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getphylo：快速自动生成多洛克斯系统发育树
抽象背景：基因组数据的增加数量呼吁工具可以快速有效地产生基因组规模的系统发育。现有工具依赖于大型参考数据库或需要长长的从头计算来识别直系同源物，这意味着它们的运行时间很长，并且在分类学范围上受到限制。为了解决这个问题，我们创建了GetPhylo，这是一种从注释序列中快速生成系统发育树的python工具。结果：我们提出了GetPhylo（Ge nbank t o phylo Geny），该工具会自动从一个带注释的基因组中构建系统发育树。直系同源物是通过最大可能性的所有编码序列的串联比对来推断系统发育的。我们对两种现有工具AutoMlst和gtdb-tk进行了彻底的Get-Phylo基准测试，以表明它可以在很短的时间内生产出可比质量的树。我们还展示了在包括细菌和真核基因组以及生物合成基因簇在内的四个案例研究中Getphylo的屈曲。结论：GetPhylo是一种自动产生基因组规模系统发育树的快速可靠工具。getPhylo可以在很短的时间内产生与其他软件相当的系统发育，而无需大型本地数据库或强烈的计算。getphylo可以从各种数据集中迅速识别直系同源物，无论分类学或基因组范围如何。getphylo的可用性，速度，灵活性使其成为系统发育工具包的宝贵补充。
Zhang，Y.-M。，Jia，Z。和Dunwell，J。M. Orcid：https：//orcid.org/0000-0000-0003-2147-665X，编辑。 （2023）新的多洛克斯GWAS方法的应用
8在英国（英国），22％的人口是粮食不安全的（Butler，2023年）。 9个国家是欧洲收入不平等的最高水平之一（使用GINI系数）（Francis-10 Devine and Orme，2023年），在过去的十年中，对食品银行的依赖性（Trussell Trust，Trussell Trust，11 2022年）。 英国的粮食不安全不安全感并非独特，因为它反映了其他12个国家的情况，即受影响最大的亚人群。 因此，有呼吁将食品13制度转化为改善社会环境可持续性。 Benton等。 （2022）提出了14个政策，以使粮食浪费和供应适合弱势家庭的社会安全网。 尽管英国食品供应链（FSC）中的食物废物含量相对较低，但几乎没有剩余食物16重新分配以供人类消费。 然而，盈余食品再分配（SFR）已成为欧洲许多人的关键食品17。 sfr用于人类消费涉及收集和分配18个盈余食物（否则将用于替代目的或处置的食用食品）向19个组织，社区或个人用于消费（Midgley，2020年）。 因此，它被视为一种“获胜20胜”解决方案，因为它同时解决了食物浪费和食物不安全感，同时挽救了食物的21份能量和营养含量。 它还确保食品生产中产生的经济和环境成本并不徒劳。 但是，为弱势群体优化SFR 25供应链操作的研究是有限的。8在英国（英国），22％的人口是粮食不安全的（Butler，2023年）。9个国家是欧洲收入不平等的最高水平之一（使用GINI系数）（Francis-10 Devine and Orme，2023年），在过去的十年中，对食品银行的依赖性（Trussell Trust，Trussell Trust，11 2022年）。英国的粮食不安全不安全感并非独特，因为它反映了其他12个国家的情况，即受影响最大的亚人群。因此，有呼吁将食品13制度转化为改善社会环境可持续性。Benton等。（2022）提出了14个政策，以使粮食浪费和供应适合弱势家庭的社会安全网。尽管英国食品供应链（FSC）中的食物废物含量相对较低，但几乎没有剩余食物16重新分配以供人类消费。然而，盈余食品再分配（SFR）已成为欧洲许多人的关键食品17。sfr用于人类消费涉及收集和分配18个盈余食物（否则将用于替代目的或处置的食用食品）向19个组织，社区或个人用于消费（Midgley，2020年）。因此，它被视为一种“获胜20胜”解决方案，因为它同时解决了食物浪费和食物不安全感，同时挽救了食物的21份能量和营养含量。它还确保食品生产中产生的经济和环境成本并不徒劳。但是，为弱势群体优化SFR 25供应链操作的研究是有限的。因此，有效的SFR可以有助于实现联合国（UN）23可持续发展目标（SDG）2（零饥饿），12（负责消费和生产，24个，尤其是目标12.3（减半食物浪费）和13（气候行动）。
Zhang，Y.-M。，Jia，Z。和Dunwell，J。M. Orcid：https：//orcid.org/0000-0000-0003-2147-665X，编辑。 （2023）新的多洛克斯GWAS方法的应用 冲击途径：解开混合食品供应链 对整个生命周期中蘑菇对情绪和神经认知健康的影响的评论 气候变化和美国ESG的政治化 哺乳动物大脑和体型的共同进化动力学 Wolbachia优势影响Culex Quinquefasciatus Microbiota 了解建筑项目中材料采购的复杂性，以建立一个影响MSMES供应链管理的概念框架 透视图：利用肠道微生物群预测对饮食，益生元和益生菌干预措施的个性化反应 Lynn，S。C.，Dunwell，J。M. Orcid：https：//orcid.org/0000-0000- 0003-2147-665X，Whitehouse，A。B.和Cockerton，H。M.（2024）与相关的基因上 定期消费小米对禁食和发布的影响... 神经发育过程中结构性大脑不对称的大规模分析：4265名儿童和青少年的年龄和性别的关联 在CMIP6模型的不同SSP方案下，印度的热浪及其未来预测 Hunt，K。M. R. Orcid：https：//orcid.org/0000-0000-0003-1480-3755和Harrison，S。P. Orcid：https：//orcid.org/0000-0000-0000-0000-0000-1903（2025） 热遥感的实用性用于评估高... 基于花粉的全新世气候趋势的重建 DIV AI模型比物理学更好的天气预测...
GWAS方法的演变可以分为三个阶段：单标记分析的初始阶段（Risch和Merikangas，1996），其次是基于混合模型的方法的出现（Zhang等，2005; Yu等，2006; Yu等，2006; Kang等，2008; Kang et an。 Stephens，2012;当前，广泛使用了快速的单基因组基因组扫描和多基因座的两步方法。但是，拥护者倾向于混合模型加机器学习方法，例如3VMRMLM（Li等，2022），因为他们在控制所有多基因背景的同时全面考虑了所有效果。在大多数方法中，标记基因型QQ，QQ和QQ通常分别编码为2、1和0，表明它们在随机交配种群中的繁殖值。在这种情况下，要估计的参数是等位基因替代效应（a），控制
氧化石墨烯作为观赏和遗产多洛斯酮的抗染色涂层的性能研究
对石记的持续性的关注深深地根深蒂固。但是，尽管在这个领域进行了尝试，但仍需要大量的效果来实现观赏石的保护。侵蚀剂，例如雨水，极端温度以及化学和生物制剂，威胁着我们的石材遗产，并逐渐磨损世界各地发现的建筑物，雕塑和其他古迹。石灰石和多洛酮在整个历史上都广泛使用，鉴于它们的易于提取和可行性。尽管如此，这些特性使它们特别容易受到上述侵蚀剂的影响，目前，主要解决方案是昂贵且耗时的恢复。鉴于有效和耐用的药物无法防止观赏和遗产石的恶化，并且由于氧化石墨烯（GO）最近在此任务上表现出了令人印象深刻的效果，因此这项工作将进一步探索GO作为Monumental Dolostone的保护性涂层的生存能力。为此，将GO通过没有佐剂的水分散剂喷洒在多洛酮表面上。根据热应力，光学检查（结构光3D扫描仪），比色法，渗滤液分析和电子显微镜评估涂料性能。主要结果表明，喷涂的覆盖在石材表面上会产生高度保护性和耐用的屏障，而不会改变其美学品质。
多洛雷斯峡谷太阳能道路使用计划
与该项目使用县道路有关，该公司将与道路与桥梁部协调，以最大程度地减少道路损失以及旅行延误。应由于施工期间的项目影响而造成急性损害，该公司将评估损坏，与道路和桥梁部的协调，并在必要时尽快进行维修。在开始此类工作之前，将获得所有必要的多洛雷斯县（Dolores County）的工作许可，以维持受项目影响的县道网络。
多洛雷斯峡谷太阳能 – 抑尘计划
简介 juwi Inc. 是 Dolores Canyon Solar LLC（“公司”）和 JSI Construction Group LLC（juwi 的建筑部门）的母公司，是一家位于科罗拉多州博尔德的公用事业级太阳能开发、工程、采购、施工、运营和维护公司。公司期待与 Dolores 县合作，批准在卡霍恩东北几英里的数百英亩土地上建造 110 兆瓦/交流的 Dolores Canyon Solar 设施（“项目”），该设施位于县道 15 和 M.4 的交叉口附近。公司是全国各地太阳能农场的建造者，在科罗拉多州和西部拥有超过 12 年的经验，在施工前、施工期间和施工后管理太阳能农场的干旱和半干旱景观。该计划讨论了如何管理项目表面，以最大限度地减少灰尘的潜在影响并保护公众健康和安全。根据科罗拉多州 25 英亩以上项目的标准，将获得土地开发空气污染物排放通知（“APEN”）。项目施工阶段产生的粉尘可能最多；但是，项目运营阶段也得到了解决。计划目的 多洛雷斯县土地使用条例第四条第 2(F)(1) 款规定，新开发或土地使用变更必须考虑粉尘的滋扰，因为粉尘会对周围的业主产生不利影响。本计划旨在规定管理施工和运营活动产生的扬尘的方法。由于施工期间自然路面县级公路上的卡车交通量较大，且项目现场的建筑活动较多，因此本项目施工阶段产生粉尘的可能性将高于运营阶段。在运营阶段，由于交通量低，且无植被表面面积很少（如果有的话），因此项目产生的粉尘将很少。 项目描述 该项目将包括一个太阳能光伏发电设施。项目区域内的部分表面将被平整，以形成适合太阳能电池板阵列的一致表面地形。该项目将包括一条架空输电线，通往电网互连变电站——三州发电与输电协会拥有的卡霍恩变电站。整个项目围栏面积约为 800 英亩。
多洛雷斯峡谷太阳能 – 退役计划
简介 Dolores Canyon Solar LLC（“公司”）是总部位于博尔德的太阳能开发商 juwi Inc. 的子公司，该公司期待与多洛雷斯县携手合作，在卡霍恩东北几英里、靠近 15 号和 M.4 号县道交叉口的数百英亩土地上建设 110 兆瓦/交流的 Dolores Canyon Solar 发电厂（“项目”）。该公司在全国各地建设太阳能发电场，在科罗拉多州和西部拥有十二年以上的工作经验。计划目的多洛雷斯县土地使用条例（“LUR”）第四条第 2(P) 款规定，必须确保拟议的公用事业项目场地能够恢复到之前的状态，并且该县不会因此受到财务负担。该计划的目的是概述太阳能设施在项目使用寿命结束时（估计为投入使用后 35 年）的退役和土地复垦工作。项目描述 该项目将包括一个太阳能光伏发电设施。大部分围栏项目区域将包含排列在太阳跟踪结构上的太阳能模块。项目区域内的部分表面将被平整，以形成与太阳能电池板阵列一致的表面地形。该项目将包括一条通往三州发电与输电协会拥有的 Cahone 变电站的短架空输电线。整个围栏项目区域大约有 800 英亩。 设施退役 当项目不再用作运营能源设施时，公司将执行退役活动，以移除与项目相关的所有设备和材料，并将财产恢复到施工前的状态。 规划和许可。退役时的政府法规可能要求在现场退役活动之前制定具体计划和许可证。公司将根据此退役计划制定一项综合计划，以便在拆除和回收过程中遵循。公司将确定并获得这项工作所需的所有当地、州和联邦许可证。公司还将在规划阶段确定分包商和废物/回收公司。