色的准确性和预测能力,我们的模型不仅在一般的预测任务中出色,而且在预测新抗原针对特定癌症类型的新抗原方面也取得了显着的结果。特别是对于子宫菌群子宫内膜癌(UCEC),我们的模型成功地预测了新抗原,对普通人类等位基因具有很高的结合概率。这一发现对于开发针对UCEC的个性化肿瘤疫苗非常重要。
● 提高 BDNF 水平的最佳持续时间:长时间(约 40 分钟)中强度至高强度运动(至少达到最大心率的 65%)对年轻健康男性的 BDNF 水平影响最大,比运动前高出近三分之一。然而,在大多数研究中,30 分钟的运动相对常见,似乎足以引起持续(24 小时)的记忆力改善。● 短期飙升,长期影响:运动后 BDNF 水平的上升是短暂的,通常在运动后不到一小时。然而,长期影响是相当大的,动物研究表明,运动会增加大脑中的神经发生。 ● 高强度骑行比长时间骑行更能增加 BDNF:六分钟高强度骑行间隔(6 个 40 秒间隔,100% VO2 峰值)使循环 BDNF 的每个指标比长时间低强度骑行(90 分钟,25% VO2 峰值)增加四到五倍。血浆衍生 BDNF 增加四到五倍与血浆乳酸增加六倍相关。● 增强老年人的血浆 BDNF 和脑容量:参加为期六个月的舞蹈课程后,老年人的脑容量在对记忆至关重要的区域增加,血浆 BDNF 水平显着上升。
本文的目的是通过深度增强学习对小鼠大脑的基底神经节功能进行建模。众所周知,基底神经节可以提供带有皮质直接影响运动功能的反馈回路。基底神经节中的大多数神经元都是抑制性或多巴胺能。这类似于加强学习的奖励体系。由于几乎不可能对基底神经节的整个应用进行建模,因此本文将重点介绍在迷宫的应用程序中对基底神经节进行建模,其中鼠标在迷宫中,并且需要找到“一块奶酪”(奖励)。这种现实世界的测试通常是在小鼠上进行的,并很好地展示了如何通过增强学习,通过奖励模仿学习[1]。在这种情况下,将在模拟动作方面抽象出其他相关领域(如感觉皮层和运动皮层)的功能和建模。总体而言,通过增强学习对基础神经节的关键功能将是其在行动选择和学习中的用途。
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摘要 表皮生长因子 (EGF) 可诱导非肿瘤大鼠肾成纤维细胞在细胞培养中发生转化表型,这些转化表型是从成年小鼠的许多非肿瘤组织(包括颌下腺、肾脏、肝脏、肌肉、心脏和大脑)中分离出来的。它们与之前描述的从肿瘤细胞中分离出来的转化生长因子 (TGF) 类似,具体如下:它们可通过酸/乙醇提取,并且是酸稳定的低分子量 (6000-10,000) 多肽,需要二硫键才能起作用,并且它们会导致非肿瘤指示细胞的锚定非依赖性生长,而这些细胞在没有它们的情况下不会在软琼脂中生长。从雄性小鼠的颌下腺中对这些 TGF 进行部分纯化,结果表明它们不同于 EGF。与之前描述的细胞外 TGF 不同,但与来自肿瘤细胞的某些细胞 TGF 一样,它们通过 EGF 增强其促进锚定非依赖性生长的能力。颌下腺 TGF 蛋白的等电点接近中性。在 Bio-Gel P-30 上进行色谱分析,然后进行高压液相色谱分析,总纯化率达到 22,000 倍。在 EGF 存在下进行测定时,最纯化的蛋白质在 1 ng/ml 的软琼脂中具有诱导生长的活性。这些数据进一步证明了肿瘤形成可能是由非肿瘤生化过程的定量而非定性改变引起的。我们最近描述了 (1) 从几种肿瘤小鼠组织(包括由莫洛尼肉瘤病毒 (MSV) 转化的成纤维细胞和最初由化学致癌物诱导的可移植膀胱癌)中分离和表征一组低分子量、酸稳定性多肽(称为转化生长因子 (TGF))。这些多肽是可通过酸/乙醇提取的细胞内蛋白质。类似的细胞外转化多肽,称为肉瘤生长因子 (SGF),是由 De Larco 和 Todaro (2) 从培养的 MSV 转化小鼠成纤维细胞的条件培养基中首次分离出来的。最近报道了几种其他细胞外转化多肽,它们来源于人类 (3) 和动物 (4) 来源的肿瘤细胞。所有这些多肽在应用于培养的未转化、非肿瘤指示细胞时都会引起以下一系列变化,这些变化为 TGF 提供了一个操作性定义:(i) 单层细胞密度依赖性生长抑制的丧失;(ii) 单层细胞过度生长;(iii) 细胞形状改变,导致指示细胞呈现肿瘤表型;(iv) 获得锚定独立性,从而能够在软琼脂中生长。未转化的非肿瘤细胞不会在软琼脂中形成逐渐生长的菌落,并且培养细胞的这种不依赖锚定的生长特性与体内肿瘤的生长具有特别高的相关性(5-7)。
基于石墨烯的2D纳米材料具有独特的物理化学特征,可以在各种生物医学应用中使用,包括化学治疗剂的运输和表现。在多形胶质母细胞瘤(GBM)中,肿瘤内施用的薄石墨烯氧化石墨烯(GO)纳米片在整个肿瘤体积中表现出广泛的分布,而不会影响肿瘤生长,也不会扩散到正常的脑组织中。这种肿瘤内定位和分布可以为GBM微环境的治疗和调节带来多种机会。在这里,描述了原位GBM小鼠模型中GO纳米片分布的动力学,并利用薄GOETEs作为平台的一种新颖的纳米纳米化学化学治疗方法,可用于非共价复杂的蛋白酶体抑制剂bortezomib(BTZ)。通过GO的表征:BTZ复合物,在体外持续的BTZ生物学活性在GO表面上的高负载能力。在体内,与两种原位GBM小鼠模型中的游离药物相比,BTZ复合物的单个小量内给予:BTZ复合物显示出增强的细胞毒性效应。这项研究提供了证据表明,薄和小的Goets通过在本地增加生物利用药物浓度而成为GBM治疗的纳米级平台的潜力,从而提高了治疗性的影响。
本研究的重点是通过集成区块链技术来提高电子商务供应链的透明度和信任。这在区块链中非常重要,因为有必要保护,记录,验证,验证和共享多个各方的数据,以确保透明度和信任。为了实现这一目标,我们介绍了称为基于区块链的NSGA III-GKM的先进组合技术。遗传K-均值聚类(GKM)和非主导的分类遗传算法(NSGA-III)是两种高级算法,结合了以新颖方式使用的高级区块链技术来实现这一目标。区块链系统会产生大量的复杂数据,因此确定有意义的模式和趋势很重要。NSGA III和GKM解决了区块链的这些问题。本研究使用NSGA III来解决多个目标的问题,例如提高信任,透明度和运输成本降低。通过使用NSGA,有效地确定了最佳解决方案,可以平衡这些具有挑战性的目标。同时,GKM通过微调分类为类似群集的数据点来改善分组过程。这有助于确定基于区块链的供应链数据中的特定趋势。通过结合这些方法,我们能够改善电子商务供应链中的趋势和行动机制。这些合并的方法协助公司确定有效的供应链策略,这有助于最大程度地降低风险,并能够调整不断变化的区块链系统。来自电子商务供应链的现实世界数据用于测试该方法的功效。根据调查结果,成功地展示了各种目标之间的平衡,并提供了改善区块链驱动的供应链网络的建议。总体而言,通过将区块链与NSGA III和GKM相结合,它不仅可以确保安全性和信任,而且还利用高级分析来提高透明度和运营效率。因此,它将帮助组织实现弹性有效的供应链管理。
两种 OGG1 调节剂均减少了 KBrO 3 诱导的 AP 位点(图 2G),我们发现 TH5487 的 DNA 链断裂(γH2AX)更少(图 2H),表明 OGG1 糖基化酶活性受损会导致 AP 位点数量减少。相反,我们发现 TH10785 的 DNA 链断裂(γH2AX)更多(图 2H),证实 TH10785 在细胞中的催化活性会导致 DNA 链断裂。总之,这些结果表明 TH10785 激活的 OGG1 具有新的细胞作用,即比 8-oxoG 更倾向于 AP 位点。接下来,我们测试了 TH10785 在细胞中诱导 β,δ 消除的程度。我们假设同时刺激 β,δ-消除和阻断 PNKP1 活性应会使系统因未修复的 DNA 单链断裂而超载(图 1A)。因此,在单独暴露于 OGG1 抑制剂或激活剂(图 3A、图 S26)和类似化合物(表 S6 和图 3B)或与 PNKP1i 联合使用的 U2OS 细胞中,使用标记物 γH2AX 和 53BP1 通过 IF 测量 DDR。我们发现 PNKP1 抑制剂只有与引起体外 β,δ-裂解酶活性的 OGG1 激活剂联合使用时才会诱导强 DDR。为了评估这种因果关系,我们使用 RNA 测序监测转录变化,发现 PNKP1i 与 TH10785 联合使用(而非单独使用)会诱导识别和修复 DNA 双链断裂的关键参与者的转录显着上调(图 3C)。此外,TH10785 与 PNKP1 抑制相结合时细胞活力降低,但 TH5487 则不会降低(图 3D 和 3E)。这些结果表明,TH10785 激活 OGG1 β,δ-裂解酶活性在体外和细胞内均会发生,并且 PNKP1 对于避免 DNA 损伤的积累和随之而来的细胞死亡至关重要。总之,我们提出了一种新概念,即通过酶导向的小分子催化剂诱导 OGG1 β,δ-裂解酶活性,结合到酶的活性位点(图 3F、S27 和 S28)。TH10785 的存在引起的新催化功能更倾向于 AP 位点而不是 8-oxoG,并在体外和细胞内产生 PNKP1 依赖性。改善或重新规划处理氧化性DNA损伤的修复途径对许多疾病(如炎症、癌症、阿尔茨海默氏症或衰老)具有重要意义,这里概述的概念允许以新的方式控制和重新规划修复途径(24)。
方法 研究设计为国际多队列合作。使用 Logistic 回归比较 2012 年 1 月 1 日后开始使用整合酶链转移抑制剂 (INSTI)、当代非核苷逆转录酶抑制剂 (NNRTI) 或加强蛋白酶抑制剂 (PI/b) 和两种核苷(酸)开始 ART 后 12 3 个月的病毒学和免疫学结果。综合治疗结果 (cTO) 将成功定义为 VL < 200 HIV-1 RNA 拷贝/mL,没有改变治疗方案,也没有艾滋病/死亡事件。免疫学成功定义为 CD4 计数 > 750 细胞/ l L 或增加 33%,而基线 CD4 计数为 ≥ 500 细胞/ l L。泊松回归比较了临床失败(开始 ART 后 ≥ 14 天的艾滋病/死亡)。确定了每个终点的 ART 类别与年龄、CD4 计数和 VL 之间的相互作用。
摘要:锂的需求预计在十年末之前将四倍。没有新的生产来源,供需曲线有望倒转。传统的地质储量将无法满足预期的差距,因此需要利用锂的非常规来源,为激烈的竞争奠定了基础,这可能是能源过渡所需的最挑战的矿产资源。直接锂提取是指为从非常规来源获取锂的技术的伞。电化学提取与可再生能源相结合时的选择性和低工作成本提供了巨大的希望。本综述旨在描述材料和过程设计考虑因素,用于从水源中电化学提取锂,并在我们的研究小组中专门强调ζ-V 2 o 5作为插入宿主。我们指出了基于长度尺度材料设计的电化学锂提取的能力和选择性的特定策略。策略范围从插入宿主的现场选择性修改到多孔电极体系结构中离子扩散途径的受控曲折。从非常规来源提取的电锂锂提取,即与清洗废水,氢产生和辅助关键金属的恢复相结合时,可以成为可持续经济的关键。
